New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2320513 = | 50 (0.870) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 6.0% | coding (728/945 nt) | PP_2041 | Transcriptional regulator, LysR family |
? | AE015451 | 2320540 = | 47 (0.860) | coding (701/945 nt) | PP_2041 | Transcriptional regulator, LysR family |
CTCCGCCAGGGCCTCGCGCTCGATCAAGGTTCCTTTCCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGTCAGGGCCGTGCCCAGGCAGGCCGACCCAATACAGGTCTTCGGAAAACACGGGCTCGGCGA > AE015451/2320308‑2320774 | cTCCGCCAGGGCCTCGCGCTCGATCAAGGTTCCTTTCCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCGGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGA‑‑‑ACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCgccaggccag > 1:657907/1‑236 (MQ=255) ggCCTCGCGCTCGATCAAGGTTCCTTTCCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACgg < 1:719822/235‑1 (MQ=255) cTCGCGCTCGATCAAGGTTCCTTTCCAGCGCGCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCa < 1:241061/236‑1 (MQ=255) cgcTCGATCAAGGTTCCTTTCCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAg > 2:571639/1‑233 (MQ=255) cTCGATCAAGGTTCCTTTCCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTg > 1:873374/1‑235 (MQ=255) ggTTCCTTTCCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATAc < 2:370934/233‑1 (MQ=255) ccAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGa > 1:533669/1‑234 (MQ=255) gcccatcaccttggctgaagccgcagcgagccgcctggtaatgccaccccgtagcctgcacttgcgcaggcgcatcgagcaggctgccatggaaaccggtgtgacactggactccagctacgaacagcagtcggcccccggtatcaccagcctggtccgtgctggcctggcggccaccatcagcaactggccgccAGGCCAGCACg < 1:1014846‑M2/11‑1 (MQ=255) tGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGGTGTTCGTAg < 1:588/236‑1 (MQ=255) caccaGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGActgct < 1:49211/215‑1 (MQ=255) accaGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGAc < 2:1022843/185‑1 (MQ=255) cgcgcACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAg < 1:34943/212‑1 (MQ=255) gcgcACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGcc > 1:319996/1‑196 (MQ=255) gcACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCacac > 1:3104/1‑228 (MQ=255) gtagcctgcacttgcgcaggcgcatcgagcaggctgccatggaaaccggtgtgacactggactccagctacgaacagcagtcggcccccggtatcaccagcctggtccgtgctggcctggcggccaccatcagcaactggccgccAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCg > 1:672826‑M2/146‑193 (MQ=255) ggcgAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCATGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTg > 1:44735/1‑222 (MQ=255) aCAGCGGTTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGAcc < 2:243963/140‑1 (MQ=255) aGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTg < 2:873371/225‑1 (MQ=255) gggctgcGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCt < 2:856933/214‑1 (MQ=255) tgctgcGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTAc < 2:657904/232‑1 (MQ=255) tgctgcGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTACCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTAc < 2:359579/232‑1 (MQ=255) gaaaccggtgtgacactggactccagctacgaacagcagtcggcccccggtatcaccagcctggtccgtgctggcctggcggccaccatcagcaactggccgccAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGc < 2:672823‑M2/35‑1 (MQ=255) ccAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATgcgc > 1:155733/1‑200 (MQ=255) cAAGGCGATGGTGCGGGTGACGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGActg < 2:411717/141‑1 (MQ=255) cGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCGCTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTg < 2:311086/197‑1 (MQ=255) ggTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCt < 1:286377/235‑1 (MQ=255) cgcgGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCGGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCa < 1:387819/231‑1 (MQ=255) gcgGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAgt > 2:273205/1‑140 (MQ=255) cgGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGc > 2:412885/1‑222 (MQ=255) cgaacagcagtcggcccccggtatcaccagcctggtccgtgctggcctGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTAc > 1:672826‑M1/49‑193 (MQ=255) ttCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGc < 2:514460/219‑1 (MQ=255) ccACTATCAGCCGCGCGTTGGCCGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCAAGGACCAGggtggt > 2:613478/1‑94 (MQ=255) cACGATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATg < 1:225012/235‑1 (MQ=255) aTCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTGGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCt < 1:86035/167‑1 (MQ=255) gcccccggtatcaccagcctggtccgtgctggcctGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTc < 2:672823‑M1/104‑1 (MQ=255) cgcgcgCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCCGTGTCACACCGGCTTCCATgg > 2:126130/1‑142 (MQ=255) cgcgcgCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGt > 1:960714/1‑235 (MQ=255) cgcgcgCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGt > 1:700119/1‑235 (MQ=255) cgcgcgCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGt > 1:1063908/1‑235 (MQ=255) cgcgcgCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGt > 1:1055835/1‑235 (MQ=255) cgcgcgCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCCGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATg < 2:446678/156‑1 (MQ=255) cgcgcTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCg < 2:567993/200‑1 (MQ=255) gcTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAg < 2:593799/163‑1 (MQ=255) gcTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGGGCAGGCTACggg > 1:633523/1‑176 (MQ=255) cTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACg < 2:886145/173‑1 (MQ=255) cgGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGTTTGTGGCCGCCAGGCAAGTAc < 2:530493/54‑1 (MQ=255) cgtgctggcctGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGc < 1:1014846‑M1/195‑1 (MQ=255) acccAGCAGGGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGACCTGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGCCTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGTCAGGGCCGTGCCcaggca < 1:143432/228‑1 (MQ=255) agcagcGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGTCAGGGCCGTGCCCAGGCAGGCCGACCCa < 1:412888/236‑1 (MQ=255) agcGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCa < 2:462295/142‑1 (MQ=255) cggcggCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATgcgc < 2:51937/127‑1 (MQ=255) cggcggCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAg > 1:704934/1‑182 (MQ=255) GGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGTCAGGGCCGTGCCcaggca > 2:1010338‑M1/1‑220 (MQ=255) GGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGTCAGGGCCGTGCCcaggca < 1:1010341‑M1/220‑1 (MQ=255) GCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGTCAGGGCCGTGCCCAGGCAGGCCGACCCGATACAGGTCt < 1:327095‑M1/236‑1 (MQ=255) AGTTGCTGAGGGTGGCCGCGAGGCAAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCCGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGc > 2:534176‑M1/1‑169 (MQ=255) gCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGt < 2:910159/125‑1 (MQ=255) gATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGTCAGGGCCGTGCCCAGGCAGGCCGACCCaa > 1:369287/1‑217 (MQ=255) ccgccAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGAGGCGCCTGCGCAAGTGc > 2:299839‑M2/6‑116 (MQ=255) cAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGTCAGGGCCGTGACCAGGCCGGCCGACCCAATACAGGTCTTCGGAAAACACGGGCTCGGCGa > 1:52438‑M2/2‑236 (MQ=255) | CTCCGCCAGGGCCTCGCGCTCGATCAAGGTTCCTTTCCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAGGCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCTGCGCAAGTGCAGGCTACGGGGTGGCATTACCAGGCGGCTCGCTGCGGCTTCAGCCAAGGTGATGGGCGACTCGTCAGGGCCGTGCCCAGGCAGGCCGACCCAATACAGGTCTTCGGAAAACACGGGCTCGGCGA > AE015451/2320308‑2320774 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |