New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3794442 = | 40 (0.690) | 5 (0.090) | 5/326 | NT | 11.0% | coding (81/1191 nt) | PP_3355 | Beta‑ketothiolase |
? | AE015451 | 3794568 = | 43 (0.780) | intergenic (‑46/+2) | PP_3355/fcs | Beta‑ketothiolase/feruloyl‑CoA‑synthetase |
ATGGCGTGGCAGCATGTAGGCGTCGAAGCTGGCCTGAGCCATGCTGCCGGCGAGCACACTGTCTACCGCCTGAGGGGCGGCAGCTGCACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCACGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTCCAGCCAGTCAGCGAACCAACTGCG > AE015451/3794340‑3794800 | aTGGCGTGGCAGCATGTAGGCGTCGAAGCTGGCCTGAGCCATGCTGCCGGCGAGCACACTGTCTACCGCCTGAGGGGCGGCAGCTGCACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAgg > 1:559634/1‑236 (MQ=255) ggCGTGGCAGCATGTAGGCGTCGAAGCTGGCCTGAGCCATGCTGCCGGCGAGCACACTGTCTACCGCCTGAGGGGCGGCAGCTGCACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGcc > 1:138204/1‑236 (MQ=255) ggCGTGGCAGCATGTAGGCGTCGAAGCTGGCCTGAGCCATGCTGCCGGCGAGCACACTGTCTACCGCCTGAGGGGCGGCAGCTGCACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGc > 1:594634/1‑235 (MQ=255) ggCGTGGCAGCATGTAGGCGTCGAAGCTGGCCTGAGCCATGCTGCCGGCGAGCACACTGTCTACCGCCTGAGGGGCGGCAGCTGCACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGGGCGCACCATCTGGACGCTGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGc > 1:349298/1‑235 (MQ=255) cagcggcgcgccgctcaggtcgaggcgctgtaccgtggcgaagaccccgacgcattgcacgccaaggtgcggccttgagtgcggccgggctgtgcaccgtcttcgaggacacggccatcgtccagatggtgcgcacgccctgggtcgacctgggtggcgcattggccgcgatctcgcccatcgacctgggcattcaggccggccgcAc < 1:468108‑M2/2‑1 (MQ=255) tGGCCTACGCCATGCTGCCGGCGAGCACACTGTCTACCGCCTGAGGGGCGGCAGCTGCACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGGGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGt < 2:827979/221‑1 (MQ=255) gcgccgctcaggtcgaggcgctgtaccgtggcgaagcccccgacgcattgcacgccaaggtgcggccttgagtgcggccgggctgtgcaccgtcttcgaggacacggccatcgtccagatggtgcgcacgccctgggtcgacctgggtggcgcattggccgcgatctcgcccatcgacctgggcattcaggccggccgcACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGt < 1:183051‑M2/37‑1 (MQ=255) gTCTACCGCCTGAGGGGCGGCAGCTGCACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGc < 1:405033/192‑1 (MQ=255) accccgacgcattgcacgccaaggtgcggccttgagtGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGGCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGgcgc < 1:183051‑M1/199‑1 (MQ=255) gggggCGGCAGCTGCACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCAcc < 2:205922/170‑1 (MQ=255) aGGGGCGGCAGCTGCACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACa > 2:811165/1‑208 (MQ=255) gCTGCACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCACGgc < 1:695167/235‑1 (MQ=255) cACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTgcagc < 1:225499/226‑1 (MQ=255) 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GGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGc < 2:895861‑M1/133‑1 (MQ=255) GGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATg < 2:1078777‑M1/152‑1 (MQ=255) GGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGt < 2:691212‑M1/161‑1 (MQ=255) GGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAgcggcg < 1:871892‑M1/196‑1 (MQ=255) GGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAgcggcg > 2:871889‑M1/1‑196 (MQ=255) GGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAgcggc < 2:362335‑M1/195‑1 (MQ=255) GGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCACGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCt < 2:911098‑M1/233‑1 (MQ=255) GGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCACGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGt < 1:171031‑M1/236‑1 (MQ=255) GGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGGCTTCGCCACGGGACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGcgcc < 1:107524‑M1/200‑1 (MQ=255) GGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGGCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGgcgc < 1:98990‑M1/197‑1 (MQ=255) GGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGGGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCAc < 1:105980‑M1/210‑1 (MQ=255) GCCTGAATGCCCAGGTTGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGCTCTTCGCCAc < 1:369406‑M1/165‑1 (MQ=255) ggTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGAACTGAGCGgcgc > 1:827192/1‑179 (MQ=255) 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gcgcCCCCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCACGGCGCGCtgattg < 2:344853/179‑1 (MQ=255) gcgcgcacgccctgggtcgacctgggtggcgcattggccgcgatctcgcccatcggcctgggcattcaggccggccgcACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAgc < 1:933578‑M2/54‑1 (MQ=255) gACCCAGGGCGTGCGCGCCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAgcg < 2:941022/135‑1 (MQ=255) aGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCACGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGAt > 1:825914/1‑231 (MQ=255) aGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCACACTCCAAGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGTGTCTTCGCCa > 2:969224/1‑106 (MQ=255) 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ggccgcACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCACGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCg > 2:918617‑M2/7‑163 (MQ=255) cgcACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCACGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTCCAGCCAGt > 2:795963‑M2/4‑220 (MQ=255) cgcACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCACGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTCCAGCCAGTCAg > 2:655203‑M2/4‑223 (MQ=255) cgcACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCACGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTCCAGCCAGTCAGCGAACCAACTgcg < 1:458850‑M2/233‑1 (MQ=255) | ATGGCGTGGCAGCATGTAGGCGTCGAAGCTGGCCTGAGCCATGCTGCCGGCGAGCACACTGTCTACCGCCTGAGGGGCGGCAGCTGCACGTGCCAGCACCGCGCGGCCGGCCTGAATGCCCAGGTCGATGGGCGAGATCGCGGCCAATGCGCCACCCAGGTCGACCCAGGGCGTGCGCACCATCTGGACGATGGCCGTGTCCTCGAAGACGGTGCACAGCCCGGCCGCACTCAAGGCCGCACCTTGGCGTGCAATGCGTCGGGGTCTTCGCCACGGTACAGCGCCTCGACCTGAGCGGCGCGCCGCTGCAGCACGGCGCGCTGATTGATCGAGCCCTTGTCGGTGATTTCACCGGCGTCGATCGACGGCGGCTCGGCCAGCAGCGACAGCCATTCGATACGGCTGGCGTTGCCTTGGGCATCGCGGTTCAAGCGCTCCAGCCAGTCAGCGAACCAACTGCG > AE015451/3794340‑3794800 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |