New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1308616 = | 34 (0.850) | 3 (0.080) | 3/318 | NT | 8.3% | coding (136/888 nt) | PP_1143 | 3‑hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein |
? | AE015451 | 1308643 = | 34 (0.900) | coding (163/888 nt) | PP_1143 | 3‑hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein |
TTCTGCCAGTCGCCACCGGGACCGTCGCCAGCCTGGGAAATGTTCGAATCAGTCAGGAGTTTATCGATGAGCACTGCACTACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCT > AE015451/1308415‑1308845 | tgcTGCCAGTCGCCACCGGGACCGTCGCCAGCCTGGGAAATGTTCGAATCAGTCAGGAGTTTATCGATGAGCACTGCACTACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGcc < 1:352491/232‑1 (MQ=255) cGGGACCGTCGCCAGCCTGGGAAATGTTCGAATCAGTCAGGAGTTTATCGATGAGCACTGCACTACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAg < 1:731362/235‑1 (MQ=255) cGTCGCCAGCCTGGGAAATGTTCGAATCAGTCAGGAGTTTATCGATGAGCACTGCACTACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACa < 2:743556/234‑1 (MQ=255) cAGCCTGGGAAATGTTCGAATCAGTCAGGAGTTTATCGATGAGCACTGCACTACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCg < 1:13884/225‑1 (MQ=255) cGAATCAGTCAGGAGTTTATCGATGAGCACTGCACTACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGCATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGaca > 1:101775/1‑236 (MQ=255) tcagtcagGAGTTTATCGATGAGCACTGCACTACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATgg > 1:592615/1‑211 (MQ=255) agGAGTTTATCGATGAGCACTGCACTACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCGTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCGGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCcagca > 1:278544/1‑172 (MQ=255) aTCGATGAGCACTGCACTACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGa > 2:462201/1‑234 (MQ=255) cGATGAGCACTGCACTACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCggtggt > 1:136309/1‑226 (MQ=255) actgcactACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCg > 1:35001/1‑181 (MQ=255) ctgcactACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCg < 2:621779/180‑1 (MQ=255) actACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCg < 2:640140/176‑1 (MQ=255) actACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCg > 1:640141/1‑176 (MQ=255) tACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCg < 2:663303/156‑1 (MQ=255) tCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGc > 1:611652/1‑208 (MQ=255) cTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGa > 2:121040/1‑149 (MQ=255) cTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGtt < 1:418896/218‑1 (MQ=255) cTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGtt > 2:418895/1‑218 (MQ=255) tGATGGGGCTGCCCATGAGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGGACCGCAGTCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCCCCGGGC‑‑‑GCGTGCCCGGc > 2:289567/1‑112 (MQ=255) ggCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGCCAGGCGCGC‑‑‑GCCAGCAGCCCGGCCg < 2:619210/121‑1 (MQ=255) ggCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTg > 2:560170/1‑208 (MQ=255) ggCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑CAGGCGCGCGCCAGCAGCCCGGCCg > 1:619211/1‑121 (MQ=255) gCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCTCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGGCAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGc < 2:693675/234‑1 (MQ=255) aTGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGGCAGt > 1:262714/1‑223 (MQ=255) aTGTGCCGCCGCCGGCTGGCAGCGGGTTAGCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGGGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCggtggt < 2:2882/167‑1 (MQ=255) tgtgCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGGAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCGGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCCGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATg > 2:550355/1‑134 (MQ=255) tgtgCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCcag < 2:203766/100‑1 (MQ=255) ttATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGc < 2:278543/200‑1 (MQ=255) aTCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAgg < 2:265501/166‑1 (MQ=255) aTCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAgg > 1:265502/1‑166 (MQ=255) gcaccatgtcgctgtcacggcacaattcggccggGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTAc < 1:223327‑M1/64‑1 (MQ=255) caccatgtcgctgtcacggcacaattcggccggGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTGCTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGGAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGc < 1:578108‑M1/122‑1 (MQ=255) cccGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCAcc > 1:698502/1‑208 (MQ=255) cccGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGc > 2:580244/1‑234 (MQ=255) tGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGc < 1:121040/212‑1 (MQ=255) cgccgcACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGt < 2:617641/199‑1 (MQ=255) cggccggGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCAccc < 2:430093‑M1/184‑1 (MQ=255) tGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCctggct < 1:462202/235‑1 (MQ=255) tCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCa > 1:563147/1‑145 (MQ=255) GCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACAt < 2:396580‑M1/56‑1 (MQ=255) GCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACAt > 1:396581‑M1/1‑56 (MQ=255) GCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAAc > 1:589132‑M1/1‑202 (MQ=255) GCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAAc < 2:589131‑M1/202‑1 (MQ=255) | TTCTGCCAGTCGCCACCGGGACCGTCGCCAGCCTGGGAAATGTTCGAATCAGTCAGGAGTTTATCGATGAGCACTGCACTACCTTCGCTTGGATTCGCCGGCATTGGCCTGATGGGCCTGCCCATGTGCCGCCGCCTGCTGGCAGCGGGTTATCCGCTGACGGTATGGAACCGCAGCCCGGACAAGTGCGCCGCACTGGTCGCTGCTGGC‑‑‑GCGCGCCTGGCCAGCAGCCCGGCCGAATTGTGCCGTGACAGCGACATGGTGCTACTGTGCCTGGCCGACACGGCGGTGGTGCGTGAAGTGGTGTTCGGCGAGCAAGGCATTGCCCAGGGCGGGCGCAGCGGCCAGTTGCTGATCGATTTCTCCAGCCTGGAACCCACCGCCACCCGTGAAATGGCTGCCGAACTGGCCGCACTGTGCGGCATGGCCTGGCT > AE015451/1308415‑1308845 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |