New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4667670 | 41 (0.710) | 6 (0.110) | 6/328 | NT | 13.1% | coding (1436/1854 nt) | nuoL | NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit L |
? | AE015451 | = 4667687 | 40 (0.720) | coding (1453/1854 nt) | nuoL | NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit L |
GCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGGCGCGTTCATGACCTCGCTGTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTGCCTGGGGCTTCGACTGGATCTACGACAAGCTTTTCGTCAAACCGTACCTGCTGATCAGCCAC > AE015451/4667462‑4667917 | gCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGGCGCGTTCATGACCTCGCTGTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGACGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGc > 1:603804/1‑236 (MQ=255) gCCGGCCTGGTAGGCGCGTTCATGACCTCGCTGTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGga > 1:497102/1‑236 (MQ=255) tGGTAGGCGCGTTCATGACCTCGCTGTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAg > 1:885495/1‑218 (MQ=255) tGGTAGGCGCGTTCATGACCTCGCTGTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCAc > 1:980970/1‑235 (MQ=255) ggCGCGTTCATGACCTCGCTGTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGccggcca < 2:382671‑M2/194‑8 (MQ=255) gTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGCGCCATCGCCATCGCCGGt > 1:493216/1‑235 (MQ=255) gTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACCTTCGTCGGCGCCTGGATCCCCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGc < 2:275‑M2/168‑2 (MQ=255) cGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGcc > 2:712856/1‑180 (MQ=255) gCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCg > 2:886925/1‑174 (MQ=255) ccTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCg > 1:859654/1‑221 (MQ=255) tGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCAcg > 2:629984/1‑183 (MQ=255) tGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGgccgcc > 1:776262/1‑236 (MQ=255) ttCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGccggccagcggcgggg < 1:645537‑M2/164‑17 (MQ=255) ccACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGccggccagcggcggggtgatccaggcgc < 1:1056086‑M2/165‑29 (MQ=255) ccACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGccggccagcggcggggtgatccaggcgc > 2:1056083‑M2/1‑137 (MQ=255) gAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCCGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTgccatc < 1:6409/186‑1 (MQ=255) aaGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCACCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCaa < 2:953282/154‑1 (MQ=255) gACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCa < 1:457669/236‑1 (MQ=255) cGAAGCCCACGCTGGCCCCGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCa < 2:955976/233‑1 (MQ=255) cACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCGCGCGCTGGAGATCACCTCGGGTgccatcgccat < 2:484718/173‑1 (MQ=255) cTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGGGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAg > 1:125229/1‑223 (MQ=255) tGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGGCGCTGGCCGGTGTGCGGCCGGAAAGCGccggccagcggcggggtgg < 2:887776‑M2/126‑20 (MQ=255) gCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGGCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCAt < 1:918373/235‑1 (MQ=255) gCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCa < 2:821105/225‑1 (MQ=255) tCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAgc < 1:751534/212‑1 (MQ=255) tCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAgc > 2:751531/1‑212 (MQ=255) ccACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCCTGcctg > 2:149939/1‑103 (MQ=255) accTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGTCTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGTTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTg < 2:561291/234‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGCCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACGGTGGCATCGGTCGCGTCCTg > 2:763064/1‑234 (MQ=255) gCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCg < 1:436908/235‑1 (MQ=255) ccGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCg < 1:741200/234‑1 (MQ=255) gggCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGccatcgccatcg < 1:690085/140‑1 (MQ=255) cGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTggtggt < 1:807107/236‑1 (MQ=255) tGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGgaga > 2:363728/1‑111 (MQ=255) gATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCctg > 2:304256/1‑142 (MQ=255) aTCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCAGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTg < 1:575079/235‑1 (MQ=255) tGCGGTCGCCTTTCGCCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGccggccagcggcggggtgatccaggcgccgacgaaagtcgacagc > 2:645534‑M2/1‑63 (MQ=255) gcgcCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGccggccagcggcggggtgatccaggcgccgacgaaag > 1:887779‑M2/1‑45 (MQ=255) gcgcCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTGCCTGGGGCTTCGACTGGAt > 2:592088/1‑232 (MQ=255) ttccggcagcACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTGCCTGGGGCt > 2:710112/10‑221 (MQ=255) cccGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTgg < 2:294103/110‑1 (MQ=255) ccgccgCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGcc < 2:405721/150‑1 (MQ=255) ccgccgCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTGCCTGGGGCTTCGACTGGATCTACGACAAGCTTTTCGt < 1:592091/236‑1 (MQ=255) ccgccgCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTGCCTGGGGCTTCGACTGGATCTACGACAAGCTTTTCGt < 1:971283/236‑1 (MQ=255) cGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCa < 2:569567/44‑1 (MQ=255) gtgtGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTGCCTGGGGCTTCGACTGGATCTACGACAAGCTTTTCGTCAAACCGTACctg < 1:710115/236‑1 (MQ=255) tgctgcCGGAAAGCGCCGGCCATGCCCGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCa < 2:965668/129‑1 (MQ=255) gctgcCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTGCCTGGGGCTTCGACTGGATCTACGACAAGCTTTTCGTCAAACCGTACctgc > 2:586382/1‑233 (MQ=255) ctgcCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCAc < 1:436051/42‑1 (MQ=255) aaaGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTGCCTGGGGCTTCGACTGGATCTACGACAAGCTTTTCGTCAAACCGTACCTGCTGATCAGCcac < 1:273662/236‑1 (MQ=255) cgcgcCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCGCCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTGCCTGGGGCTTCGACTGGATCTACGACAAGCTTTTCGTCa < 1:201057/210‑1 (MQ=255) cgcCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTGCCTGGGGCTTCGACTGGATCTACGACAAGCTTTTCGTCAAACCGTACCTGCTGATCACCca > 2:545456/1‑231 (MQ=255) | GCCAGCGGCAACACCGGCCTGCTGTATGCCGGCCTGGTAGGCGCGTTCATGACCTCGCTGTACACCTTCCGCCTGATCTTCATCGCCTTCCACGGCGAAGCCAAGACCGAAGCCCACGCTGGCCACGGCATCAGCCACTGGCTGCCGCTGGGCGTGCTGATCGTGCTGTCGACTTTCGTCGGCGCCTGGATCACCCCGCCGCTGGCCGGTGTGCTGCCGGAAAGCGCCGGCCATGCCGGTGGCGAAGCCAAGCACGCGCTGGAGATCACCTCGGGTGCCATCGCCATCGCCGGTATCCTGCTGGCCGCCCTGCTGTTCCTGGGCAAGCGCCGCTTCGTCAGCGCCGTCGCCAACAGTGGCATCGGTCGCGTCCTGTCGGCCTGGTGGTTCGCTGCCTGGGGCTTCGACTGGATCTACGACAAGCTTTTCGTCAAACCGTACCTGCTGATCAGCCAC > AE015451/4667462‑4667917 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |