New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | 665413 = | 64 (1.110) | 4 (0.070) | 4/328 | NT | 6.1% | coding (2279/4902 nt) | yfhM | lipoprotein of unknown function |
? | AE015451 | 665429 = | 62 (1.120) | coding (2295/4902 nt) | yfhM | lipoprotein of unknown function |
CAGCTTCCAGGTTGAGTGGGGCCCGTACCGCGTCGAGGTCGAAGACCCGCAGACCGGTCTGGTGTCCAGTGAGCGCTTCTGGGCCGGCTACCGTGCCCAGGACAACGCTGAGGGCGGCGCGGTGCGGCCGGACCAGGTCAAGCTGGCGCTGGACAAACCCTCCTACACCGATGGCGCTACCGCCAAGGTCACCGTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATCAGCGCGTTGGTTATCCGCCCTGGTGAGCGCAAGGCCAATGCCACGCCCAAGCGCGCCGTGGGCGTGCTGCACCTGCCGCTGGACCGCGCCGAGCGCAAGC > AE015451/665210‑665649 | cAGCTTCCAGGTTGAGTGGGGCCCGTACCGCGTCGAGGTCGAAGACCCGCAGACCGGTCTGGTGTCCAGTGAGCGCTTCTGGGCCGGCTACCGTGCCCAGGACAACGCTGAGGGCGGCGCGGTGCGGCCGGACCAGGTCAAGCTGGCGCTGGACAAACCCTCCTACACCGATGGCGCTACCGCCAAGGTCACCGTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAg > 1:695218/1‑235 (MQ=255) ggggCCCGTACCGCGTCGAGGTCGAAGACCCGCAGACCGGTCTGGTGTCCAGTGAGCGCTTCTGGGCCGGCTACCGTGCCCAGGACAACGCTGAGGGCGGCGCGGTGCGGCCGGACCAGGTCAAGCTGGCGCTGGACAAACCCTCCTACACCGATGGCGCTACCGCCAAGGTCACCGTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCt > 1:441730/1‑235 (MQ=255) aCCGCGTCGAGGTCGAAGACCCGCGGACCGGTCTGGTGTCCAGTGAGCGCTGCTGGGCCGGCTACCGTGCCCAGGACAACGCTGAGGGCGGCGCGGTGCGGCCGGACCAGGTCAAGCTGGCGCTGGACAAACCCTCCTACACCGATGGCGCTACCGCCAAGGTCACCGTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTgtggtg < 1:140018/232‑1 (MQ=255) ccGCGTCGAGGTCGAAGACCCGCAGACCGGTCTGGTGTCCAGTGAGCGCTTCTGGGCCGGCTACCGTGCCCAGGACAACGCTGAGGGCGGCGCGGTGCGGCCGGACCAGGTCAAGCTGGCGCTGGACAAACCCTCCTACACCGATGGCGCTACCGCCAAGGTCACCGTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAg > 1:868044/1‑235 (MQ=255) cgTCGAGGTCGAAGACCCGCAGACCGGTCTGGTGTCCAGTGAGCGCTTCTGGGCCGGCTACCGTGCCCAGGACAACGCTGAGGGCGGCGCGGTGCGGCCGGACCAGGTCAAGCTGGCGCTGGACAAACCCTCCTACACCGATGGCGCTACCGCCAAGGTCACCGTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGgag < 1:975706/235‑1 (MQ=255) tCGAGGTCGAAGACCCGCAGACCGGTCTGGTGTCCAGTGAGCGCTTCTGGGCCGGCTACCGTGCCCAGGACAACGCTGAGGGCGGCGCGGTGCGGCCGGACCAGGTCAAGCTGGCGCTGGACAAACCCTCCTACACCGATGGCGCTACCGCCAAGGTCACCGTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATc > 1:438826/1‑236 (MQ=255) cGAGGTCGAAGACCCGCAGACCGGTCTGGTGTCCAGTGAGCGCTTCTGGGCCGGCTACCGTGCCCAGGACAACGCTGAGGGCGGCGCGGTGCGGCCGGACCAGGTCAAGCTGGCGCTGGACAAACCCTCCTACACCGCTGGCGCTACCGCCAAGGTCACCGTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAg > 1:20537/1‑229 (MQ=255) ggcgtggcattggccttgcgctcaccagggcggataaccaacgcgctgatgtacaggtcgtgacgggcccaggccttgtccagttgcacgtcaaaggtcttgccctcggcgggcacatcgatctcctgccaccacagcgggccatcgctggactcgatcatcaggtagccgctgcccgcagcggCTACCtgatg < 2:568032‑M2/10‑1 (MQ=255) aGACCCGCAGACCGGTCTGGTGTCCAGTGAGCGCTTCTGGGCCGGCTACCGTGCCCAGGACAACGCTGAGGGCGGCGCGGTGCGGCCGGACCAGGTCAAGCTGGCGCTGGACAAACCCTCCTACACCGATGGCGCTACCGCCAAGGTCACCGTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCccg < 1:59883/236‑1 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gTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATCAGCGCGTTGGTTATCCGCCCTGGTGAGCGCAAGGc > 2:827158/1‑182 (MQ=255) gTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATCAGCGCGTTGGTTATCCGCCCTGGTGAGCGCAAGGCCAATGCCACGCCCAAGCGCGCCGTGGGCGTGCTGCACCTGCCGCTGGACCgcgc > 1:762040/1‑236 (MQ=255) gTCACTCCACCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATc > 1:589653/1‑147 (MQ=255) catcaggtagCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATCAGCGCGTTGGTTATCCGCCCTGGTGAGCGCAAGGCCAATGCCACGcc < 2:568032‑M1/184‑1 (MQ=255) aCTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATCAGCGCGTTGGTTATCCGCCCt < 2:868041/165‑1 (MQ=255) cgcccgcTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATCAGCGCGTTGGTTATCCGCCCTGGTGAg < 2:369471/167‑1 (MQ=255) cgcccgcTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATCAGCGCGTTGGTTATCCGCCCTGGTGAGCGCAAGGCCAATGCCACGCCCAAGCGCGCCg < 2:694242/198‑1 (MQ=255) cgcccgcTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATCAGCGCGTTGGTTATCCGCCCTGGTGAGCGCAAGGCCAATGCCACGCCCAAGCGCGCCg > 1:694245/1‑198 (MQ=255) gcccgcTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATCAGCGCGTTGGTTATCCGCCCTGGTGAGCGCAAGGCCAATGCCACGCCCAAGCGCGCCGTGGGCGTGCTGCACCTGCCGCTGGACCGCGCCGAgc > 2:654702/1‑233 (MQ=255) GCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATCAGCGCGTTGGTTATCCGCCCTGGTGAGCGCAAGGCCAATGCCACGCCCAAGCGCGCCGTGGGCGTGCTGCACCTGCCGCTGGACCGCGCCGAGCGCAAGc < 1:541881‑M1/235‑1 (MQ=255) | CAGCTTCCAGGTTGAGTGGGGCCCGTACCGCGTCGAGGTCGAAGACCCGCAGACCGGTCTGGTGTCCAGTGAGCGCTTCTGGGCCGGCTACCGTGCCCAGGACAACGCTGAGGGCGGCGCGGTGCGGCCGGACCAGGTCAAGCTGGCGCTGGACAAACCCTCCTACACCGATGGCGCTACCGCCAAGGTCACCGTCACTCCGCCCGCTGCGGGCAGCGGCTACCTGATGATCGAGTCCAGCGATGGCCCGCTGTGGTGGCAGGAGATCGATGTGCCCGCCGAGGGCAAGACCTTTGACGTGCAACTGGACAAGGCCTGGGCCCGTCACGACCTGTACATCAGCGCGTTGGTTATCCGCCCTGGTGAGCGCAAGGCCAATGCCACGCCCAAGCGCGCCGTGGGCGTGCTGCACCTGCCGCTGGACCGCGCCGAGCGCAAGC > AE015451/665210‑665649 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |