New junction evidence | |||||||||||
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TCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGAATCAGCGTGACCTTGGCCGGGTCAGGCCGCTGAGCCAGAAACTCAGGCCACAAAGCGA > AE015451/4974‑5442 | tCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCg > 1:1072330‑M2/1‑235 (MQ=255) tAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCggcgg > 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ttGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCggcgggcgcgggagagc > 1:1037908‑M2/1‑218 (MQ=255) gTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCa > 1:73330/1‑234 (MQ=255) cTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCa < 1:941969/236‑1 (MQ=255) 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tGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGccc < 1:322513/236‑1 (MQ=255) gCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCggcgggcgcgggagagcttctggctgagga < 2:789316‑M2/169‑31 (MQ=255) gCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCggcgggcgcgggagagcttctggctgagga > 1:789319‑M2/1‑139 (MQ=255) gCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGgc < 1:638530/236‑1 (MQ=255) 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ccccAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGgc < 1:677718/222‑1 (MQ=255) cccAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCt > 2:729020/1‑154 (MQ=255) cccAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGCTGGTcccg > 2:603846/1‑188 (MQ=255) gcgcATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCggcgggcgcgggagagcttctggctgagga > 2:805922‑M2/1‑120 (MQ=255) 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GCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACGCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGcc > 1:235715‑M1/1‑152 (MQ=255) CCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGccctgtttc < 2:752409‑M1/158‑4 (MQ=255) aaGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTG‑AGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCtt > 1:1030049/1‑235 (MQ=255) tCAAGTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCttgttg < 1:703054/236‑1 (MQ=255) aaTGGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGc < 1:230180/235‑1 (MQ=255) aTTGCGAACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCggcgggcgcgggagagcttctggctgaggacttacgccaggcacagcatgcgctgggggagatcacaggagcattcagctcggatgacctgcttgggcggattttctccagcttct > 1:733786‑M2/1‑60 (MQ=255) ttGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACAt < 2:302867/176‑1 (MQ=255) gtaGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGgc < 2:527396/153‑1 (MQ=255) gAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGAATc > 1:502455/1‑236 (MQ=255) tGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGCATCAGCGTGAc > 1:214523/1‑233 (MQ=255) gCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTAccc < 2:888604/192‑1 (MQ=255) tCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCg > 1:850325/1‑218 (MQ=255) tCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCGGAAGCGACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTGGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGgcgc < 2:383461/142‑1 (MQ=255) cAGGTGCTCGCGGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGACGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGc < 1:60642/215‑1 (MQ=255) gCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAg > 2:593094/1‑175 (MQ=255) tCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGcc < 1:867152/201‑1 (MQ=255) gCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGAATCAGCGTGACCTTGGCCGGGTCAGGcc < 1:948475/236‑1 (MQ=255) ctggcctggcGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGAATCAGCGTGACCTTGGCCGGGTCAGGcc < 1:423030/235‑1 (MQ=255) ctggcctggcGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGAATCAGCGTGACCTTGGCCGGGTCAGGCCg > 1:903026/1‑236 (MQ=255) ctggcctggcGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGCTCACATGGCCGTCATCGCACTGtt < 1:1045820/166‑1 (MQ=255) ctggcctggcGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACCCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTcac < 2:920062/184‑1 (MQ=255) tggcctggcGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGAATCAGCGTGACCTTGGCCggg < 2:489230/227‑1 (MQ=255) tggcGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCa < 1:381895/184‑1 (MQ=255) ggcGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGAATCAGCGTGACCTTGGCCGGGTCAGGCCGCTGAGc > 1:893635/1‑235 (MQ=255) gcAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTG‑AGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGAATCAGCGTGACCtt < 2:1030046/210‑1 (MQ=255) cATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGt > 2:626647/1‑149 (MQ=255) cATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGAATCAGCGTGACCTTGGCCGGGTCAGGCCGCTGAGCCAGAAACt > 1:184206/1‑234 (MQ=255) aTGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTAccc < 2:255456/155‑1 (MQ=255) tccGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATTCAGCCTGTCAGATGGTCACGTAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATc < 2:894338/129‑1 (MQ=255) ccGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCa < 1:63572/44‑1 (MQ=255) ccGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCa > 2:63570/1‑44 (MQ=255) ccGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGAATCAGCGTGACCTTGGCCGGGTCAGGCCGCTGAGCCAGAAACTCAGGCCACAAAGCGa > 1:463097/1‑236 (MQ=255) | TCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCAGGTCGGCCTTGTTGCGAATCAGCGTGACCTTGGCCGGGTCAGGCCGCTGAGCCAGAAACTCAGGCCACAAAGCGA > AE015451/4974‑5442 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |