| New junction evidence | |||||||||||
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gggTCGGGATACCGCCATGGCGGTGGAGCACCGCCAACAACATGGCCAGACGGTTCTGGTCCAGGCCCAAGGTTACCCGCCGCGGGTTGGCCAGATGGCTATCGCCGACCAGCGCCTGCACCTCGACCAGCATTGGCCGGGTACCCTCCCAGGTTGCCATca < 2:691702/162‑1 (MQ=255) gggTCGGGATACCGCCATGGCGGTGGAGCACCGCCAACAACATGGCCAGACGGTTCTGGTCCAGGCCCAAGGTTACCCGCCGCGGGTTGGCCAGATGGCTATCGCCGACCAGCGCCTGCACCTCGACCAGCATTGGCCGGGTACCCTCCCAGGTTGCCATca > 1:691705/1‑162 (MQ=255) gTCGGGATACCGCCATGGCGGTatcccgacccatgaccaggatgtgtttctcaacgtggtcggcggggtgaaggtgctggaaacggcttcggacctggccctgctggcggcggtgatgtcgagcttgcgcaaccggccactggcccatggtttgctggtgtttggcgagatcggattgtcgggcgaggtacgccc > 2:992674‑M1/1‑22 (MQ=255) gTCGGGATACCGCCATGGCGGTGGAGCACCGCCAACAACATGGCCAGACGGTTCTGGTCCAGGCCCAAGGTTACCCGCCGCGGGTTGGCCAGATGGCTATCGTCGACCAGCGCCTGCACCTCGACCAGCATTGGCCGGGTACCCTCCCAGGTTGCCATCACCACGCTa < 2:1061586/168‑1 (MQ=255) gTCGGGATACCGCCATGGCGGTGGAGCACCGCCAACAACATGGCCAGACGGTTCTGGTCCAGGCCCAAGGTTACCCGCCGCGGGTTGGCCAGATGGCTATCGTCGACCAGCGCCTGCACCTCGACCAGCATTGGCCGGGTACCCTCCCAGGTTGCCATCACCACGCTa > 1:1061589/1‑168 (MQ=255) gTCGGGATACCGCCATGGCGGTGGAGCACCGCCAACAACATGGCCAGACGGTTCTGGTCCAGGCCCAAGGTTACCCGCCGCGGGTTGGCCAGATGGCTATCGTCGACCAGCGCCTGCACCTCGACCAGCATTGGCCGGGTACCCTCCCAGGTTGCCATCACCACGCTACCCGGCACCTCTTCCTGGGTACGGTTGAGGAAGATCGCCGAc < 2:486044/210‑1 (MQ=255) tACCGCCATGGCGGTGGAGCACCGCCAACAACATGGCCAGACGGTTCTGGTCCAGGCCCAAGGTTACCCGCCGCGGGTTGGCCAGATGGCTATCGTCGACCAGCGCCTGCACCTCGACCAGCATTGGCCGGGTACCCTCCCAGGTTGCCATCACCACGCTACCCGGCACCTCTTCCTGGGTACGGTTGAGGAAGATCGCCGACGGGTTGGATACCTCCTTGAGGCCACGATCGGTc > 1:695278/1‑236 (MQ=255) cGCCAGGGCGGTGGAGCACCGCCAACAACATGGCCAGACGGTTCTGGTCCAGGCCCAAGGTTACCCGCCGCGGGTTGGCCAGATGGCTATCGTCGACCAGCGCCTGCACCTCGACCAGCATTGGCCGGGTACCCTCCCAGGTTGCCATCACCACGCTAc < 1:196401/159‑1 (MQ=255) cctGGCGCTGGAGCACCGCCAACAACATGGCCAGACGGTTCTGGTCCAGGCCCAAGGTTACccggcg > 2:576149/3‑67 (MQ=255) gCGGTatcccgacccatgaccaggatgtgtttctcaacgtggtcggcggggtgaaggtgctggaaacggcttcggacctggccctgctggcggcggtgatgtcgagcttgcgcaaccggccactggcccatggtttgctggtgtttggcgagatcggattgtcgggcgaggtacgcccggtacccagtggccagga > 1:369893‑M1/1‑5 (MQ=255) gCGGTGGAGCCCCGCCAACACCATGGCCAGACGGTTCTGGTCCAGGCCCAAGGTTCCCCGCCGCGGGTTGGCCAGATGGCTATCGTCGACCAGCGCCTGCACCTCGACCAGCATTGGCCGGGTACCCTCCCAGGTTGCCATCACCACGCTACCCGGCACCTCTTCCTggg < 1:339070/170‑1 (MQ=255) cGGTGGAGCACCGCCAACAACATGGCCAGTCGGTTCTGGTCCAGGCCCAAGGTTACCCGCCGCGGGTTGGCCAGATGGCTATCGTCGACCAGCGCCTGCACCTCGACCAGCATTGGCCGGGTACCCTCCCAGGTTGCCACCACCACGCCACCCGGCACCCCTTc > 2:1061856/1‑164 (MQ=255) | CCGTGCTTGGCCGCTTCCTTCAAGCGCTCCTGGCCACTGGGTACCGGGCGTACCTCGCCCGACAATCCGATCTCGCCAAACACCAGCAAACCATGGGCCAGTGGCCGGTTGCGCAAGCTCGACATCACCGCCGCCAGCAGGGCCAGGTCCGAAGCCGTTTCCAGCACCTTCACCCCGCCGACCACGTTGAGAAACACATCCTGGTCATGGGTCGGGATACCGCCATGGCGGTGGAGCACCGCCAACAACATGGCCAGACGGTTCTGGTCCAGGCCCAAGGTTACCCGCCGCGGGTTGGCCAGATGGCTATCGTCGACCAGCGCCTGCACCTCGACCAGCATTGGCCGGGTACCCTCCCAGGTTGCCATCACCACGCTACCCGGCACCTCTTCCTGGGTACGGTTGAGGAAGATCGCCGACGGGTTGGATACCTCCTTGAGGCCACGATCGGTC > AE015451/5269080‑5269532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |