New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1714475 | 41 (0.710) | 3 (0.060) | 3/322 | NT | 6.9% | coding (319/870 nt) | PP_1509 | conserved protein of unknown function |
? | AE015451 | = 1714500 | 42 (0.770) | coding (344/870 nt) | PP_1509 | conserved protein of unknown function |
TGTTCAACGCCGTCGAAGGCAACACCACTTTCTACGCACGTCCCGCTCCCGGCACCATTGCCCGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCCGCGTGCGCTGTTCAGTTGTACCTCGCGCGACCCTGCCGTGCTGCATGCGCAGTCGA > AE015451/1714278‑1714730 | tgtTCAACGCCGTCGAAGGCAACACCACTTTCTACGCACGTCCCGCTCCCGGCACCATTGCCCGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGtt > 1:735920/1‑235 (MQ=255) aaCGCCGTCGAAGGCAACACCACTTTCTACGCACGTCCCGCTCCCGGCACCATTGCCCGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGccc < 1:146946/236‑1 (MQ=255) cGAAGGCAACACCACTTTCTACGCACGTCCCGCTCCCGGCACCATTGCCCGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGgcgc > 2:913473/1‑233 (MQ=255) aaGGCAACACCACTTTCTACGCACGTCCCGCTCCCGGCACCATTGCCCGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTgccggc < 2:750414‑M2/214‑7 (MQ=255) aaGGCAACACCACTTTCTACGCACGTCCCGCTCCCGGCACCATTGCCCGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTg > 1:411348/1‑236 (MQ=255) acTTTCTACGCACGTCCCGCTCCCGGCACCATTGCCCGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTGCCGAGGGATGTCTGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATTGACCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTg < 1:1033098/236‑1 (MQ=255) cccGGCACCATTGCCCGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGc > 2:826512/1‑211 (MQ=255) aCCATTGCCCGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGcc < 1:380874/236‑1 (MQ=255) cATTGCCCGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGcc < 2:683206/234‑1 (MQ=255) ccGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGAt > 1:243944/1‑214 (MQ=255) gcgcAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAg > 1:857566/1‑235 (MQ=255) cccGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAg > 2:805088/1‑234 (MQ=255) aCTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGCCCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCgg > 2:75734/1‑156 (MQ=255) aCTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCttttt > 1:788786/1‑235 (MQ=255) aCTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCttttt > 1:66532/1‑235 (MQ=255) aCTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGGGGAAGTGCGCAAcc > 1:343072/1‑225 (MQ=255) ttCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGc < 1:805091/235‑1 (MQ=255) gCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCtcgttgcc > 2:474766/1‑195 (MQ=255) ggATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGAt < 1:232254/160‑1 (MQ=255) gTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAAcc < 1:520245/235‑1 (MQ=255) tCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGGAGCACGCCTGCCCAACCGc > 1:310329/1‑236 (MQ=255) ggCCATGAAGGCGACCTGCGCGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGcc < 2:180853/194‑1 (MQ=255) gCGACCTGCGAGACCAGCTTGGGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCGCCCTACTGGCTGCAGTTgccggcccagcggggccatcagccgggtgaagtcgaaggcaggctca > 2:207148‑M2/1‑91 (MQ=255) gagaCCAGCTTGAGCCTGCCTTCGCCTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGgtgt < 1:314746/235‑1 (MQ=255) agaCCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGtgtg < 2:857563/235‑1 (MQ=255) cTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGcc > 1:129034/1‑140 (MQ=255) aGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGcc > 1:684995/1‑204 (MQ=255) tCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCcg > 1:728086/1‑236 (MQ=255) ccGACTCCGCCCGGCTGCTGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACGGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCctg < 2:295303/196‑1 (MQ=255) cgccTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAAcgc < 1:272093/205‑1 (MQ=255) aTGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGGAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCg < 2:1043075/203‑1 (MQ=255) aTGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCcgc < 2:766269/220‑1 (MQ=255) gCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCACAGTTCGGCCCGGCGCGTTTgg < 1:293322/70‑1 (MQ=255) ccGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCCGCGTGCGCTGTTCAGTTGTACCTc < 1:75736/236‑1 (MQ=255) tGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCg < 1:360131/193‑1 (MQ=255) tGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCg > 2:360128/1‑193 (MQ=255) gggCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGGGCGTATCTGcc > 2:217942/1‑200 (MQ=255) ggCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCt < 2:964418/200‑1 (MQ=255) cGGCGCGTCTCACCCTACTGGCTGCAGTTgccggcccagcggggccagcagccgggtgaagtcgaaggcaggctcaagctggtctcgcaggtcgccttcatggctgacatcccgcggaaact > 2:905991‑M2/1‑29 (MQ=255) ggcgTATCACCCTACGGGCTGCGGTTGCCGGCCCAGCTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTCCCTCGATCGGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCACCCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCCGCGt < 1:105606/203‑1 (MQ=255) gcgTATCCCCCTCCTGGCTGCCGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCCCTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCcgc < 1:222774/201‑1 (MQ=255) gTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGCGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCCGCGTGCGCTGTTCAGTTGGACCTc > 1:110458/1‑221 (MQ=255) aCCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCCGCGTGCGCTGTTCAGTTGTa > 1:30118/1‑212 (MQ=255) ccTACTGGCTGCAGTTgccggcccagcggggccatcagccgggtgaagtcgaaggcaggctcaagctggtctcgca > 2:301166‑M2/1‑16 (MQ=255) gCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCcgcg > 2:753591/1‑186 (MQ=255) gCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCCGCGTGCGCTGTTCAGTTGTACCTCGCGCGACCCTGCCGTGCTGCATGCGCAGt > 1:200991/1‑236 (MQ=255) gCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCCGCGTGCGCTGTTCAGTTGTACCTCGCGCGACCCTGCCGTGCTGCATGCGCAGTCga > 1:1028322/1‑236 (MQ=255) ccgTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGAGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCCGCGTGCGCTGTTCAGTTGTACCTCGCGCGACCCTGc < 1:83970/213‑1 (MQ=255) aGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGa < 2:363928/148‑1 (MQ=255) aGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGa > 1:363931/1‑148 (MQ=255) aGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGcc > 2:863704/1‑171 (MQ=255) aGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCt > 1:639574/1‑172 (MQ=255) ttGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCCGCGTGCGCTGTTCAGTTGTACCTCGCGCGACCCTGCCGTGCTGCAt < 1:6019/222‑1 (MQ=255) tGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGGTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGGGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAAcc < 2:294906/132‑1 (MQ=255) | TGTTCAACGCCGTCGAAGGCAACACCACTTTCTACGCACGTCCCGCTCCCGGCACCATTGCCCGCTGGGCGCAGCTCATGCCCGAGCACTTTCGCTTCACTGCCAAGTTTCCGCGGGATGTCAGCCATGAAGGCGACCTGCGAGACCAGCTTGAGCCTGCCTTCGACTTCACCCGGCTGATGGCCCCGCTGGGCCGGCGCGTATCACCCTACTGGCTGCAGTTGCCGGCCCAGTTCGGCCCGGCGCGTTTGGGTGAGCTTTGTCACTTCCTCGATCAGATTGCCGTGCCCGTGGCCGTGGAAGTGCGCAACCAGGCCTTTTTTGCCAAGGGTGAGGAAGAACGCCTGCTCAACCGCCTGCTGCACGAACGCGGTGTGGAGCGTATCTGCCTCGACCCGCGTGCGCTGTTCAGTTGTACCTCGCGCGACCCTGCCGTGCTGCATGCGCAGTCGA > AE015451/1714278‑1714730 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |