New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 2475763 | 57 (0.990) | 3 (0.050) | 3/328 | NT | 5.1% | coding (606/1011 nt) | dusA | tRNA‑dihydrouridine synthase A |
? | AE015451 | = 2475772 | 56 (1.010) | coding (597/1011 nt) | dusA | tRNA‑dihydrouridine synthase A |
AAGGCCGCAGTTGCGCCAATGCCTCGCTACGGCTGACCACCGGCGCATCGCTGCCAAACAGTTGCTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTGTCACGGCCGTTGATACCAATGCGGTGCTTCACCGTGACAGGCGTCGATACGGCATCTCGCATGGCCTTCACGCAGTCGGCCACCAGCGCCGGGTGAGCCAT > AE015451/2475540‑2476005 | aaGGCCGCAGTTGCGCCAATGCCTCGCTACGGCTGACCACCGGCGCATCGCTGCCAAACAGTTGCTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGcg < 1:26485‑M2/235‑3 (MQ=255) ggCCGCAGTTGCGCCAATGCCTCGCTACGGCTGACCACCGGCGCATCGCTGCCAAACAGTTGCTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGcgca < 1:754471‑M2/235‑5 (MQ=255) ttGCGCCAATGCCTCGCTACGGCTGACCACCGGCGCATCGCTGCCAAACAGTTGCTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGcgcagc < 2:290505‑M2/229‑7 (MQ=255) ttGCGCCAATGCCTCGCTACGGCTGACCACCGGCGCATCGCTGCCAAACAGTTGCTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGaa > 1:697629/1‑236 (MQ=255) cGGCTGACCACCGGCGCATCGCTGCCAAACAGTTGCTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCCGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAAtctc > 2:1042673/1‑221 (MQ=255) gCTGACCACCGGCGCATCGCTGCCAAACAGTTGCTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCg < 1:437625/236‑1 (MQ=255) accGGCGCATCGCTGCCAAACAGTTGCTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTtc > 1:589954/1‑219 (MQ=255) gcgcATCGCTGCCAAACAGTTGCTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCtt < 2:405105/234‑1 (MQ=255) cgcATCGCTGCCAAACAGTTGCTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTcc > 1:433250/1‑235 (MQ=255) cTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGcgcagcgcagttgaagagggacttcccgg > 1:262512‑M2/1‑169 (MQ=255) ggTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGACGCGTGCATGCACg > 2:197711/1‑236 (MQ=255) cGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAAt > 1:157631/1‑208 (MQ=255) 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aTACGCCTCGCGCCCCATCATCACGCCATCGAAGGTTTCGAGGTGTGCCTTGCATTCGTCCATGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAgcgg > 2:431429/1‑144 (MQ=255) aTACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATcgc > 2:785467/1‑189 (MQ=255) aTACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCt > 1:1005742/1‑236 (MQ=255) tACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATcgc < 2:28391/188‑1 (MQ=255) tACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATcgc > 1:28392/1‑188 (MQ=255) tACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCAc > 2:723127/1‑203 (MQ=255) tACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCAc < 1:723130/203‑1 (MQ=255) ccTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGc < 2:1005739/234‑1 (MQ=255) tCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCATGGTAAAACTCAGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCcgac > 1:149977/1‑236 (MQ=255) cgcgCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATcgc < 1:407446/181‑1 (MQ=255) cgcgCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATcgc > 2:407443/1‑181 (MQ=255) gcCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGcg > 2:1007209‑M2/1‑125 (MQ=255) gcCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGcg < 1:1007212‑M2/127‑3 (MQ=255) 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gctgcgATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTGTCACGGCCGTTGATACCAATGCGGTGCTTCACCGTGAc > 1:186117/1‑185 (MQ=255) tgcgATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTGTCCCGGc > 1:485625/1‑152 (MQ=255) tgcgATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTGTCACGGCCGTTGATACCAATGCGGTGCTTCACCGTGACAGGCGTCGATGCg > 1:233580/1‑196 (MQ=255) tgcgATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTGTCACGGCCGTTGATACCAATGCGGTGCTTCACCGTGACAGGCGTCGATACGGCATCGCGCATGGCCTTCACGCCGTCg > 2:533099/1‑223 (MQ=255) gATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTGTCACGGCCGTTGATACCAATGCGGTGCTTCACCGTGACAGGCGTCGATACGGCATCTCGCATGGCCTTCACGCAGTCGGCCACCAGCGCCggg < 1:334031/235‑1 (MQ=255) tGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTg < 2:500186/140‑1 (MQ=255) cATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTGTCa < 2:55990/140‑1 (MQ=255) aTAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTGTCACGGCCGTTGATACCAATGCGGTGCTTCACCGTGACAGGCGTCGATACGGCATCTCGCATGGCCTTCACGCAGTCGGCCACCAGCGCCGGGTGAGc < 2:821078/234‑1 (MQ=255) aGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTGTCACGGCCGTTGATACCAATGCGGTGCTTCACCGTGACAGGCGTCGATACGGCATCTCGCATGGCCTTCACGCAGTCGGCCACCAGCGCCGGGTGAGCCAt > 1:639111/1‑235 (MQ=255) aGCGCAGCGGCGG‑ATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTGTCACGGCCGTTGATACCa < 2:231724/151‑1 (MQ=255) | AAGGCCGCAGTTGCGCCAATGCCTCGCTACGGCTGACCACCGGCGCATCGCTGCCAAACAGTTGCTGGTCCACCTCGGCCAGCAGATAAGGGTTGTGATACGCCTCGCGCCCCAGCATCACGCCATCGAAGGTTTCAAGGTGTGCCTGGCATTCGTCCAGGGTCTTGATCCCGCCGTTGAGCACGATCTCCAGGTCCGGGAAGTCCCTCTTCAACTGCGCTGCGATGTCATAGCGCAGCGGCGGAATCTCGCGGTTCTCTTTCGGCGACAGCCCTTCCAGAATCGCGATGCGTGCATGCACGGTAAAACTCCGGCAGCCGGCCTCACGCACCTGGCCGACGAAGTCACTCAGTTCGGCGTAGCTGTCACGGCCGTTGATACCAATGCGGTGCTTCACCGTGACAGGCGTCGATACGGCATCTCGCATGGCCTTCACGCAGTCGGCCACCAGCGCCGGGTGAGCCAT > AE015451/2475540‑2476005 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |