New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 2283311 | 39 (0.680) | 3 (0.050) | 3/324 | NT | 8.1% | coding (504/978 nt) | PP_2011 | conserved exported protein of unknown function |
? | AE015451 | = 2283449 | 31 (0.570) | coding (366/978 nt) | PP_2011 | conserved exported protein of unknown function |
CGCCAGCGCCTGACGGCTGTGCGCTCCCGTGGACATGGGCAACTGGTGCCCCGCCAGGTGCGCAAGCTTGGTCCCCAGCCGGTCATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAACGGTCGGTCATCGGCATCCAGGGCCCGCAACCATTGTTCAAGGCGTTGCGGCTGCTGCGCCCACAGGCTGCCCGCCAGCGG > AE015451/2283215‑2283646 | cgcCAGCGCCTGACGGCTGTGCGCTCCCGTGGACATGGGCAACTGGTGCCCCGCCAGGTGCGCAAGCTTGGTCCCCAGCCGGTCATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCg > 1:34480‑M2/1‑235 (MQ=255) ggCTGTGCGCTCCCGTGGACATGGGCAACTGGTGCCCCGCCAGGTGCGCAAGCTTGGTCCCCAGCCGGTCATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTggcg > 2:921167/1‑233 (MQ=255) ggCAACTGGTGCCCCGCCAGGTGCGCAAGCTTGGTCCCCAGCCGGTCATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATgcctggcgcc > 2:904229/1‑234 (MQ=255) gTGCCCCGCCAGGTGCGCAAGCTTGGTCCCCAGCCGGTCATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAggg < 2:747382/236‑1 (MQ=255) ccccGCCAGGTGCGCAAGCTTGGTCCCCAGCCGGTCATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTggcggc < 1:144550/201‑1 (MQ=255) ccAGGTGCGCAAGCTTGGTCCCCAGCCGGTCATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTg < 1:586503/235‑1 (MQ=255) cAGGTGCGCAAGCTTGGTCCCCAGCCGGTCATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGcc < 1:904232/236‑1 (MQ=255) gTGCGCAAGCTTGGTCCCCAGCCGGTCATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCcac < 1:422208/235‑1 (MQ=255) tGGTCCCCAGCCGGTCATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCgta < 1:619918/235‑1 (MQ=255) cGGTCATGGCCACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCCCGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCa < 1:252630/235‑1 (MQ=255) cATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGc < 2:824620/213‑1 (MQ=255) ccccAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAAtt < 1:1039257/236‑1 (MQ=255) ggATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCgccagcc < 1:859628/229‑1 (MQ=255) aTCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCCGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGcc < 1:396938/213‑1 (MQ=255) cGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGC‑TGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAAc < 1:613687/235‑1 (MQ=255) cccGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAAcggtc > 1:794749/1‑236 (MQ=255) cGGGCCCGGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATgcctggcgc < 2:298335/138‑1 (MQ=255) gggCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGGCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCgcc < 1:1084425/204‑1 (MQ=255) cAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCcaca < 1:50016/155‑1 (MQ=255) tACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCgg > 1:591570/1‑180 (MQ=255) tACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCgg < 2:591567/180‑1 (MQ=255) tCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCgg < 2:492070/170‑1 (MQ=255) gCCAGGTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCca < 2:267661/137‑1 (MQ=255) ccAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAACGGTCGGTCATCGGCATCCAGGGCCCGCAACCATTGTTCAAgg < 2:913783/233‑1 (MQ=255) ggtgCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCgccaggttgccatgaccggctggggaccaagcttgcgcacctggcggggcaccagttgcccatgtccacgggagcgcacagccgtcaggcgctggcgcagctaggggtggagcaggtgcaggcgcaaatgtggctgggtggttacctgttctatccacggcctgggca < 1:560733‑M2/236‑169 (MQ=255) aCGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCagcagc > 2:756534/1‑84 (MQ=255) aCGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCagcagc < 1:756537/84‑1 (MQ=255) gCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCgccaggttgccatgaccggctggggaccaagcttgcgcacctggcggggcaccagttg > 1:611433‑M2/1‑61 (MQ=255) gCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCgccaggttgccatgaccggctggggaccaagcttgcgcacctggcggggcaccagttg < 2:611430‑M2/119‑59 (MQ=255) ccGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAACGGTCGGTCATCGGCATCCAGGGCCCGCAACCATTGTTCAAGGCGTTGCGgctg < 1:76570/230‑1 (MQ=255) gtcgcggtcgcgCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAACGGTCGGTCATCGGCATCCAGGGCCCGCAACCATTGTTCAAGGCGTTGCGGCTGCTGCGccc < 1:679743/236‑1 (MQ=255) gtcgcggccgcgCAGCACCACGTCTAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCAAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAACGGTCGGTCATCGGCATCCAGGGCCCGCAACCATTGTTc < 1:625276/213‑1 (MQ=255) gcggtcgcgCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAACGGTCGGTCATCGGCATCCAGGGCCCGCAACCATTGTTCAAGGCg < 1:922620/216‑1 (MQ=255) acGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAACGGTCGGTCATCGGCATCCAGGGCCCGCAACCATTGTTCAAGGCGTTGCGGCTGCTGCGCCCACAGGCTGCCCGCCAGCgg < 1:651228/236‑1 (MQ=255) gggTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCGCGATgcctggcgcctgggg > 1:540797/1‑62 (MQ=255) gccgTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGcc < 2:231039/68‑1 (MQ=255) cgAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAACGGTCGGTCATCGGCATCCAGGGcc < 1:768322/147‑1 (MQ=255) gAACCGCCAGGTGGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCGGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAACGGTCGGTCAt < 2:1014218/132‑1 (MQ=255) tCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAACGGTCGGTCATCGGCATCCAGGGCCCGCAACCATTGTTCAAGGCGTTGCGGCTGCTgcgc < 2:678341/178‑1 (MQ=255) | CGCCAGCGCCTGACGGCTGTGCGCTCCCGTGGACATGGGCAACTGGTGCCCCGCCAGGTGCGCAAGCTTGGTCCCCAGCCGGTCATGGCAACCTGGCCCCAGCCAGGCATGGGGATCGTGCCCGGCGTCTTCCGGGCCCAGGTACAGCTTGATCGCCAGTTCCAGGTGGTGCACGCCGTCGCGGTCGCGCAGCACCACGTCGAGCTCGCCCAGGGTGTGCCCGCCGTCGCGAATCGCCAGGTTGGCGGCCAGCAGCTCGATGCCTGGCGCCTGGCTCAGGGCAAATTGCCACAGGCGTTCGTAGTAATGCCCCAGGCGCCGGCTGCCCAATTGCGCCAGCCAGGCGCGCAACGGTCGGTCATCGGCATCCAGGGCCCGCAACCATTGTTCAAGGCGTTGCGGCTGCTGCGCCCACAGGCTGCCCGCCAGCGG > AE015451/2283215‑2283646 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |