| New junction evidence | |||||||||||
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CGCCTGTTGGCCGCTCAGGCGCAGCCAGGTGGGCCAGGCAGCAGGACGTGTGGTGCTGTGCAGCAGCCGTTGGCCATCGAGTCTGGCGCAGGCGGCGGGGTGGCACACCGGGCCGATCCATTCATCGCAGATTTTCTGGCTGTACAGCTGGTTGTCCCAGTGGAAGTCGTCGCGGCGAATTGCCAGGTCGACACCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGTCGCGAGCTTGTTGCTGCAGGCGCTGCACGGCGCCTTCGAGCTGTTCGAAGATCGCCTGGGTGGTGCCTTGCAGGGCACGACCGGCGGGGGTGAGGAAAATGGCCCGGTTGCGGCGTTCGA > AE015451/811646‑812100 | cgcCTGTTGGCCGCTCAGGCGCAGCCAGGTGGGCCAGGCAGCAGGACGTGTGGTGCTGTGCAGCAGCCGTTGGCCATCGAGTCTGGCGCAGGCGGCGGGGTGGCACACCGGGCCGATCCATTCATCGCAGATTTTCTGGCTGTACAGCTGGTTGTCCCAGTGGAAGTCGTCGCGGCGAATTGCCAGGTCGACACCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGt > 1:605497/1‑236 (MQ=255) cTGTTGGCCCCTCAGGCGCAGCCAGGTGGGCCAGGCAGCAGGACGTGTGGTGCTGTGCAGCAGCCGTTGGCCATCGAGTCTGGCGCAGGCGGCGGGGTGGCACACCGGGCCGATCCATTCATCGCAGATTTTCTGGCTGTACAGCTGGTTGTCCCAGTGGAAGTCGTCGCGGCGAATTGCCAGGTCGACACCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGc > 1:714967/1‑235 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ccAGGTGGGCCAGGCAGCAGGACGTGTGGTGCTGTGCAGCAGCCGTTGGCCATCGAGTCTGGCGCAGGCGGCGGGGTGGCACACCGGGCCGATCCATTCATCGCAGATTTTCTGGCTGTACAGCTGGTTGTCCCAGTGGAAGTCGTCGCGGCGAATTGCCAGGTCGACACCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGgtgggtgg < 1:741436/236‑1 (MQ=255) aGGTGGGCCAGGCAGCAGGACGTGTGGTGCTGTGCAGCAGCCGTTGGCCATCGAGTCTGGCGCAGGCGGCGGGGTGGCACACCGGGCCGATCCATTCATCGCAGATTTTCTGGCTGTACAGCTGGTTGTCCCAGTGGAAGTCGTCGCGGCGAATTGCCAGGTCGACACCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGCGGGTGGct > 1:1042100/1‑235 (MQ=255) ggCCAGGCAGCAGGACGTGTGGTGCTGTGCAGCAGCCGTTGGCCATCGAGTCTGGCGCAGGCGGCGGGGTGGCACACCGGGCCGATCCATTCATCGCAGATTTTCTGGCTGTACAGCTGGTTGTCCCAGTGGAAGTCGTCGCGGCGAATTGCCAGGTCGACACCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGa > 1:745851/1‑213 (MQ=255) cagcagGACGTGTGGTGCTGTGCAGCAGCCGTTGGCCATCGAGTCTGGCGCAGGCGGCGGGGTGGCACACCGGGCCGATCCATTCATCGCAGATTTTCTGGCTGTACAGCTGGTTGTCCCAGTGGAAGTCGTCGCGGCGAATTGCCAGGTCGACACCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTc < 2:500611/211‑1 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(MQ=255) gtcgCGGCGAATTGCCAGGTCGACACCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAgcgc > 2:72131/1‑127 (MQ=255) gtcgCGGCGAATTGCCAGGTCGACACCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGTCGCGAGCTTGTTGCTGCAGGCGCTGCACGGCGCCTTCGAGCTGTTCGAAGATCGCCTGGgtggtg > 2:507121/1‑232 (MQ=255) gccagaaaatctgcgatgaatggatcggcccggtgtgccaccccgccgcctgcgGCTACCAg < 2:3022‑M2/8‑1 (MQ=255) acacCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGTCGCGAGCTTGTTGCTGCAGGCGCTGCACGGCGCCTTCGAGCTGTTCGAAGATCGCCTGGGTGGTGCCTTGCAGGGCACGACCGGCGGGGGt > 1:984059/1‑236 (MQ=255) acCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGAcagca > 2:999381/1‑131 (MQ=255) gCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGt < 1:55604/115‑1 (MQ=255) cAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGt < 2:949563/125‑1 (MQ=255) cGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGTCGCGAGCTTGTTGCTGCAGGCGCTGCACGGCGCCTTCGAGCTGTTCGAAGATCGCCTGGGTGGTGCCTTGCAGGGCACGACCGGCGGGGGTGAGGAAAATGGCCCGGTTgcgg < 1:1070713/235‑1 (MQ=255) gcctgcgGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAgcgc > 2:511702‑M2/8‑52 (MQ=255) gcctgcgGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGTCGCGAGCTTGTTGCTGCAGGCGCTGCACGGCGCCTTCGAGCTGTTCGAAGATCGCCTGGGTGGTGCCTTGCAGGGCACGACCGGCGGGGGTGAGGAAAATGGCCCGGTTGCGGCGTTcgc > 2:758978‑M2/8‑235 (MQ=255) cctgcgGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGt < 2:257476‑M2/109‑1 (MQ=255) cctgcgGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGTCGCGAGCTTGTTGCTGCAGGCGCTGCACGGCGCCtt < 2:306004‑M2/145‑1 (MQ=255) cctgcgGCTACCAGGGGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGTCGCGAGCTTGTTGCTGCAGGCGCTGCACGGCGCCTTCGAGCTGTTCg < 1:869410‑M2/156‑1 (MQ=255) ctgcgGCTACCAGGTGCAACGGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCaa < 1:172555‑M2/90‑1 (MQ=255) cgGCTCCCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGTCGCGAGCTTGTTGCTGCAGGCGCTGCACGGCGCCTTCGAGCTGTTCGAAGATCGCCTgg < 2:714964‑M2/168‑1 (MQ=255) cgGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGTCGCGAGCTTGTTGCTGCAGGCGCTGCACGGCGCCTTCGAGCTGTTCGAAGAt < 2:50101‑M2/161‑1 (MQ=255) | CGCCTGTTGGCCGCTCAGGCGCAGCCAGGTGGGCCAGGCAGCAGGACGTGTGGTGCTGTGCAGCAGCCGTTGGCCATCGAGTCTGGCGCAGGCGGCGGGGTGGCACACCGGGCCGATCCATTCATCGCAGATTTTCTGGCTGTACAGCTGGTTGTCCCAGTGGAAGTCGTCGCGGCGAATTGCCAGGTCGACACCGCTGCGCGCGAAGTCCAGCGGGCCGCCTGCGGCTACCAGGTGCAACTGAAGGTCGGGGTGGGTGGCATGGAAGCGCGGCAGGCGCGGGATCAGCCAGCGCATGGCGATGGTCGGTTCGCAAGACAGCACCAGCACATTGTCGCGAGCTTGTTGCTGCAGGCGCTGCACGGCGCCTTCGAGCTGTTCGAAGATCGCCTGGGTGGTGCCTTGCAGGGCACGACCGGCGGGGGTGAGGAAAATGGCCCGGTTGCGGCGTTCGA > AE015451/811646‑812100 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |