| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 2566600 = | 55 (0.950) | 4 (0.070) | 4/320 | NT | 7.3% | coding (352/1932 nt) | pctB | Methyl‑accepting chemotaxis protein PctB |
| ? | AE015451 | 2566704 = | 50 (0.930) | coding (248/1932 nt) | pctB | Methyl‑accepting chemotaxis protein PctB | |||||
ACTGCACCCTGGTACGGGGCGGTCAGCACGGTCTGCCCGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGCCAAAACCACGACGCCGCAGGCGCTGAGCAGGATCTTGTGGCGAAATTTCAGGTTCATGTTTCGAGACCTTGAGC > AE015451/2566470‑2566923 | aCTGCACCCTGGTACGGGGCGGTCAGCACGGTCTGCCCGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGtt > 1:68004/1‑236 (MQ=255)aCTGCACCCTGGTACGGGGCGGTCAGCACGGTCTGCCCGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGt > 1:404613/1‑235 (MQ=255) gggCGGTCAGCACGGTCTGCCCGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAAt < 1:117992/235‑1 (MQ=255) ggTCAGCACGGTCTGCCCGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGcc > 1:400130/1‑236 (MQ=255) tCAGCACGGTCTGCCCGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCg > 1:1052854/1‑236 (MQ=255) tCAGCACGGTCTGCCCGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCg > 1:30436/1‑236 (MQ=255) aGCACGGTCTGCCCGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCCCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGtt > 1:900987/1‑212 (MQ=255) gTCTGCCCGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCAt < 2:926337/233‑1 (MQ=255) cccGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCCTCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGGAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGGCTGGCTGGCCGGTGTCCTGGGCCAGGtcc > 2:147420/1‑200 (MQ=255) cccGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGtt < 1:759066/234‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCt > 2:594636/1‑217 (MQ=255) ggcggcggcGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGca < 2:905562/230‑1 (MQ=255) ggcgCCAGACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAAt < 1:466188/201‑1 (MQ=255) ccAGGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCa < 1:160912/188‑1 (MQ=255) ccAAGGGCGCTGGGTCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATTCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGACTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCa < 1:1024976/235‑1 (MQ=255) aGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCt < 2:404610/209‑1 (MQ=255) ggCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCa > 2:1052832/1‑224 (MQ=255) ggCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACtgctgc > 2:967880/1‑236 (MQ=255) gcgcGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCa < 2:400127/223‑1 (MQ=255) gcgcGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCa < 1:209018/223‑1 (MQ=255) gTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAgg > 1:502482/1‑236 (MQ=255) ggCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTg > 1:629712/1‑236 (MQ=255) gCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCt < 2:954915/234‑1 (MQ=255) agaactggatgagcgggcgcattctggtgctggagaaCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGc < 1:776609‑M1/129‑1 (MQ=255) cGGGCGCTGGGTGAGTTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCAAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCAt < 2:1022942/159‑1 (MQ=255) cGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTGGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTc < 2:329905/157‑1 (MQ=255) gcgggcgcattctggtgctggagaacctggcccaggacatcggccagcaaggcgccggcgacaccctggcagggctgatcgagcagccgtcctacacgcgtaatttcctgttcacctacctgggccaggTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCt < 1:776609‑M2/37‑1 (MQ=255) ggCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGa > 2:714796/1‑193 (MQ=255) cgcTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAg > 2:2250/1‑140 (MQ=255) gCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAgg < 1:1013785/226‑1 (MQ=255) ccGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGCTCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACActgct < 2:372532/158‑1 (MQ=255) gtggcctggccGAGGTAGGTGAAGAGGAAATTACGCGGGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCGCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTc < 2:55547/134‑1 (MQ=255) GGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGGTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGActg < 2:710653‑M1/169‑1 (MQ=255) gtgggaggtGAGCAGGAAATTACGCGTGGAGGACGGGTGCTCGATCAGCGCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTg < 2:35271/130‑1 (MQ=255) cggccagcaaggcgccggcgacaccctggcagggctgatcgagcagccgtcctacacgcgtaatttcctgttcacctacctgggccaggTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATcc < 2:296032‑M2/31‑1 (MQ=255) aCAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGAGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGGCAGTGCACCg > 2:184896/1‑149 (MQ=255) agcaaggcgccggcgccaccctggcagggctgatcgagcagccgtcctacacgcgtactttcctgttcacctacctgggccagcTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACActgctg < 1:978908‑M2/48‑1 (MQ=255) tACGCGTGTCGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGca < 2:118561/117‑1 (MQ=255) cgcgTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCg < 1:1023851/182‑1 (MQ=255) gcgTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCa < 1:900366/186‑1 (MQ=255) tgtAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAgg < 2:629709/185‑1 (MQ=255) ggACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGCCAAAACCa < 2:1052851/221‑1 (MQ=255) cGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGGCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCa < 2:697318/96‑1 (MQ=255) ctCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGat > 1:561112/1‑144 (MQ=255) ctCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGat < 2:561109/144‑1 (MQ=255) tCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGtt > 1:477284/1‑179 (MQ=255) tCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTa < 2:68002/182‑1 (MQ=255) gATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTgg > 1:1009693/1‑148 (MQ=255) gcAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGt < 2:918786/173‑1 (MQ=255) cTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGCCAAAACCACGACGCCGCAg < 2:427581/212‑1 (MQ=255) tGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGCCAAAACCACGACGCCGCAGGCGCTGAGCAGGAt > 2:592214/1‑225 (MQ=255) cAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATTTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACActgctg < 2:1072289/91‑1 (MQ=255) gtcctacacgcgtaattccccgttcccctacctgggccaggTCCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCAcc < 2:917133‑M2/62‑1 (MQ=255) tCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAgg < 2:542590/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAgg > 1:542593/1‑150 (MQ=255) gCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGGCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATg < 2:388054/133‑1 (MQ=255) gcgcCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGCCAAAACCACGACGCCGCAGGCGCTGAGCAGGATCTTGTGGCGAAATTTCAGGTTCATGtt < 1:714799/236‑1 (MQ=255) cgcCTTGCTGGCCGATGTCCTGAGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGCCAAAACCACGACGCCGCAGGCGCTGAGCAGGATCTTGTGGCGAAATTTCAGGTTCATGttt < 1:575378/236‑1 (MQ=255) cTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGCCTGCTGCACCAAGGCTTcca > 2:40769/1‑109 (MQ=255) gCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGCCAAAACCACGACGCCGCAGGCGCTGAGCAGGATCTTGTGGCGAAATTTCAGGTTCATGTTTCGAGACCtt < 1:967883/235‑1 (MQ=255) gTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGCCAAAACCACGACGCCGCAGGCGCTGAGCAGGATATTGTGGCGAAATTTCAGGtt > 2:752234/1‑213 (MQ=255) gccaggTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGCCAAAACCACGACGCCGCAGGCGCTGAGCAGGATCTTGTGGCGACATTTCAGGGTCATGTTTCGAGACCTTGAGc > 1:98730‑M2/7‑226 (MQ=255) aggTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGCCAAAACCACGACGCCGCAg < 1:1085037‑M2/165‑1 (MQ=255) cgTTCTCCAGCACGAGAATGCGCCCGCGCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCGCCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGt < 2:979388‑M2/121‑1 (MQ=255) gTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGc < 1:127532‑M2/146‑1 (MQ=255) ttCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGt < 2:687966/131‑1 (MQ=255) | ACTGCACCCTGGTACGGGGCGGTCAGCACGGTCTGCCCGGCGTTGGCGGCGGCGCCATACCAAGGGCGCTGGCGCGGGTCGTAACCGGCGGGCATCTGGGCATCCGGGCGCTGGGTGAATTCGCCGTTGGCCTGGCCCAGGTAGGTGAACAGGAAATTACGCGTGTAGGACGGCTGCTCGATCAGCCCTGCCAGGGTGTCGCCGGCGCCTTGCTGGCCGATGTCCTGGGCCAGGTTCTCCAGCACCAGAATGCGCCCGCTCATCCAGTTCTGCACACTGCTGGCGGTCAGTGCACCGGACTGCTGCACCGAGGCTTCGATATTCTGGCGGATGGTATTGCGTTGCAGGTAGTCGTTGTAGAGCGTGAACAGGGCAAATGCCAAAACCACGACGCCGCAGGCGCTGAGCAGGATCTTGTGGCGAAATTTCAGGTTCATGTTTCGAGACCTTGAGC > AE015451/2566470‑2566923 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |