New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1886259 | 54 (0.940) | 5 (0.100) | 5/310 | NT | 9.2% | coding (926/1488 nt) | rmuC | DNA recombination limiting inversions protein |
? | AE015451 | = 1886243 | 50 (0.960) | coding (910/1488 nt) | rmuC | DNA recombination limiting inversions protein |
CAGGCCTTGAAGGGCCAGAAAACCCAGGGTAACTGGGGTGAGCTTATCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGTGTTGTTGTTCGTGCCCATCGAGGCGGCCTTTTCGGCGGCCCTGCAGGCCGAGCCGAACCTGTTCCAGGAGGCCTTCGACCGGCAGATCGTGAT > AE015451/1886024‑1886457 | cAGGCCTTGAAGGGCCAGAAAACCCAGGGTAACTGGGGTGAGCTTATCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACG > 1:827457‑M1/1‑235 (MQ=255) tGAAGGGCCAGAAAACCCAGGGTAACTGGGGTGAGCTTATCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGtt < 1:585372/236‑1 (MQ=255) tGAAGGGCCAGAAAACCCAGGGTAACTGGGGTGAGCTTATCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGtt > 1:562106/1‑236 (MQ=255) aGAAAACCCAGGGTAACTGGGGTGAGCTTATCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCTTACCAGCAGt > 1:227201/1‑204 (MQ=255) aaCTGGGGTGAGCTTATCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACATGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTgcgc < 1:665285/217‑1 (MQ=255) gggTGAGCTTATCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTtcgttgccggcaacgaactgctggtacgccgtgaggctgaccctgtctct < 1:378457‑M2/235‑51 (MQ=255) gAGCTTATCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAg < 1:886397/236‑1 (MQ=255) ttATCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTtcgttgccggcaa < 2:810431‑M2/190‑14 (MQ=255) aTCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAacgacg > 1:788717/1‑193 (MQ=255) aTCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGc < 1:285234/223‑1 (MQ=255) aCGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGaa > 2:4325/1‑187 (MQ=255) tgtgCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTgcgc < 2:823308/217‑1 (MQ=255) gtgCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAagca < 1:892257/197‑1 (MQ=255) tgCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGAactgctggtacg < 2:378454‑M1/190‑13 (MQ=255) gCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCg > 1:556994/1‑235 (MQ=255) atgGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGG < 1:92596‑M1/169‑1 (MQ=255) aggccGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTtcgttgccggcaacgaactgctggtacgccgtgaggctgaccttggcgtccaccaccacctgcttgtcgccgggc > 1:357908‑M2/3‑153 (MQ=255) ccGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAagca > 2:892254/1‑184 (MQ=255) ggCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGa < 1:843010/223‑1 (MQ=255) tGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGAactgctggtacgccgtgaggctgaccttggcgtccacccccacctgca > 2:357905‑M1/1‑160 (MQ=255) gAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAgccgcc < 1:648216/235‑1 (MQ=255) aaaaGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGTCAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTTGAGCAAGGACCACAgccgcc < 2:562103/234‑1 (MQ=255) aaaGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAgccgcc < 2:450656/233‑1 (MQ=255) gtgccGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACG < 2:734074‑M1/150‑1 (MQ=255) cgcgAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGcc < 1:950471/235‑1 (MQ=255) cgcgAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCt < 1:511999/236‑1 (MQ=255) gcgAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGcc < 1:810434/234‑1 (MQ=255) cgAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGa < 2:995841/206‑1 (MQ=255) aTACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCGGGCAAC > 2:292927‑M1/1‑142 (MQ=255) tACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAgccgcc < 1:128306/220‑1 (MQ=255) ggTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTc > 1:862097/1‑235 (MQ=255) tCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGc > 1:305811/1‑219 (MQ=255) cAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCt > 2:991321/1‑216 (MQ=255) cTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGtgttgtt < 1:489754/236‑1 (MQ=255) cTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGCGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCAt > 2:327616/1‑147 (MQ=255) aaGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAgccgcc < 1:691832/197‑1 (MQ=255) aGCGCCGATGGTGAGCGGTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGAactgctggtacgccgtgaggctgaccttggcgtccaccaccacctgcttgtcg < 2:463744‑M1/172‑54 (MQ=255) gcgcCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGa > 1:820909/1‑199 (MQ=255) gcgcCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTg > 1:709619/1‑206 (MQ=255) gcgcCGATGGTGAGCGTGTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCa < 2:149252/156‑1 (MQ=255) gctGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAgccgcc < 2:66477/188‑1 (MQ=255) gATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTg > 2:612508/1‑210 (MQ=255) ggttCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGCGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAgccgcc < 2:940223/178‑1 (MQ=255) gCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGcaca < 1:523485/188‑1 (MQ=255) ccGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGTGTTGTTGTTCGTGCCCATCGAGGCGGCCTTTTcgg < 1:991324/235‑1 (MQ=255) gtgCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGa < 1:425490/148‑1 (MQ=255) gtgCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGa > 2:425487/1‑148 (MQ=255) cgtgctgcCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGTGTTGTTGTTCGTGCCCATCg < 1:9897/204‑1 (MQ=255) gctgaCCGGCGACGAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCGGCCGCACGGCGTACCAGCAGTTCGTGGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCa < 2:16785/105‑1 (MQ=255) ctgcCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGcaca < 2:401005/169‑1 (MQ=255) tgcCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTg > 1:991408/1‑173 (MQ=255) tgcCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGTGTTGTTGTTCGTGCCCATCGa < 1:929104/202‑1 (MQ=255) gcCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGAactgctggtacgccgtgaggctgaccttggcgtccaccaccacctgcttgtcgccgggcagcatgatcagcacatccggctggaaacgctcaccatcggcgcttttcaggctgacctgggtctggtattcgcggcccttttccaggccggcct > 1:357908‑M1/1‑75 (MQ=255) ggCGACAAGCAGGTGGTGGGGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCGGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGTGTTGTTGTTCGTGCCCATCGAGGCGGCCTTTTcgg < 1:159157/211‑1 (MQ=255) gCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGTGTTGTTGTTCGTg < 1:568517/188‑1 (MQ=255) gCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCACCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGcc < 2:847433/156‑1 (MQ=255) cGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTtcgttgccggcaacgaactgctggtacgccgtgaggctgaccttggcgtccaccaccacctgcttgtcgccgggcagcatgatcagcacatccggctggaaccgctcaccatcggcgct < 2:463744‑M2/172‑120 (MQ=255) cAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCt > 2:824493/1‑144 (MQ=255) tgcAGGTGGGGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTtcgttgccggcaacgaactgctggtacgccgtgaggctgaccttggcgtccaccaccacctgcttgtcgccgggcagcatgatcagcacatccggctggaaacgctcaccatcggcgcttttcaggctgacctgggtctggtattcgcggcccttttcca > 2:357905‑M2/2‑48 (MQ=255) aGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGAc < 1:735724/161‑1 (MQ=255) tggtggACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGTGTTGTTGTTCGTGCCCATCGAGGCGGCCTTTTCGGCGGCCCTGCAGgccgagcc < 2:556991/214‑1 (MQ=255) gtggACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGTGTTGTTGTTCGTGCCCATCGAGGCGGCCTTTTCGGCGGccc > 2:820261/1‑199 (MQ=255) agagacagggtcagcctcACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGAactgctggtacgccgtgaggctgaccttggcgtccaccaccacctgcttgtcgccgggcagcatgatcagcacatccggctggaaacgctcaccatcggcgcttttcaggctgacctgggtctggtattcgcggcccttttccaggccggcatgttccagcacacgttcgaggataagctcaccc < 1:378457‑M1/227‑186 (MQ=255) aCGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGTGTTGTTGTTCGTGCCCATCGAGGCGGCCTTTTCGGCGGCCCTGCAGgccgagccg < 1:941758/192‑1 (MQ=255) cGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGa < 2:195616/90‑1 (MQ=255) cGTACCAGCAGTtcgttgccggcaacgaactgctggtacgccgtgaggctgaccttggcgtccaccaccacctgcttgtcgccgggcagcatgatcagcacatccggctggaaacgctcaccatcggcgcttttcaggctgacctgggtctggtattcgcggcccttttccaggccggcatgttccagca < 2:378454‑M2/190‑179 (MQ=255) cagcagTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGTGTTGTTGTTCGTGCCCATCGAGGCGGCCTTTTCGGCGGCCCTGCAGGCCGAGCCGAACCTGTTCCAGGAGGCCTTCGACCGGCAGATCGTGAt < 1:309218/221‑1 (MQ=255) cagcagTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTCCGTGTTGTTGTTCGTGCCCATCGAggc > 2:932156/1‑152 (MQ=255) ttCGTTGCCGGAAACGACGAAGTTGCACTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCACCCACGTCAAAGGCCt < 2:250706/71‑1 (MQ=255) | CAGGCCTTGAAGGGCCAGAAAACCCAGGGTAACTGGGGTGAGCTTATCCTCGAACGTGTGCTGGAACATGCCGGCCTGGAAAAGGGCCGCGAATACCAGACCCAGGTCAGCCTGAAAAGCGCCGATGGTGAGCGTTTCCAGCCGGATGTGCTGATCATGCTGCCCGGCGACAAGCAGGTGGTGGTGGACGCCAAGGTCAGCCTCACGGCGTACCAGCAGTTCGTTGCCGGCAACGACGAAGTTGCGCTCAAGCAGCATGTGCAGTCGCTGCGCAGCCACGTCAAAGGCCTGTCGAGCAAGGACTACAGCCGCCTCGAAGGCCTGCACAGCCTGGACTTCGTGTTGTTGTTCGTGCCCATCGAGGCGGCCTTTTCGGCGGCCCTGCAGGCCGAGCCGAACCTGTTCCAGGAGGCCTTCGACCGGCAGATCGTGAT > AE015451/1886024‑1886457 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
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