| New junction evidence | |||||||||||
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gTACGTGCGGGACTACCGCATACGGCTCCTGCCTCGGGTATGTGACGCGAAGCGATCCTCAGGGTAAGGGTGTGCATTTCTGGGCCTAGGTATGTAGAGATCAGCAAGGCGTCCATAGCGTGACCATTGAAGTCGATTACGCTGGCTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCcgaac < 1:425733/191‑1 (MQ=255) gtgcgggACTACCGCATACGGCTCCTGCCTCGGGTATGTGACGCGAAGCGATCCTCAGGGTAAGGGTGTGCATTTCTGGGCCTAGGTATGTAGAGATCAGCAAGGCGTCCATAGCGTGACCATTGAAGTCGATTACGCTGGCTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGa > 1:697732‑M2/8‑235 (MQ=255) gcgggACTACCGCATACGGCTCCTGCCTCGGGTATGTGACGCGAAGCGATCCTCAGGGTAAGGGTGTGCATTTCTGGGCCTAGGTATGTAGAGATCAGCAAGGCGTCCATAGCGTGACCATTGAAGTCGATTACGCTGGCTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGt < 1:425528‑M2/231‑1 (MQ=255) ggACTACCGCATACGGCTCCTGCCTCGGGTATGTGACGCGGAGCGATCCTCAGGGTAAGGGTGTGCATTTCTGGGGCTAGGGATGTAGGGATCAGCAAGGCGTCCATAGCGTGACCATTGAAGTCGTTTACGCTg > 2:958145‑M2/3‑135 (MQ=255) ggACTACCGCATACGGCTCCTGCCTCGGGTATGTGACGCGAAGCGATCCTCAGGGTAAGGGTGTGCATTTCTGGGCCTAGGTATGTAGAGATCAGCAAGGCGTCCATAGCGTGACCATTGAAGTCGATTACGCTGGCTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCaccgcgcg > 2:123600‑M2/3‑220 (MQ=255) gACTACCGCATACGGCTCCTGCCTCGGGTATGTGACGCGAAGCGATCCTCAGGGTAAGGGTGTGCATTTCTGGGCCTAGGTATGTAGAGATCAGCAAGGCGTCCATAGCGTGACCATTGAAGTCGATTACGCTGGCTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAAcc < 1:556555‑M2/235‑1 (MQ=255) | TAGTGCTGGATCTGTTCTCTCGCCAAGTCATCGGTTGGTCAATGAAGCCCAGGATGTGCAGCGACCTGGCCATTGACGCCATGCTGATGGCCGTGTGGCGACGCAAGCCGCAGCAGCAAGTGATGATTCATTCAGACCAAGGCAGTCAATTCAGTAGCTCAGATTGGCAAAGCTTCGGTCGCGGTAGGGACGGCAGTTACCTGCCGCCCCCCGCACAGATCCGTACGTGCGGGACTACCGCATACGGCTCCTGCCTCGGGTATGTGACGCGAAGCGATCCTCAGGGTAAGGGTGTGCATTTCTGGGCCTAGGTATGTAGAGATCAGCAAGGCGTCCATAGCGTGACCATTGAAGTCGATTACGCTGGCTACGACGTTTGAGGGCTTGCCGCCATAAACGGCAGACCGCCGAACGAAAACCACCCAGACGTGTCAGGTTTCCCGGCACCGCGTGGTAATTGAAGTAACC > AE015451/5039148‑5039615 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |