New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 5647932 = | 56 (0.970) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 5.8% | coding (192/453 nt) | elaA | putative acyltransferase |
? | AE015451 | 5648003 = | 44 (0.800) | coding (263/453 nt) | elaA | putative acyltransferase |
GACCTCGGCAAGGAGCAGCTCTATGCCATCTTGCAGCTACGCACTGAAGTACTCGTGGTGGAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATGCGCAAGGGATGAGCCCACCCTGTGCGGGCCGCACATCAGGGGTAACCCAGCACT > AE015451/5647774‑5648235 | gACCTCGGCAAGGAGCAGCTCTATGCCATCTTGCAGCTACGCACTGAAGTACTCGTGGTGGAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGttt > 1:231477/1‑236 (MQ=255) tCGGCAAGGAGCAGCTCTATGCCATCTTGCAGCTACGCACTGAAGTACTCGTGGTGGAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGc < 2:245980/234‑1 (MQ=255) aGGAGCAGCTCTATGCCATCTTGCAGCTACGCACTGAAGTACTCGTGGTGGAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTcga < 1:317281/235‑1 (MQ=255) tGCAGCTACGCACTGAAGTACTCGTGGTGGAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTcgacga > 1:295082/1‑217 (MQ=255) aGCTACGCACTGAAGTACTCGTGGTGGAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAgggg > 2:380518/1‑233 (MQ=255) cTGAAGTACTCGTGGTGGAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAgcggc < 1:455741/235‑1 (MQ=255) aaGTACTCGTGGTGGAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAgcggcg < 2:663291/233‑1 (MQ=255) gtggtgGAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGCCCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAg < 2:225496/220‑1 (MQ=255) tggtggAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTtgctgc > 2:434631/1‑204 (MQ=255) tggtggAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTtgctgc < 1:434634/204‑1 (MQ=255) ggAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTcgac > 2:527261/1‑187 (MQ=255) ggAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGcc > 2:1077085/1‑234 (MQ=255) gcCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCggg < 1:849662/229‑1 (MQ=255) cACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCCGCCCGACGAAAGCTtgct > 2:704840/1‑188 (MQ=255) cGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGCGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGa > 1:12665/1‑210 (MQ=255) aGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTg > 2:497595/1‑191 (MQ=255) taTGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGGCAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTgctgct < 1:120207/172‑1 (MQ=255) tGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGCGCGTTGTGGGCCGGGGGTGcc > 2:177276/1‑213 (MQ=255) tGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGAGGAGCAGTGTTGGCCGGGGGTGCCgg > 2:733682/1‑200 (MQ=255) ggCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGtttt < 1:1077088/235‑1 (MQ=255) aTACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGt > 1:957252/1‑196 (MQ=255) aTACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGAGGGGATGTGGTGATCGGCCGAGTGGTGACATCACCGCAGGcgcgcg > 2:282928/1‑121 (MQ=255) ccTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGc < 1:977198/180‑1 (MQ=255) ccTTGCACCTCAGGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGc < 1:797008/236‑1 (MQ=255) ccTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGtttt < 1:538922/213‑1 (MQ=255) agcaagctttcgtcgagctgcaaccctcgcgcctgcggtgatgtcaccactcgtccgatcaccacatccccaccttgtgactgcggatccagcaggcgcGAGGTTTGCAGCTcgacg < 2:887019‑M2/18‑1 (MQ=255) cgtcgagctgcaaacctcGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGGTTGCAGCTCGACGAAAGCTtgct < 2:887019‑M1/99‑1 (MQ=255) ggCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACa > 2:515043/1‑183 (MQ=255) cTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCAt < 1:380521/236‑1 (MQ=255) CTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGtttt > 1:382879‑M1/1‑175 (MQ=255) tgGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGGTTGCGGGGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGAGGGCATCGCGTc > 1:243811/1‑232 (MQ=255) cAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCAt < 1:168228/218‑1 (MQ=255) aGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATgc < 2:435434/234‑1 (MQ=255) tCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGt > 2:426816/1‑199 (MQ=255) aaGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCGCGGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCGCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATGCGCAAg < 1:208065/233‑1 (MQ=255) gggATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATGCGCAAGGGATGAGc < 1:1065266/235‑1 (MQ=255) aTGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATGCGCAAGGGATGAGcc > 2:907670/1‑233 (MQ=255) ggtgATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTggag > 1:1005794/1‑190 (MQ=255) gATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATGCGCAAGGGATGAGCCCAccc < 1:527264/231‑1 (MQ=255) aTCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCAt > 1:550142/1‑129 (MQ=255) aTCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCAt < 2:550139/129‑1 (MQ=255) aTCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCg < 1:971692/172‑1 (MQ=255) ggACGAGTGGTGACGTCACCGCAGGCGAGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAgcggc < 2:327919/77‑1 (MQ=255) cttgtgactgcggatccagcaggcgcGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCt < 2:1074996‑M2/24‑1 (MQ=255) cttgtgactgcggatccagcaggcgcGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCt > 1:1074999‑M2/27‑50 (MQ=255) gAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATGCGCAAg < 1:707254/209‑1 (MQ=255) gAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATGCGCAAg > 2:707251/1‑209 (MQ=255) tgACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTGAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTg < 1:517254/192‑1 (MQ=255) tgACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATGCGCAAGGGATGAGCCCACCCTGTGCGGGCCGCACATCAg < 1:388848/236‑1 (MQ=255) tgACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGGTTGCgg > 2:1054830/1‑150 (MQ=255) tCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACgg < 1:426819/173‑1 (MQ=255) tCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATgcgc > 2:360661/1‑195 (MQ=255) cagCAGTCGCGGGCTTTGTAGCTGGCGGTGAGCTTGCTGCACAAGGGGCTGGAAGAGGCGGACCATGGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGtttt < 1:1029501/119‑1 (MQ=255) aggcgcGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATGCGCAAGGGATGAGCCCACCCTGTGCGGGCCGCACATCAGGGGTAACCCa > 2:1019779‑M2/7‑234 (MQ=255) cgcGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATGCGCAAGGGATGAGCCCACCCTGTGCGGGCCGCACATCAGGGGTAACCCAGCACt < 1:663624‑M2/233‑1 (MQ=255) | GACCTCGGCAAGGAGCAGCTCTATGCCATCTTGCAGCTACGCACTGAAGTACTCGTGGTGGAGCAGCGCCACGCCTACCAGGAAGTCGATGGTCAGGACCTGACTGGCGATACCTTGCACCTCATGGCCTGGCAGGAAGACAAGCTGGTGGCCTACCTGCGCCTGCTGGATCCGCAGTCACAAGGTGGGGATGTGGTGATCGGACGAGTGGTGACATCACCGCAGGCGCGAGGTTTGCAGCTCGACGAAAGCTTGCTGCTCAAGGGGCTGGAAGCGGCGGAGCATTGTTGGCCGGGGGTGCCGGTTTATCTGTCGGCTCCGGCGCATTTACAGGCGTTTTATGCCCGCCATGGGTTTGCGGTGGTGGGCGAGGAGTTTTTGGAGGACGGCATCGCGTCCATTGGAATGCGCAAGGGATGAGCCCACCCTGTGCGGGCCGCACATCAGGGGTAACCCAGCACT > AE015451/5647774‑5648235 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |