New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 608871 = | 35 (0.880) | 5 (0.130) | 5/322 | NT | 12.6% | coding (742/813 nt) | PP_0524 | putative Periplasmic cobalamin‑binding protein HutB |
? | AE015451 | 608902 = | 36 (0.940) | coding (773/813 nt) | PP_0524 | putative Periplasmic cobalamin‑binding protein HutB |
TGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTA > AE015451/608639‑609105 | tgaaggcaatagtgaccccattgcaggctacggcatcgtgggcctgcgcggaagctgggtagcaagccgcgagcttacgctcgacctgaagctggacaacctgctgggaaagcagtacagccgcgtccactacaaccaccagggcaacgactacggctatcgcgaagaaagacgcacttggctcttgagcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaAGCg > 1:419514‑M1/233‑236 (MQ=255) cgccAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGc < 1:726247/235‑1 (MQ=255) gtgACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAgatga > 1:484505/1‑232 (MQ=255) cGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAg < 2:554119/233‑1 (MQ=255) cgtgggcctgcgcggaagctgggtagcaagccgcgagcttacgctcgacctgaagctggacaacctgctgggaaagcagtacagccgcgtccactacaaccaccagggcaacgactacggctatcgcgaagaaagacgcacttggctcttgagcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaa < 1:220334‑M1/1‑1 (MQ=255) cggaagctgggtagcaagccgcgagcttacgctcgacctgaagctggacaacctgctgggaaagcagtacagccgcgtccactacaaccaccagggcaacgactacggctatcgcgaagaaagacgcacttggctcttgagcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaAGCgg > 2:493596‑M1/185‑189 (MQ=255) ggaagctgggtagcaagccgcgagcttacgctcgacctgaagctggacaacctgctgggaaagcagtacagccgcgtccactacaaccaccagggcaacgactacggctatcgcgaagaaagacgcacttggctcttgagcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaAGCggg < 1:622076‑M1/6‑1 (MQ=255) cGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCg < 1:638904/235‑1 (MQ=255) tGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTtgt < 2:291238/203‑1 (MQ=255) gcgcCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTaa > 2:732775/1‑212 (MQ=255) gcgcCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTc > 1:585084/1‑236 (MQ=255) gctcgacctgaagctggacaacctgctgggaaagcagtacagccgcgtccactacaaccaccagggcaacgactacggctatcgcgaagaaagacgcacttggctcttgagcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaAGCgg < 2:470907‑M1/5‑1 (MQ=255) gctcgacctgaagctggacaacctgctgggaaagcagtacagccgcgtccactacaaccaccagggcaacgactacggctatcgcgaagaaagacgcacttggctcttgagcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaAGCgg > 1:470908‑M1/155‑159 (MQ=255) gTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCg < 1:105330/235‑1 (MQ=255) cGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGtctttctt > 1:568001/1‑235 (MQ=255) gctgctgcGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTcgc > 1:651381/1‑235 (MQ=255) gctgctgcGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGAAGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGAc > 1:265104/1‑181 (MQ=255) ctgctgcGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCa > 1:35812/1‑217 (MQ=255) ctgctgcGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGa > 1:190487/1‑236 (MQ=255) gctgcGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATTCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTcgc > 2:554011/1‑232 (MQ=255) gctgcGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGAt > 1:374811/1‑235 (MQ=255) ccTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGccc < 1:331430/231‑1 (MQ=255) ccactacaaccaccagggcaacgactacggctatcgcgaagaaagacgcacttggctcttgagcatcacctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGCGATg < 1:654322‑M1/74‑1 (MQ=255) gatgaGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAgcgc < 1:277858/157‑1 (MQ=255) ctacggctatcgcgaagaaagacgcacttggctcttgagcctgacctgcacaccggcgcgttagcgtccagcaacgcacacaAGc < 2:645714‑M1/3‑1 (MQ=255) tGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGc < 1:698849/186‑1 (MQ=255) cGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGCGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCa > 1:710722/1‑236 (MQ=255) ttCGGGCGGTGGCTGATGGGGGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCGCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTaaa > 2:482919/1‑113 (MQ=255) ttCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTGTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGa < 2:435985/197‑1 (MQ=255) tCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAg > 1:574589/1‑236 (MQ=255) cGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGGGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTg < 1:39011/203‑1 (MQ=255) gggCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAg < 1:578447/234‑1 (MQ=255) gCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAg > 2:572043/1‑167 (MQ=255) gCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAg < 1:572044/167‑1 (MQ=255) cTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAg > 1:96656/1‑231 (MQ=255) gggCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATTCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTc < 1:554012/235‑1 (MQ=255) gggCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTc < 1:51851/235‑1 (MQ=255) atcacctggacaccggcgctttagcgtccagcatagcacacaAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGACGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGc < 2:306116‑M1/90‑1 (MQ=255) tactgctgGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGGTCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAgcg < 2:482460/93‑1 (MQ=255) cctggacaccggcgctttagcgtccagcaacgcacacaAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCTGTTCGAGCGTAAGCTCGCgg < 1:122398‑M1/197‑1 (MQ=255) cgctttagcgtccagcaacgcacacaAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGGTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGACAAGCGCGTCTTTCTTCGCGCTAGCCGTAGTCg < 2:250917‑M1/116‑1 (MQ=255) tagcgtccagcaacgcacacaAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCcg > 1:250918‑M1/22‑236 (MQ=255) gACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTcc < 1:328559/235‑1 (MQ=255) gACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCACATGATCGACGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGCGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTAGAGCGTAAGCTc < 1:711162/214‑1 (MQ=255) ggCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGc < 1:259965/236‑1 (MQ=255) gCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCCGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCgg > 2:224208/1‑210 (MQ=255) cTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGc < 2:636233/234‑1 (MQ=255) cAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCCAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTCGTCGCTGcc > 2:27112/1‑122 (MQ=255) cAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGa < 2:374810/139‑1 (MQ=255) cAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTa > 1:83922/1‑236 (MQ=255) | TGGCCGCCAGGTGGTGACCGACGCCCTGGCCGTGTGCGGGGCGCGCAATGTGTTCGCCGACCTTGGCCAGCCGGCGCCACAGGTGAATGTAGAGTCCGTGCTGCTGCGTAATCCGCAGGTCATCCTGGCCGCTGATGAGGCGCAACTGGCCAGCTGGAAGGCCTGGCCGCAGATTCGGGCGGTGGCTGATGGGCGTCTGCTGGTGGTGCCGGACAAAGGGCTGGAGCGCCCCAGCGGGCAGATGATCGAAGCCACCGCCCGCTTGTGTGCGTTGCTGGACGCTAAAGCGCCGGTGTCCAGGTGATGCTCAAGAGCCAAGTGCGTCTTTCTTCGCGATAGCCGTAGTCGTTGCCCTGGTGGTTGTAGTGGACGCGGCTGTACTGCTTTCCCAGCAGGTTGTCCAGCTTCAGGTCGAGCGTAAGCTCGCGGCTTGCTACCCAGCTTCCGCGCAGGCCCACGATGCCGTA > AE015451/608639‑609105 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |