New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3779614 | 48 (0.830) | 4 (0.070) | 4/334 | NT | 7.6% | coding (65/1575 nt) | nikA | nickel ABC transporter periplasmic binding protein |
? | AE015451 | = 3779631 | 51 (0.910) | coding (82/1575 nt) | nikA | nickel ABC transporter periplasmic binding protein |
GCCACCCGCCGATCGATGACGTCGAGCAGCTCTTCATCCAGCGTGATGGTGATTCGTTGCATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCAAGACCTACACGTTCACCCTTCGCGACGGCGTGCGCTTCAGC > AE015451/3779401‑3779861 | gCCACCCGCCGATCGATGACGTCGAGCAGCTCTTCATCCAGCGTGATGGTGATTCGTTGTATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCgcgc < 1:1042711‑M2/235‑5 (MQ=255) gCCACCCGCCGATCGATGACGTCGAGCAGCTCTTCATCCAGCGTGATGGTGATTCGTTGCATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCgcgca > 1:476708‑M2/1‑231 (MQ=255) gccgATCGATGACGTCGAGCAGCTCTTCATCCAGCGTGATGGTGATTCGTTGCATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGc < 1:490135/236‑1 (MQ=255) gACGTCGAGCAGCTCTTCATCCAGCGTGATGGTGATTCGTTGCATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGc < 2:102879/235‑1 (MQ=255) ggTGATTCGTTGCATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCgcgcacgcagcaagaagaaggaggccccacagggcgggctttcgtttacca > 1:386592‑M2/1‑184 (MQ=255) tGATTCGTTGCATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCggg > 2:883524/1‑235 (MQ=255) gATTCGTTGCATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGc < 1:379411/202‑1 (MQ=255) cGTTGCATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAg > 2:263357/1‑188 (MQ=255) cGTTGCATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTg > 1:974298/1‑203 (MQ=255) gCATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAACGCCGGGCCGCTCGAcc > 1:1022824/1‑236 (MQ=255) aTTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGAc > 1:395702/1‑233 (MQ=255) tCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTa < 2:184924/200‑1 (MQ=255) tAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGTGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAg < 2:573801/180‑1 (MQ=255) gatTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCgcgcacgcagc > 1:581017‑M2/1‑149 (MQ=255) atcatACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGc < 1:1036084/235‑1 (MQ=255) agaCCCACCACACTTTCGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGa < 1:9966/217‑1 (MQ=255) aCCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGCAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGCGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGCGTACTCCTGGCCtgtg > 1:847847/1‑174 (MQ=255) ccacacCACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCTGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCgcgcacgcagcaagaagaaggaggccccacagg > 2:726798‑M2/1‑128 (MQ=255) cacTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGCGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGCATGCCGGGCCGCTCGACCcg > 2:217710/1‑187 (MQ=255) cacTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGcg > 1:1003101/1‑179 (MQ=255) cacTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGCCCCGCGTGGCTATTCCCCCaa > 1:196148/1‑204 (MQ=255) cacTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCa > 1:243982/1‑207 (MQ=255) acTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCgc > 2:273873/1‑181 (MQ=255) acTGTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGc < 1:19294/170‑1 (MQ=255) cTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCt > 2:441297/1‑171 (MQ=255) tACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTAc < 1:761778/204‑1 (MQ=255) aCGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCCGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCgcgcacgcagcaagaagaaggaggccccacagggcgggctttcgtttaccagg > 2:242644‑M2/1‑111 (MQ=255) gCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCta > 1:894224/1‑235 (MQ=255) ccTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCcg > 2:330282/1‑172 (MQ=255) gccGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGcc < 1:312947/205‑1 (MQ=255) aGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCGGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGAGGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAAccc < 1:555846/213‑1 (MQ=255) ggggCCGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGcc < 2:247029/133‑1 (MQ=255) ggggACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTAc < 1:883527/235‑1 (MQ=255) aGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTccccc > 2:183377/1‑165 (MQ=255) tgtgAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGAt < 1:1050645/171‑1 (MQ=255) agcagcagcCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATAccg < 1:720953/210‑1 (MQ=255) cagcagcCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAAccc > 2:956202/1‑192 (MQ=255) cagcagcCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAAccc < 1:956205/192‑1 (MQ=255) caaGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCt < 1:213664/166‑1 (MQ=255) aaaGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTc < 1:209856/135‑1 (MQ=255) cgcccTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCAtggctgg > 2:1056330/1‑212 (MQ=255) ccTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGgacgac < 1:672260/235‑1 (MQ=255) cctTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCaa > 2:362026/1‑228 (MQ=255) cctTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCAGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAAccc < 1:468237/154‑1 (MQ=255) cttcttGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCAAGACCTACACGt > 1:1021160/1‑235 (MQ=255) ttGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGACGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCa < 2:324780/111‑1 (MQ=255) ctgcGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGc < 2:8341/76‑1 (MQ=255) tgcgtgcgCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGCCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCt > 2:17568/1‑67 (MQ=255) gcgtgcgCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCAAGACCTACACGTTCACCCTTcg > 1:996385/1‑236 (MQ=255) gcgtgcgCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGCTGCGCTATACCGCCGCGGGTa > 2:337510/1‑166 (MQ=255) cgtgcgCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCAAGACCTACACGTTCACCCTTcg > 1:510813/1‑235 (MQ=255) gctgctGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTAc < 1:178453/161‑1 (MQ=255) gctgctGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTAc > 2:178451/1‑161 (MQ=255) gctgctGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCAtc > 2:657008/1‑172 (MQ=255) gctgctGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCAAGAc < 2:834589/212‑1 (MQ=255) tgctgcGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCAAGACCTACACGTTCACCCTTCGCGACGGc < 1:590032/235‑1 (MQ=255) gcCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCAAGACCTACACGTTCACCCTTCGCGACGGCGTgcg < 2:570276/234‑1 (MQ=255) cAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCAAGACCTACACGTTCACCCTTCGCGACGGCGTGCGCTTCAGc > 1:430283/1‑235 (MQ=255) aGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCAAGACCTacac < 1:787567/203‑1 (MQ=255) aGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCAAGACCTacac > 2:787564/1‑203 (MQ=255) ccgcgccgcCGCGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAAccc < 2:148236/118‑1 (MQ=255) ccgcgccgcCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCg < 1:152044/181‑1 (MQ=255) ccgcgccgcCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCCGGCTGAGGCCTGGCAg > 2:56734/1‑175 (MQ=255) | GCCACCCGCCGATCGATGACGTCGAGCAGCTCTTCATCCAGCGTGATGGTGATTCGTTGCATTCTGTAACTTCCGGTAAGATGATTTCACGTAGACATCATACCCACCACACTTTAGCCTACGGCCTCCGTGAAAGTGGGGGACGCAGTGTGAAGCAGCAGCCTGGTAAACGAAAGCCCGCCCTGTGGGGCCTCCTTCTTCTTGCTGCGTGCGCTGCTGCGCCGGCCAGCCGCGCCGCCGAGCAAGGGCCGCAGCTGGTGTACTCCTGGCCTGTGAATGCCGGGCCGCTCGACCCGCGTGGCTATTCCCCCAACCAGATGTACGCCCAGGCCATGGTCTATGAACCCCTGGTGCGCTATACCGCCGCGGGTACGCTGGAGCCATGGCTGGCTGAGGCCTGGCAGGTTTCGGACGACGGCAAGACCTACACGTTCACCCTTCGCGACGGCGTGCGCTTCAGC > AE015451/3779401‑3779861 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |