New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1074831 = | 50 (1.250) | 3 (0.080) | 3/320 | NT | 7.4% | coding (25/1452 nt) | gatA | Glutamyl‑tRNA(Gln) amidotransferase subunit A |
? | AE015451 | 1075058 = | 28 (0.740) | coding (122/309 nt) | gatC | Aspartyl/glutamyl‑tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit C |
GCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTGGTCAGGACGCAGGCGCTGGCTGGCCTCCAGCGGGTGGGCCAGGGGCTCGATGCCAGTGGTATCGACCGCTTGCATCTGGTCGACCAGGCCGA > AE015451/1074607‑1075055 | gCCGTTGGTGCAGATCAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCg < 1:4910/229‑1 (MQ=255) gtttttccgagcacgccagcagaatttcgcggccgttagaccgccagaaagctgacatgttcctcaccgcggacccaaattccgttctttgtttcccttggagatcctcatggcgcttgaacgctgcgacgtggaaaagatcgcccatctggcccgcctgggcctgaatgatggcgaactgccacgcattaccgacgccctgaacagcattct < 2:122943‑M1/3‑1 (MQ=255) gTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATgg > 2:708432/1‑233 (MQ=255) tttGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAggg > 1:724647/1‑215 (MQ=255) tttGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCa > 2:308315/1‑218 (MQ=255) tttGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAg > 2:671402/1‑233 (MQ=255) tttGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGct > 1:599522/1‑236 (MQ=255) cacgccagcagaatttcgcggccgttagaccgccagaaagctgacatgttcctcaccgcggacccaaattccgttctttgtttcccttggagatcctcatggcgcttgaacgctgcgacgtggaaaagatcgcccatctggcccgcctgggcctgaatgatggcgaactgccacgcattaccgacgccctgaacagcatTCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGc > 1:249085‑M1/200‑231 (MQ=255) gggCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTa > 1:112695/1‑234 (MQ=255) gggCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATc > 1:15177/1‑236 (MQ=255) agcagaatttcgcggccgttagaccgccagaaagctgacatgttcctcaccgcggacccaaattccgttctttgtttcccttggagatcctcatggcgcttgaacgctgcgacgtggaaaagatcgcccatctggcccgcctgggcctgaatgatggcgaactgccacgcattaccgacgccctgaacagcatTCTCGGcc > 1:379111‑M1/194‑201 (MQ=255) cACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATg > 1:538719/1‑236 (MQ=255) ccAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGAc < 1:671403/235‑1 (MQ=255) cagcagCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACtt < 1:706121/236‑1 (MQ=255) cTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCgg < 1:67269/178‑1 (MQ=255) tGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGTGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGACCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAg < 1:29866/201‑1 (MQ=255) gTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTc < 1:71666/215‑1 (MQ=255) tttCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGAt > 1:68329/1‑217 (MQ=255) cgcgACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCCGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGGCCGCGGGCGGTCTCGGCCAggggc > 2:71666/1‑168 (MQ=255) cATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGgc < 1:308316/236‑1 (MQ=255) gcggacccaaattccgttctttgtttcccttggagatcctcatggcgcttgaacgctgcgacgtggaaaagatcgcccatctggcccgcctgggcctgaatgatggcgaactgccacgcattaccgacgccctgaacagcatTCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACa > 1:686823‑M1/143‑211 (MQ=255) ccTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATg < 2:112695/158‑1 (MQ=255) gCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACtt < 1:334987/182‑1 (MQ=255) gttgtttcccttggagatcctcagggcgcttgaacgctgcgacggggaaaagatcgcccatctggcccgcctgggcctgaatgatggcgaactgccacgcattaccgacgccctgaacagcatTCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTggg > 2:142015‑M1/124‑181 (MQ=255) ccAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTc < 2:372670/166‑1 (MQ=255) cAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAgg < 2:153364/224‑1 (MQ=255) cAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAgg > 1:153364/1‑224 (MQ=255) cAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCgcgc > 2:731681/1‑232 (MQ=255) cAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCgcgc < 1:731682/232‑1 (MQ=255) tCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCt > 1:371066/1‑236 (MQ=255) gTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTg > 2:282729/1‑165 (MQ=255) cTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTg > 2:158158/1‑122 (MQ=255) tgatgaAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAggg > 2:79241/1‑167 (MQ=255) tgatgaAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTg > 1:379080/1‑235 (MQ=255) gCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGGCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCAt < 2:79809/120‑1 (MQ=255) gCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCGTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACt < 2:216312/140‑1 (MQ=255) gaacgctgcgacgtggaaaagatcgcccatctggcccgcctgggcctgaatgatggcgaactgccacgcattaccgacgccctgaacagcatTCTCGGCCa < 2:494758‑M1/9‑1 (MQ=255) tCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGc > 2:566192/1‑115 (MQ=255) tCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGc < 1:566193/115‑1 (MQ=255) tCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGgcg > 1:233610/1‑177 (MQ=255) tgtgGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGAc < 1:3701/137‑1 (MQ=255) ggatCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTACGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACtt < 1:158158/133‑1 (MQ=255) gATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGt < 1:733420/195‑1 (MQ=255) gcCGGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTGGTCAGGACGCAGGCgct < 2:412246/211‑1 (MQ=255) gagcagGGCGCCGGTCGGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGGGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGAGGCATGGCAGGc < 2:183239/90‑1 (MQ=255) cgcCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTGGTCAGGACGCAGGCGCTGGCTGGCCTCCAGCGGGTGGGCCAGGGGCTCGATg < 1:708433/236‑1 (MQ=255) cGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTGGTCAGGACGCAGGCGCTGGCTGGCCTCCAGCGGGTGGGCCAGGGGCTCGATGCCa > 1:550962/1‑236 (MQ=255) gtaaGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTGGTCAGGACGCAGGCGCTGGCTGGCCTCCAGCGGGTGGGcc < 2:379079/216‑1 (MQ=255) tctTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTGGTCAg < 1:200948/178‑1 (MQ=255) aagaaAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTGGTCAGGACGCAGGCGCTGGCTGGCCTCCAGCGGGTGGGCCAGGGGCTCGATGCCAGTGGTATCGACCGCt > 1:344264/1‑236 (MQ=255) agaaAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAgg > 1:689319/1‑63 (MQ=255) agaaAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAgg < 2:689318/63‑1 (MQ=255) tCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACtt < 2:15177/151‑1 (MQ=255) tCGGCGAGTCCGCGGGCGATCCCGGCCAGGGTCAATCGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGgcg < 2:545601/109‑1 (MQ=255) cGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTGGTCAGGACGCAGGCGCTGGCTGGCCTCCAGCg < 1:409764/180‑1 (MQ=255) tCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTGGTCAGGACGCAGGCGCTGGCTGGCCTCCAGCGGGTGGGCCAGGGGCTCGATGCCAGTGGTATCGACCGCTTGCATCTGGTCGACCAGGCCg < 1:673369/235‑1 (MQ=255) gcgGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTGGTCAGGACGCAGGCGCTGGCTGGCCTCCAGCGGGTGGGCCAGGGGCTCGATGCCAGTGGTATCGACCGCTTGCATCTGGTCGACCAGGCCga > 2:654189/1‑233 (MQ=255) | GCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCATGGCAGGCTCTATCCCTTACTCGATGACTTTGGGAACCAGGTACAGACCGCTTTCGGTCGACGGCGCGATGGCCTGGTAGGCATCGCGCTGGTTGCTTTCGGTGACTTGGTCAGGACGCAGGCGCTGGCTGGCCTCCAGCGGGTGGGCCAGGGGCTCGATGCCAGTGGTATCGACCGCTTGCATCTGGTCGACCAGGCCGA > AE015451/1074607‑1075055 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |