New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3490603 | 59 (1.020) | 4 (0.070) | 4/324 | NT | 6.4% | coding (788/2637 nt) | clpV | Protein ClpV1 |
? | AE015451 | = 3490689 | 62 (1.140) | coding (702/2637 nt) | clpV | Protein ClpV1 |
CGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAG > AE015451/3490454‑3490904 | cgATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTc > 1:550635/1‑236 (MQ=255) gAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCtgc > 1:600968‑M2/1‑232 (MQ=255) aCAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCtgccg < 1:926453‑M2/235‑6 (MQ=255) cTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATc > 1:821470/1‑235 (MQ=255) ttGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGCGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGt > 1:446149/1‑218 (MQ=255) ttGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGCGGATCGGGGTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAg > 1:786933/1‑221 (MQ=255) ttGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCAt > 2:834196/1‑233 (MQ=255) ttGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCt < 1:866188/235‑1 (MQ=255) ttGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTg > 1:65290/1‑236 (MQ=255) ttGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTg > 1:49348/1‑236 (MQ=255) ccaGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCGGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAAc < 2:483986/233‑1 (MQ=255) caGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCtgccggcggtgctcaaggacgttg > 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ttGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCtt > 1:672285/1‑235 (MQ=255) aCCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCtgccggcggtgctcaaggac > 2:608431‑M2/1‑156 (MQ=255) ccGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGgc < 1:415375/236‑1 (MQ=255) ggCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGgc < 2:926450/234‑1 (MQ=255) tgggCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGGAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGGTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGa > 2:419184/3‑163 (MQ=255) cGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCtt < 2:1034760/233‑1 (MQ=255) tGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGgc > 2:738999/1‑224 (MQ=255) tGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGgc < 1:739002/224‑1 (MQ=255) tGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTaa < 1:784893/235‑1 (MQ=255) gCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCAcc < 2:408296/193‑1 (MQ=255) cAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGGGAGGATGTc > 1:134757/1‑153 (MQ=255) ggTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCcggcggcgg < 1:950826/140‑1 (MQ=255) ggTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCcggcggcgg > 2:950823/1‑140 (MQ=255) 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cTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTaa < 2:869878/150‑1 (MQ=255) ttCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGc < 1:96445/236‑1 (MQ=255) tCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCt < 1:563150/236‑1 (MQ=255) aCCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTaa < 1:1068105/145‑1 (MQ=255) aCCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTaa > 2:1068102/1‑145 (MQ=255) cACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCggcgccagt < 1:564808/235‑8 (MQ=255) gTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGCCCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTgg < 1:603377/235‑1 (MQ=255) ttttGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGc < 2:308016/183‑1 (MQ=255) ttGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGCGGCTCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGc < 1:196205/212‑1 (MQ=255) cggccccGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGgcg < 1:252319/233‑1 (MQ=255) cGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTccac < 1:834199/235‑1 (MQ=255) ccGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTgg > 1:40648/1‑178 (MQ=255) ccGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCGCCAg > 1:248892/1‑235 (MQ=255) cGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACGTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCGTCGCGGGCGCCTTGGGTAAGGTTGAcc > 2:906287/1‑121 (MQ=255) tgATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAAc < 2:250605/58‑1 (MQ=255) ggTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGAGGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAgcgc < 2:225988/127‑1 (MQ=255) | CGATGAACAGGATGATCGGGTGCAGGCTGCGCTTGACCTCTTCGATCACAGCCTTGAGGCGGTTCTCGAACTCGCCCTTGACCCCGGCGCCGGCCTGTAACAGGCCCAGGTCGAGGGTGTGCAGGGCAACGTCCTTGAGCACCGCCGGCACGTCACCCTGGGCGATGCGCAGCGCCAGGCCTTCGACCACGGCGGTTTTGCCGACCCCGGCTTCGCCCGTGAGGATCGGGTTGTTCTGCCGGCGGCGGGTGAGGATGTCGACCATCTGCCGTACTTCGAACTCACGGCCCAGCACCGGGTCGATGCGGCCTTCGCGGGCGCTTTGGGTAAGGTTGACCGTGTACTGGTCCAGCGCCGGGGTCTTGCCGCTGGCCTTGCTCGACGTGCTCACTGGCGCCGCTGGGCTGGCCAGCGGGCTGGCCTGCCTGGACTCGGCGCTACCCTCCACCAG > AE015451/3490454‑3490904 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |