New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1842345 | 37 (0.640) | 3 (0.060) | 3/318 | NT | 7.7% | coding (2449/2754 nt) | gacS | Sensor protein GacS |
? | AE015451 | = 1842393 | 38 (0.710) | coding (2401/2754 nt) | gacS | Sensor protein GacS |
CACGCCGCAATAGCGTGAGGCACCGTTCAGACGGTGTACCTGCTCGATCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTGGCCATGGCATGGGCAGTGAGGGCGACGATCGGCAGCGGGTTGCCGCTCTGGGTGTTCTCCCACAGGCGGATCTGTTCGGTACAGGCGCGGCCGTCCATGCCG > AE015451/1842172‑1842628 | cACGCCGCAATAGCGTGAGGCACCGTTCAGACGGTGTACCTGCTCGATCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGgcctgcgcctgc > 1:1076013/1‑235 (MQ=255) aCGCCGCAATAGCGTGAGGCACCGTTCAGACGGTGTACCTGCTCGATCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCctgctg < 1:798614/236‑1 (MQ=255) cAATAGCGTGAGGCACCGTTCAGACGGTGTACCTGCTCGATCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGgtgt < 1:390107/236‑1 (MQ=255) aGCGTGAGGCACCGTTCAGACGGTGTACCTGCTCGATCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGgtgt < 2:846294/232‑1 (MQ=255) ggCACCGTTCAGACGGTGTACCTGCTCGATCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCa > 1:308696/1‑236 (MQ=255) aCCGTTCAGACGGTGTACCTGCTCGATCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGc > 1:466267/1‑236 (MQ=255) cGTTCAGACGGTGTACCTGCTCGATCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCg < 1:425346/236‑1 (MQ=255) tACCTGCTCGATCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTtcatca > 1:1034711/1‑236 (MQ=255) cTGCTCGATCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGgtgt < 2:682531/204‑1 (MQ=255) tCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCctgctg > 2:77462/1‑190 (MQ=255) tCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGc > 1:1048762/1‑235 (MQ=255) tCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCCCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGc > 1:808887/1‑235 (MQ=255) ggCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCa < 2:1028214/204‑1 (MQ=255) cGGTCATCGGCGGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGtgtg < 2:157153/186‑1 (MQ=255) gcggcgCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAg < 1:787375/236‑1 (MQ=255) cTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATg < 1:495197/236‑1 (MQ=255) gcgGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGc < 2:937926/203‑1 (MQ=255) ggTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTtcatca > 2:834701/1‑177 (MQ=255) ggTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTtcatca < 1:834704/177‑1 (MQ=255) aGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAAcgcgcg > 1:367186/1‑235 (MQ=255) agcagcATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCa > 1:904736/1‑139 (MQ=255) agcagcATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCa < 2:904733/139‑1 (MQ=255) agcagcATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCCACAACGCGCGTTTTTc > 1:1024964/1‑236 (MQ=255) caTGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTg < 1:641149/235‑1 (MQ=255) aGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGc < 2:1059501/115‑1 (MQ=255) aGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGc > 1:1059504/1‑115 (MQ=255) gCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACGTCATcacc > 1:423109/1‑121 (MQ=255) ggCCAGGCGCAGGCCCTCTGCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAgg < 2:319982/154‑1 (MQ=255) aGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCggcctgcgcctggccgctggcaaggcagatct > 2:793307‑M2/1‑59 (MQ=255) aGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCggcctgcgcctggccgctggcaaggcagatct < 1:793310‑M2/91‑33 (MQ=255) ggCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTg < 2:499835/137‑1 (MQ=255) cGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCggcctgcgcct < 2:308064‑M2/54‑12 (MQ=255) aCCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTGGCCATGGCATGGGCAGTGAGGGCGACGATCGGCAGCGGGTTGCCGCTCTGGGTGTTCTCCcacc > 1:247427/1‑228 (MQ=255) aCCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTGGCCATGGCATGGGCAGTGAGGGCGACGATCGGCAGCGGGTTGCCGCTCTGGGTGTTCTCCCACAGGCGGa > 1:390745/1‑235 (MQ=255) aCCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTGGCCATGGCATGGGCAGTGAGGGCGACGATCGGCAGCGGGTTGCCGCTCTGGGTGTTCTCCCACAGGCGGa > 1:809766/1‑235 (MQ=255) aCCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGGCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACGTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTACGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTg < 2:591637/165‑1 (MQ=255) cTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTGGCCATGGCATGGGCAGTGAGGGCGACGATCGGCAGCGGGTTGCCGctc < 2:367183/211‑1 (MQ=255) cTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTGGCCATGGCATGGGCAGTGAGGGCGACGATCGGCAGCGGGTTGCCGCTCTGGGTGTTCTCCCACAGGCGGAt < 2:398354/234‑1 (MQ=255) gtcggcgCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTGCATCACCACCTGGGCCAGTGGcc < 2:89900/91‑1 (MQ=255) cgtcgCCGTTGGTCAGCAGCTCggcctgcgcctggccgctggcaaggcagatctggccgctgac > 2:221866‑M2/1‑22 (MQ=255) ccGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGTTCgggt > 1:241947/1‑98 (MQ=255) ccGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGACCGGtt > 2:71743/1‑100 (MQ=255) cGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGtttt > 2:343135/1‑143 (MQ=255) cGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGtttt < 1:343138/143‑1 (MQ=255) cagcagCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGCTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGCTTTTCGTTGGCCATGGCATGGGCAGTGAGGGCGACGATCGGCAGCGGGt > 1:152227/1‑182 (MQ=255) cTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGtt < 2:26573/68‑1 (MQ=255) cTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGtt > 1:26574/1‑68 (MQ=255) cTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTGGCCATGGCATggg > 1:901511/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTGGCCATGGCATGGGCAGTGAGGGCGACGATCGGCAGCGGGTTGCCGCTCTGGGTGTTCTCCCACAGGCGGATCTGTTCGGTACAGGCGCGGCCGTCCATGCCg > 1:280178/1‑236 (MQ=255) cGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTGGCCATGGCATGGGCAGTGAGGGCGACGATCGGCAGCGGGTTGCCGCTCTGGGTGTTCTCCCACAGGCGGATCTGTTCGGTACAGGCGCGGCCGTCCATGCCg > 1:767312/1‑236 (MQ=255) | CACGCCGCAATAGCGTGAGGCACCGTTCAGACGGTGTACCTGCTCGATCAGGCCATTTCGGTCATCGGCTGCGCGGGCGGCGCGTATGGCTTCGCGGTCCGTATCCAGGGAGGCCAGCAGCATGCTCAGCATGTCAGCGGCCAGATCTGCCTTGCCAGCGGCCAGGCGCAGGCCCTCTTCGGGGTCGAGTACCTTCAGTTCGTCGCCGTTGGTCAGCAGCTCGGCCTGCGCCTGCTGCGGTGTGCCCAGGCTCAGGCCGGTCCACTTCATCACCACCTGGGCCAGTTGCCGTTCGCTGATCGGTTTGGTCAGGTAGTCGTCCATGCCGCTGTGCAACAACGCGCGTTTTTCGTTGGCCATGGCATGGGCAGTGAGGGCGACGATCGGCAGCGGGTTGCCGCTCTGGGTGTTCTCCCACAGGCGGATCTGTTCGGTACAGGCGCGGCCGTCCATGCCG > AE015451/1842172‑1842628 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |