New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3954146 | 39 (0.680) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 7.8% | coding (377/1977 nt) | PP_5606 | conserved exported protein of unknown function with YVTN beta‑propeller repeat |
? | AE015451 | = 3954204 | 34 (0.620) | coding (319/1977 nt) | PP_5606 | conserved exported protein of unknown function with YVTN beta‑propeller repeat |
TCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGTTCGCCGCCGGCCAATGGCCGGGCCTCGAACTCCACGTTCACGCCGTCCCGGCTGAGCCGGTGCAAGGCCTGCGAGCCACCC > AE015451/3953987‑3954406 | tcgCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTg < 1:234982/236‑1 (MQ=255) gCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCAGGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCcccggccgctgctcgacct > 1:240489‑M2/1‑216 (MQ=255) gtggCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCg < 1:365714/235‑1 (MQ=255) gggCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCGCCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGc < 1:344473/207‑1 (MQ=255) ggCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCg < 1:709820/235‑1 (MQ=255) cTGGCAGCTGGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTg > 2:658587/1‑198 (MQ=255) cTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCg > 1:372600/1‑228 (MQ=255) gCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTgg > 2:647311/1‑217 (MQ=255) ccccccACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGa < 1:434603/235‑1 (MQ=255) ccccACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCgct > 2:74536/1‑178 (MQ=255) aCCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGaa < 1:389865/236‑1 (MQ=255) acCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGa > 1:482195/1‑194 (MQ=255) ggTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCCGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCgc > 2:260564/1‑147 (MQ=255) aCTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGa > 2:801580/1‑220 (MQ=255) cAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTCGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTGGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCgggg < 1:130609/164‑1 (MQ=255) ggCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGtc > 2:835499/1‑235 (MQ=255) tCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCcc < 1:698636‑M2/112‑3 (MQ=255) tCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCcc > 2:698633‑M2/1‑110 (MQ=255) tCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGcccccc > 2:206861/1‑150 (MQ=255) tCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCgg > 2:305286/1‑170 (MQ=255) tCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGTTcgc > 1:695669/1‑235 (MQ=255) ttCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGTTCGCCGCCGGc > 1:1022315/1‑236 (MQ=255) ttCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCGCTTGAAAAACAGCGCGACCAGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTAGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGTTCGccgccg > 2:575478/1‑234 (MQ=255) catcagcaAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGc > 2:785988/1‑164 (MQ=255) cagcaAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTgg > 1:105921/1‑197 (MQ=255) cagcaAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGTTCGCCGCCGGc > 2:789699/1‑228 (MQ=255) gcagTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGTTcgcc < 1:871953/214‑1 (MQ=255) agTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGAt > 2:13380/1‑184 (MQ=255) gTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCCGTTCGCCGCCGGCCAATGGCCGGGCCTCGACCTc > 2:1053313/1‑234 (MQ=255) gcagcGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGTTCGCCGCCGGCCAATGGCCGGGCCTCGAACTCCACGTTCACGcc > 1:943149/1‑235 (MQ=255) gctgctCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCCTACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCCTGAAGCGGATGTTGGCGCAGCCGCCCTCCTTCCGTTCGCCGCCGGCCAATGGCCGGGCCTc > 2:44380/1‑198 (MQ=255) gctgctCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTgg > 1:137983/1‑115 (MQ=255) tctTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGTTCGCCGCCGGCCAATGGCCGGGCCTCGAACTCCACGTTCACGCCGTCCCGGCTGAGCCGGTGCAAGGc > 1:1024254/1‑235 (MQ=255) aaaCAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCa < 2:357809/158‑1 (MQ=255) aaaCAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCa > 1:357812/1‑158 (MQ=255) gcgcGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCcccggccgctgctcgacctgaacagctacttcttgctgatgc > 2:27208‑M2/1‑34 (MQ=255) gcgcGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCcccggccgctgctcgacctgaacagctacttcttgctgatgc < 1:27209‑M2/76‑43 (MQ=255) cgcgACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGTTCGCCGCCGGCCAATGGCCGGGCCTCGAACTCCACGTTCACGCCGTCCCGGCTGAGCCGGTGCAAGGCCTGCGAGCCAccc < 1:835502/235‑1 (MQ=255) cgACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGTTCGCCGCCGGCCAATgg > 2:487009/1‑169 (MQ=255) cgACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACCGCGCCCGGCCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGa > 2:166934/1‑85 (MQ=255) aCCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGCCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACCGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGCTGTTGGCGAAGCCGCCCTCCtt > 2:291634/1‑146 (MQ=255) | TCGCTGGTGGCCGCCCAGTCCATGGGCCGCCCTGGCAGCTCGATGCGCGCCATGGTGCTGGTCACGCCCCCCACCGACACCGTCGGGTCGATCACTGTCAGGCTGGCGTCATTGTTCAGCATCAGCAAGAAGTAGCTGTTCAGGTCGAGCAGCGGCCGGGCCCCGATGCTGCTCTTGAGAAACAGCGCGACCCGCGCCTTGCAGCTCTGCTCGCGGTCCCCGGCCGGTGCCGACTGCGCCGGGTCGATCCACGCCCCCGGGGCCATACCCGACAGCGGTTGGCCACTGGTCTGGTCGCTGAGCTTGAAGCGGATGTTGGCGAAGCCGCCCTCCTTCAGTTCGCCGCCGGCCAATGGCCGGGCCTCGAACTCCACGTTCACGCCGTCCCGGCTGAGCCGGTGCAAGGCCTGCGAGCCACCC > AE015451/3953987‑3954406 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |