New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1473519 | 58 (1.450) | 3 (0.080) | 3/318 | NT | 5.0% | coding (702/1317 nt) | algD | GDP‑mannose 6‑dehydrogenase |
? | AE015451 | = 1473631 | 60 (1.590) | coding (590/1317 nt) | algD | GDP‑mannose 6‑dehydrogenase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACGTCCTTGGGCAAGCAAGAGCCGCCGAAGGCAAAGCCAGGGCGCATGTAGTACTGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGAT > AE015451/1473403‑1473866 | aCGTCCTTGGGCAAGCAAGAGCCGCCGAAGGCAAAGCCAGGGCGCATGTAGTACTGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGgggcgtc < 1:725993‑M2/236‑8 (MQ=255) gcaagcaaGAGCCGCCGAAGGCAAAGCCAGGGCGAATGTAGTACTGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCg < 1:45935/236‑1 (MQ=255) caagcaagAGCCGCCGAAGGCAAAGCCAGGGCGCATGTAGTACTGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGt < 1:353721/236‑1 (MQ=255) agagCCGCCGAAGGCAAAGCCAGGGCGCATGTAGTACTGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAgg > 1:373117/1‑235 (MQ=255) cgccgAAGGCAAAGCCAGGGCGCATGTAGTACTGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTg < 1:364373/235‑1 (MQ=255) gAAGGCAACGCCAGGGCGCATGTAGTACTGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAg < 2:202748/225‑1 (MQ=255) aaGGCAAAGCCAGGGCGCATGTAGTACTGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGAt > 1:589802/1‑236 (MQ=255) cAAAGCCAGGGCGCATGTAGTACTGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGt < 1:522272/216‑1 (MQ=255) gcATGTAGTACTGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCt > 1:736185/1‑235 (MQ=255) tGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGc < 1:355298/235‑1 (MQ=255) gACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCgtt > 2:628183/1‑234 (MQ=255) aCAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGTGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCg > 2:404498/1‑233 (MQ=255) cAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGctcg > 1:86970/1‑183 (MQ=255) cAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGcc < 1:499550/231‑1 (MQ=255) cAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGcc > 2:499549/1‑231 (MQ=255) aGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCg > 2:618976/1‑228 (MQ=255) tGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTGCTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGggg < 2:485011‑M2/168‑4 (MQ=255) tGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGAc > 2:735811/1‑232 (MQ=255) tGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTc > 1:489412/1‑236 (MQ=255) cTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGt < 1:735812/235‑1 (MQ=255) gTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCt < 1:326679/236‑1 (MQ=255) tCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGcc > 2:291059/1‑215 (MQ=255) ccTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGCCGAGCTCTTCGTACAGGGCCCggagg > 1:514670/1‑185 (MQ=255) cTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTgg < 1:194810/235‑1 (MQ=255) aCGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGt > 1:729371/1‑178 (MQ=255) gTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGa > 1:452862/1‑236 (MQ=255) ccATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGAt > 1:387285/1‑235 (MQ=255) cATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCa < 2:566520/209‑1 (MQ=255) gcgGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGACGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGc > 2:405652/1‑233 (MQ=255) cgGCCATCGACGACCACGGCTTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGAt < 1:212512/224‑1 (MQ=255) ggCCATCGACGACCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTc > 1:515825/1‑235 (MQ=255) cATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACg > 1:44795/1‑235 (MQ=255) aCGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGgggcgtcgatggccgcgaagtgatggacgtggtctgccaggacaaggtcctcaacctgtcccagtactacatgcgccctggctttgccttcggcggctcttgcttgcccaag < 2:623111‑M2/230‑113 (MQ=255) aCGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGaa > 1:416921/1‑236 (MQ=255) ggCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCg > 1:357053/1‑236 (MQ=255) gATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGAt > 1:227739/1‑135 (MQ=255) gATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCa > 1:41140/1‑236 (MQ=255) ttGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAAtt > 2:574244/1‑217 (MQ=255) ccGATGTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTa < 2:82320/182‑1 (MQ=255) aTTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTc > 1:534498/1‑236 (MQ=255) cGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAGCGTTGCAGGTGTACATGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTAc < 1:206341/107‑1 (MQ=255) gTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGTCCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCg < 2:591969/103‑1 (MQ=255) gTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGGACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGGACAGGGCCTggggggt > 2:101604/1‑118 (MQ=255) gAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCct < 1:481200/236‑1 (MQ=255) aaGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGc < 2:489411/233‑1 (MQ=255) cTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGccc < 1:657316/235‑1 (MQ=255) cTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCg < 1:6937/236‑1 (MQ=255) gtggCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTGCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGccc < 2:400966/231‑1 (MQ=255) tggCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCg < 2:725992/231‑1 (MQ=255) ggCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGGCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTcc > 1:136995/1‑118 (MQ=255) tGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATcg < 2:414591/160‑1 (MQ=255) gCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGccc > 1:715853/1‑224 (MQ=255) cAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAg > 1:396610/1‑236 (MQ=255) gaacGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTGCGATCGGCTTGCGGATGATCGgggcgtcgatggccgcgaagggatggacgt > 2:497385‑M2/2‑57 (MQ=255) aGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATg > 1:739372/1‑236 (MQ=255) ggTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGgggcgtcgatggccgcgaagtgatggacgtggtctgccaggacaaggtcctcaacctgtcccagtactacatgcgccctggctttgccttcggcggctcttgcttgcccaaggacgt < 2:572006‑M2/164‑118 (MQ=255) aCTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGccc < 1:574654/206‑1 (MQ=255) gATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGCTGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGGGGGTGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTcgtcgt > 2:235773/1‑128 (MQ=255) gATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCCGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCt < 1:405653/236‑1 (MQ=255) cATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCt < 2:534497/233‑1 (MQ=255) cGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGGCAc > 2:684332/1‑166 (MQ=255) aCTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGGCCTTGATCGCGGGGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGAACGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGccgt > 2:186855/1‑180 (MQ=255) tCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCa < 1:292869/235‑1 (MQ=255) aTCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATc > 1:341728/1‑201 (MQ=255) gCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTCCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGa < 1:139393/156‑1 (MQ=255) gCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGtgctgc > 1:26917/1‑236 (MQ=255) atCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGcacca < 1:628184/235‑1 (MQ=255) ggggCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGAt > 1:447610/1‑236 (MQ=255) | ACGTCCTTGGGCAAGCAAGAGCCGCCGAAGGCAAAGCCAGGGCGCATGTAGTACTGGGACAGGTTGAGGACCTTGTCCTGGCAGACCACGTCCATCACTTCGCGGCCATCGACGCCCACGGCCTTGGCGATGTTGCCGATTTCGTTGGCGAAGGTGACCTTGGTGGCGTGCCAAACGTTGCAGGTGTACTTGATCATTTCGGCCACTTCGATCGGCTTGCGGATGATCGGGGCGTCGAGCTCTTCGTACAGGGCCTGGAGGATGTCACCGCTGGCGCTGTCCAGTTCGCCGATGACTGTCATCGGTGGCTGGTCGTAGTCCTTGATCGCGGTGCTTTCACGCAGGAATTCCGGGTTGACCGCCACGCCGAAGTCGACGCCGGCCTTCTTGCCCGAGCAGTCTTCGAGGATCGGGATGACCACGTTCTTGACGGTGCCAGGCAGTACGGTGCTGCGCACCACGAT > AE015451/1473403‑1473866 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |