New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 608871 = | 78 (1.350) | 4 (0.070) | 4/328 | NT | 5.3% | coding (742/813 nt) | PP_0524 | putative Periplasmic cobalamin‑binding protein HutB |
? | AE015451 | 608902 = | 68 (1.230) | coding (773/813 nt) | PP_0524 | putative Periplasmic cobalamin‑binding protein HutB |
GTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTAGCCTGCAATGG > AE015451/608670‑609116 | ggcatcgtgggcctgcgcggaagctgggtagcaagccgcgagcttacgctcgacctgaagctggacaacctgctgggaaagcagtacagccgcgtccactacaaccaccagggcaacgactacggctatcgcgaagaaagacgcacttggctcttgagcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaagcgggcggtggcttcgatcatctgcccgcttg < 1:415892‑M2/2‑1 (MQ=255) ggggCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCtt > 1:780309/1‑227 (MQ=255) gggCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTg < 1:1062567/236‑1 (MQ=255) ggCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTg > 1:759263/1‑235 (MQ=255) cgcgcAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTg > 1:655701/1‑236 (MQ=255) cgcgcAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTg > 1:644414/1‑236 (MQ=255) gcgcAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTg > 1:641372/1‑235 (MQ=255) aaTGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGtt > 2:777720/1‑227 (MQ=255) aTGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGAc > 1:618754/1‑233 (MQ=255) aagctgggtagcaagccgcgagcttacgctcgacctgaagctggacaacctgctgggaaagcagtacagccgcgtccactacaaccaccagggcaacgactacggctatcgcgaagaaagacgcacttggctcttgagcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaagcgggcggtggcttcgatcatctgcccgctTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAg < 1:691150‑M2/24‑1 (MQ=255) gACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGgt < 1:1035015/236‑1 (MQ=255) ttGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAAGGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTa < 1:693733/222‑1 (MQ=255) tGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTtgtgt < 1:57756/205‑1 (MQ=255) tGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCa > 1:692766/1‑236 (MQ=255) aggTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAgcg < 1:328366/201‑1 (MQ=255) tGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTtgtgt < 2:1038418/181‑1 (MQ=255) gagTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTTGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAgcg < 2:466651/198‑1 (MQ=255) ccGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAgcgc > 2:527446/1‑195 (MQ=255) ccGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGgtgt > 2:913668/1‑201 (MQ=255) ccGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGtctttct > 1:378779/1‑235 (MQ=255) ccGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGtcttgct > 1:718935/1‑235 (MQ=255) tgctgctgcGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAgcg < 1:809638/191‑1 (MQ=255) gctgctgcGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCaa > 1:775799/1‑212 (MQ=255) ctgcGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAg < 1:969999/236‑1 (MQ=255) cGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCg > 1:17493/1‑236 (MQ=255) tCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCCGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTtgtgtg > 2:311360/1‑158 (MQ=255) aGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTc > 2:925190/1‑193 (MQ=255) 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(MQ=255) ggCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGc > 2:551408/1‑214 (MQ=255) cTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAGGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGtt > 2:157481/1‑142 (MQ=255) tgatgaGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAgg < 2:173222/169‑1 (MQ=255) ctgaGGCGCAACTGGCCAGCTGCAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCCGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTa < 2:906344/149‑1 (MQ=255) atgaGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTTGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTgg < 1:486187/235‑1 (MQ=255) atgaGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCtggt < 2:455712/224‑1 (MQ=255) aGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGAc > 2:1035496/1‑234 (MQ=255) ggCGCAACTGGCCAGCTGGAGGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCTACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAg < 2:278734/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTttcttc < 2:1082321/188‑1 (MQ=255) cTGGCCGGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAg < 2:132539/155‑1 (MQ=255) ggCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCAGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTCGTGGACGCGGCTGTACt > 1:666044/1‑235 (MQ=255) gactacggctatcgcgaagaaagacgcacttggctcttgagcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaagcgggcggtggcttcgatcatctgcccgctTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCt < 1:1047572‑M2/45‑1 (MQ=255) 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1:1063732/177‑1 (MQ=255) cAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCACGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAg > 1:225477/1‑235 (MQ=255) ttCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCt > 2:799523/1‑233 (MQ=255) tCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAg < 1:642961/165‑1 (MQ=255) cGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCa > 2:986479/1‑234 (MQ=255) ggCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCGGGTGGTGCCGGCCAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTc < 1:185782/236‑1 (MQ=255) agcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTc < 1:1047572‑M1/115‑1 (MQ=255) agcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTc > 2:1047569‑M1/46‑160 (MQ=255) gggCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTc < 1:19839/235‑1 (MQ=255) tgctgGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCt < 1:475704/79‑1 (MQ=255) tgctgGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCt > 2:475701/1‑79 (MQ=255) ggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGCGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAg < 1:258373‑M1/107‑1 (MQ=255) gctgGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGc > 1:1041429/1‑236 (MQ=255) ctgGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGc < 1:330301/235‑1 (MQ=255) gtgCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGAcgcg > 2:1047542/1‑169 (MQ=255) ctttagcgtccagcaacgcacacaAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCtt < 1:691150‑M1/212‑1 (MQ=255) cTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCGGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGccc < 1:745162/236‑1 (MQ=255) ccccAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGcc < 1:777723/236‑1 (MQ=255) ccAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGtt < 2:296829/168‑1 (MQ=255) caAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGcc < 1:415892‑M1/232‑1 (MQ=255) CGGGCCGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAg > 1:819234‑M1/1‑176 (MQ=255) CGGGCAGATGCTCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGc > 1:1082241‑M1/1‑220 (MQ=255) GGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTAGCCt > 1:167108‑M1/1‑236 (MQ=255) GGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTAGCCt > 2:641369‑M1/1‑236 (MQ=255) GGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTAGCCt > 1:690812‑M1/1‑235 (MQ=255) GCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAg > 1:419142‑M1/1‑173 (MQ=255) aGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTAGCCTg > 2:707580/1‑233 (MQ=255) atgatCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGAtt > 1:268220/1‑220 (MQ=255) tgatCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTAGCCTGCAATgg > 1:680997/1‑236 (MQ=255) tgatCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTCCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGATTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTAGCCTGCAATgg > 1:1026616/1‑236 (MQ=255) atCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTAGCCTGCAATgg < 2:680994/234‑1 (MQ=255) gCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAg < 2:907494/89‑1 (MQ=255) tgtgtgCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAg < 1:43291/178‑1 (MQ=255) | GTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTAGCCTGCAATGG > AE015451/608670‑609116 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |