New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 2508922 | 36 (0.620) | 3 (0.060) | 3/310 | NT | 8.6% | coding (193/429 nt) | PP_2203 | conserved protein of unknown function |
? | AE015451 | = 2508906 | 31 (0.590) | coding (209/429 nt) | PP_2203 | conserved protein of unknown function |
CCTAGGCTGAGCATCAGTAGTTGGCGACCACGGTGTCCTGGCCATCCTGGGTCACCCCGATGACCTGGTAGGCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTAAAAACGCAG > AE015451/2508673‑2509140 | ccTAGGCTGAGCATCAGTAGTTGGCGACCACGGTGTCCTGGCCATCCTGGGTCACCCCGATGACCTGGTAGGCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAgg > 1:841354‑M2/1‑234 (MQ=255) tGAGCATCAGTAGTTGGCGACCACGGTGTCCTGGCCATCCTGGGTCACCCCGATGACCTGGTAGGCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCG > 1:397985‑M1/1‑236 (MQ=255) aTCAGTAGTTGGCGACCACGGTGTCCTGGCCATCCTGGGTCACCCCGATGACCTGGTAGGCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAggcgtggcgccacg < 1:197053‑M2/236‑15 (MQ=255) cATCCTGGGTCACCCCGATGACCTGGTAGGCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCAC < 2:684519‑M1/205‑1 (MQ=255) gggTCACCCCGATGACCTGGTAGGCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAggcgt < 2:390286‑M2/191‑6 (MQ=255) gggTCACCCCGATGACCTGGTAGGCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGgcgc > 1:756132/1‑222 (MQ=255) aTGACCTGGTAGGCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGC > 1:327376‑M1/1‑183 (MQ=255) ccctGGTAGGCATCCTTGGGGTCACCCATCGCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAggcgtg > 2:1058242‑M2/2‑172 (MQ=255) cTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAg < 2:925390/177‑1 (MQ=255) ttGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCG > 1:168562‑M1/1‑161 (MQ=255) tgtgGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGCGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCggc > 1:122296/1‑206 (MQ=255) tgGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCt > 1:438336/1‑191 (MQ=255) ccATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAggc > 1:994327‑M2/1‑147 (MQ=255) ccATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGGTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATc > 1:251825/1‑236 (MQ=255) cATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACg < 1:504056/222‑1 (MQ=255) gggCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCa > 2:723451/1‑218 (MQ=255) gAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACg > 1:254597/1‑195 (MQ=255) aGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGCCGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCa > 2:238597/1‑209 (MQ=255) gCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTgca > 2:1000974/1‑234 (MQ=255) cATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCg < 1:824856/178‑1 (MQ=255) ccGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGCACTTGCCGCCGATCACCCCGGGGTGGCACGACGCACGGCGTGGCGCCACGCCGAGGc > 2:270984/1‑135 (MQ=255) ggCACCGCAGGGCCCGTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCTCGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCCCCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCttgcgtcgtgcc < 2:933918‑M1/140‑13 (MQ=255) ccccGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGAc < 2:506116/160‑1 (MQ=255) cccgCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAG < 1:253841‑M1/109‑1 (MQ=255) gCCAGCCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCACGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAAc < 1:209157/178‑1 (MQ=255) aGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGa < 1:925475/124‑1 (MQ=255) ggTCGTTGCCTTTGGCCAGCAGGCGCCCCTGCTCGGCCGGCCCGTGGCCTTCGCCGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTg < 1:284306/170‑1 (MQ=255) gTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGtct < 1:915468/236‑1 (MQ=255) tCGTTGTGTTTGGCCAGCAGGCGCACCGGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGCCGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGtct < 1:835365/235‑1 (MQ=255) aggtgcgccTGCT‑GGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCg > 1:1069567/8‑236 (MQ=255) gcgcACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTc < 2:407172/195‑1 (MQ=255) ccggcACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCcagcag > 1:855855/1‑235 (MQ=255) gcACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAggcgtggcgccacgccttgcgtcgtgccacaccggggcgatcg < 1:274056‑M2/97‑44 (MQ=255) ttCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCgccgagacc > 1:664088/1‑208 (MQ=255) ttCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCgccgagacc < 2:664085/216‑9 (MQ=255) ttCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTcagca > 1:54741/1‑236 (MQ=255) gacgaACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCttgcgtcgtgccacgccggggtgatcggc < 2:231842‑M1/86‑30 (MQ=255) acgaACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATgg > 2:581414/1‑181 (MQ=255) aaCTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAgg < 2:303209/123‑1 (MQ=255) cTTGCCGCCGAGCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTcggc < 2:477500/183‑1 (MQ=255) cgccgATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTgcg < 1:723454/232‑1 (MQ=255) gccgATCACCCCGGCGTGGCACGACGCAAggcgtggcgccacgccttgcgtcgtgccacaccggggtgatcggcggcaagttcgtc < 2:231842‑M2/86‑58 (MQ=255) cgATCGCCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCttgcgtcgtgccacaccggggtgatcggcggcaagttcgtcgaaggccacgtgc < 1:274056‑M1/97‑55 (MQ=255) aCCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGc < 1:459487/194‑1 (MQ=255) tgGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGGTgg > 1:601438/1‑133 (MQ=255) ggCACGACGCAAggcgtggcgccacgccttgcgtcgtgccacaccggggggatcggcggcaagttcgtcgaaggccacgagccggccgagcaggtgcgcctgctggccaaacgcaacgacctcacgggccctgcggtgcc < 2:933918‑M2/140‑129 (MQ=255) ggCACGACGCAAGTCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTg > 2:167311/1‑37 (MQ=255) gacgCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGCAGCACTCCtt > 1:1024576/1‑230 (MQ=255) gacgCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTaaaaa > 1:525339/1‑236 (MQ=255) cgCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGa < 2:588785/173‑1 (MQ=255) aaGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCa > 2:968922/1‑161 (MQ=255) aaGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGCAGCACTCCTTTAAAAACGCAg > 1:631943/1‑236 (MQ=255) | CCTAGGCTGAGCATCAGTAGTTGGCGACCACGGTGTCCTGGCCATCCTGGGTCACCCCGATGACCTGGTAGGCATCCTTGTGGTCACCCATCTCCATGCCGGGCGAGCCCATGGGCATGCCCGGCACCGCCAGGCCCTTGAGGTCGTTGCGTTTGGCCAGCAGGCGCACCTGCTCGGCCGGCACGTGGCCTTCGACGAACTTGCCGCCGATCACCCCGGTGTGGCACGACGCAAGGCGTGGCGCCACGCCGAGGCGTTGCTTGACGGCGCTCATGTTTGGCTCGACGTGGTCGTTGACGGTAAAACCATTGTCACGCAGGTGGCTGATCCAGGCCTTGCAGCAGCCGCAGTTGGGGTCGCGGTAGACGTCGATGGTCTCGGCGGCCTGGGCCAGGCCGGTGACGGCCAGCAGGCTCAGGGTCAGCAGGTGTTTGCGCAGCATGGTGAAGCACTCCTTTAAAAACGCAG > AE015451/2508673‑2509140 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |