| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3158934 = | 42 (0.730) | 5 (0.090) | 5/326 | NT | 11.0% | coding (953/2097 nt) | opuA | glycine betaine ABC transporter, ATPase/permease fusion protein |
| ? | AE015451 | 3158952 = | 41 (0.750) | coding (971/2097 nt) | opuA | glycine betaine ABC transporter, ATPase/permease fusion protein | |||||
ATCGCCGTCTTGCGCGGTGGTCGGCTGATTCAGGTCGGCACCCCGGGTGAATTGCTTGAACACCCGGCGGACGAAGGCGTGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGG > AE015451/3158717‑3159170 | aTCGCCGTCTTGCGCGGTGGTCGGCTGATTCAGGTCGGCACCCCGGGTGAATTGCTTGAACACCCGGCGGACGAAGGCGTGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTgccgc > 1:1029889/1‑236 (MQ=255) accagtagcagcgccaagggtaaagcgacacccggtgagtcacggccgtggccgtgcaggctcacccaagcacaacccaagcgattgaccagcagcactgccagtgctgtggccgatagccaccccgccccctcgcgccacgcgccagcaagcatggccagggccgccacctccaccagcagcgccagccagaaccaaccacctcgtccggcggcagcgagcgctgccgCCGGAc < 1:686716‑M2/6‑1 (MQ=255) tCGGCTGATTCAGGTCGGCACCCCGGGTGAATTGCTTGAACACCCGGCGGACGAAGGCGTGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTct > 1:700337/1‑236 (MQ=255) ttCAGGTCGGCACCCCGGGTGAATTGCTTGAACACCCGGCGGACGAAGGCGTGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAggt < 2:831012/218‑1 (MQ=255) ttCAGGTCGGCACCCCGGGTGAATTGCTTGAACACCCGGCGGACGAAGGCGTGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGgcg < 1:1072753/236‑1 (MQ=255) ccccGGGTGAATTGCTTGAACACCCGGCGGACGAAGGCGTGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAg > 1:984583/1‑236 (MQ=255) gcccGGCGGACGGAGGCGGGGCGGGTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTgccgcc < 1:192170/175‑1 (MQ=255) gcggACGAAGGCGTGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAggt < 1:520419/180‑1 (MQ=255) tcacccaagcacaacccaggcgattgaccagcagcactgccagtgctgtggccgatagccaccccgccccctcgcgccacgcgccagcaagcatggccagggccgccacctccaccagcagcgccagccagaaccaaccacctcgtccggCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCtg > 1:651659‑M1/151‑234 (MQ=255) gCGTGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCtggcgcgtggcgc > 1:909230/1‑236 (MQ=255) ggTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCtggtg > 1:9245/1‑190 (MQ=255) aGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAg < 1:1043344/179‑1 (MQ=255) ggcGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTc < 2:338754/145‑1 (MQ=255) agtgctgtggccgatagccaccccgccccctcgcgccacgcgccagcaagcatggccagggccgccacctccaccagcagcgccagccagaaccaaccacctcgtccggcggcagcgagcgctgccgCCGGACGAGGTGGTTGGTTctggctg < 2:449556‑M2/26‑1 (MQ=255) cGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGtg > 1:480365/1‑236 (MQ=255) cGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGGGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGAGCGACAATCCGTTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGCGGTTGGTTCTGGCGGgcgcgg > 2:320738/1‑150 (MQ=255) aTTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTgctgct > 1:929705/1‑236 (MQ=255) aTTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGGGGAGGTGGCGGCCCTg > 1:819024/1‑168 (MQ=255) cgtcgtCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCCCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGAGCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTctggc < 2:726672/135‑1 (MQ=255) gtcgtcTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCa > 1:821983/1‑236 (MQ=255) ccaccccgccccctcgcgccacgcgccagcaagcatggccagggccgccacctccaccagcagcgccagccagaaccacccacctcgtccggcggcagcgagcgctgccgCCGGACGAGGTGGTTGGTTctggc < 2:794961‑M2/24‑1 (MQ=255) ccaccccgccccctcgcgccacgcgccagcaagcatggccagggccgccacctccaccagcagcgccagccagaaccaaccacctcgtccggCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTggccct < 1:27098‑M1/76‑3 (MQ=255) tcgtcTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCAt > 2:43692/1‑167 (MQ=255) tAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGGGCTGCTGGTCAATc > 2:362824/1‑233 (MQ=255) aGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTctggctg < 2:901482/122‑1 (MQ=255) tGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCCTTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCCCGCTGCCGCCGGCCGCggcg > 2:39322/1‑103 (MQ=255) tGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGc > 2:997801/1‑148 (MQ=255) tGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCa > 1:291439/1‑206 (MQ=255) aGCGAGCCAGCGTCGGCCGGGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCtggcgc < 2:213408/158‑1 (MQ=255) cagcaagcatggccagggccgccacctccaccagcagcgccagccagaaccaaccacctcgtccggcggcagcgagcgctgccgCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCCTGGGTTGTGCTTGGGTGa > 1:651659‑M2/85‑234 (MQ=255) cGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGGGGGGGCgggggg > 2:249997/1‑167 (MQ=255) gTCGGCCGCGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGgcg < 1:318933/106‑1 (MQ=255) agggccagggccgccacctccaccagcagcgccagccagaaccaaccacctcgtccggcggcagcgagcgctgccgCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTgg < 1:27098‑M2/92‑1 (MQ=255) ggCCGAGCTGCCCGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAggt < 2:430034/85‑1 (MQ=255) ggAGCTGCCAGCGCGATGGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCggg < 2:577603/193‑1 (MQ=255) cTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCtt < 2:984580/200‑1 (MQ=255) ccAGCGCGATCGGCAATCCAGTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCtt < 1:272305/208‑1 (MQ=255) ggACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGcacgg < 1:282199/213‑1 (MQ=255) tggggttCGCCAAGGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCGGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGc < 2:330955/145‑1 (MQ=255) cagccagaaccaaccacctcgtccggCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACt < 2:449556‑M1/127‑1 (MQ=255) gccagaaccaaccacctcgtccggCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGGTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTgg < 2:794961‑M1/110‑1 (MQ=255) ttCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTg > 1:945291/1‑236 (MQ=255) tCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTg < 1:997804/183‑1 (MQ=255) ccAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGCGGTGGCGGCCCTGGCCAtgcttg > 2:57629/1‑98 (MQ=255) ccAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGgc > 2:411253/1‑234 (MQ=255) cAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCCGCCGCCGGACGAGGTTGTTGCGTCTGGCTGGCGCTGCtgg > 2:45653/1‑70 (MQ=255) aaaGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCgct > 1:710734/1‑235 (MQ=255) aGCGGGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGTGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATc < 1:1016100/160‑1 (MQ=255) gtTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACt < 2:909227/234‑1 (MQ=255) ttGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACt < 2:1029886/233‑1 (MQ=255) gtccggCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGt < 1:686716‑M1/229‑1 (MQ=255) gggCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTg > 1:610298/1‑235 (MQ=255) gCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGGGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTc < 1:43693/146‑1 (MQ=255) GCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCTGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAgg > 1:746270‑M1/1‑235 (MQ=255) AGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGGACTGGCAg < 1:259998‑M1/128‑1 (MQ=255) cgctgccgCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTgg < 2:610295‑M2/198‑1 (MQ=255) ctgccgCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCgg < 1:858838‑M2/180‑1 (MQ=255) ctgccgCCGGACGAGGTGGGTGGTTCGGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGctgctg < 2:115335‑M2/122‑1 (MQ=255) gCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCtt < 2:1086423‑M2/144‑1 (MQ=255) | ATCGCCGTCTTGCGCGGTGGTCGGCTGATTCAGGTCGGCACCCCGGGTGAATTGCTTGAACACCCGGCGGACGAAGGCGTGGCGGTTTTCTTCGACGAGCGGCCGCATATCGGCCCGAGCATTGCGTCGTCTAGCGACGAGGTGCTCAGCGAGCCAGCGTCGGCCGAGCTGCCAGCGCGATCGACAATCCATTGGATTCGCCAAAGCGTGTTGGGCCCGGCAGCGCTCGCTGCCGCCGGACGAGGTGGTTGGTTCTGGCTGGCGCTGCTGGTGGAGGTGGCGGCCCTGGCCATGCTTGCTGGCGCGTGGCGCGAGGGGGCGGGGTGGCTATCGGCCACAGCACTGGCAGTGCTGCTGGTCAATCGCTTGGGTTGTGCTTGGGTGAGCCTGCACGGCCACGGCCGTGACTCACCGGGTGTCGCTTTACCCTTGGCGCTGCTACTGGTGAGTCAGG > AE015451/3158717‑3159170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |