New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3409928 = | 37 (0.930) | 7 (0.180) | 7/326 | NT | 14.6% | intergenic (‑494/‑42) | PP_3022/PP_3024 | Transcriptional regulator, AraC family/conserved protein of unknown function |
? | AE015451 | = 3450711 | 46 (1.190) | intergenic (‑125/+258) | PP_5558/PP_3069 | putative transcriptional xre family of phage origin/Outer membrane autotransporter |
CGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCGGGTCAGCGCGTCCTTGCTGGGCTGCG > AE015451/3450483‑3450940 | cGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCa < 1:239533/236‑1 (MQ=255) aGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTAc > 2:460080/1‑235 (MQ=255) ttCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGtc < 1:265164/235‑1 (MQ=255) ttcttcCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTagc < 1:460081/236‑1 (MQ=255) tcttcCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTagca > 1:384415/1‑236 (MQ=255) gtCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCCTCTTCAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCa > 2:57443/1‑201 (MQ=255) gatgTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTg > 1:485950/1‑182 (MQ=255) cGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCATAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTag > 2:412386/1‑196 (MQ=255) gCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGa > 1:214347/1‑236 (MQ=255) gTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGTTGTGTTTTTCctgctg > 2:320186/1‑223 (MQ=255) tATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgt < 2:244943/182‑1 (MQ=255) aTGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCctgctgc > 1:632527/1‑222 (MQ=255) gCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaaccctccatgcattgactcagcaggcgaacagaggcaaattgccacgcttgtcgtacttacaaatcacctgcg < 2:295772‑M2/232‑125 (MQ=255) gCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgtgag > 1:156074/1‑182 (MQ=255) cATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCctgctg > 1:319334/1‑218 (MQ=255) aTGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgtgagt > 2:613707/1‑181 (MQ=255) tGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgccatcgc > 1:268756/1‑236 (MQ=255) aaCAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaaccctccatgcattgactcagcaggcgaacagaggcaaattgccacgcttgtcgtacttacaaatcacctgcgcattgaatg < 1:106200‑M2/236‑134 (MQ=255) aCAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTagc < 2:583284/162‑1 (MQ=255) aGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGTTagcc > 2:348280/1‑160 (MQ=255) aGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTgttgtt > 2:542442/1‑204 (MQ=255) tataGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTAc > 1:101705/1‑236 (MQ=255) taGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGgtggg > 2:213207/1‑193 (MQ=255) taGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACt > 1:400984/1‑235 (MQ=255) cGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTCGGCTgg > 2:155037/1‑187 (MQ=255) aGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCt > 1:190668/1‑233 (MQ=255) gCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGACTGGGCGgccatc > 1:438409/1‑215 (MQ=255) ccATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGgcg > 1:651791/1‑236 (MQ=255) cTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttca > 1:608656‑M2/1‑81 (MQ=255) cTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttca < 2:608655‑M2/116‑36 (MQ=255) cTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTa < 1:542443/236‑1 (MQ=255) taCGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCt < 1:189067/214‑1 (MQ=255) aGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaaccctccatgcattgactcagcaggcgaacagaggcaaattgccacgcttgtcgtacttacaaatcacctgcgcattgaatggatatcatgtgaagcttttaaaaaaagactactacc < 2:155920‑M2/228‑170 (MQ=255) aGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGc > 1:29258/1‑222 (MQ=255) aGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGtt > 2:66722/1‑229 (MQ=255) aGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTcagccag > 1:259168/1‑236 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaaccctccatgcattgactcagcaggcgaacagaggcaaattgccacgcttgtcgtacttacaaatcacctgcgcattgaatggatatcatgtgaagcttttaaaaaaagactactacct < 2:583930‑M2/227‑171 (MQ=255) gCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTGCAGGCAGCGTTGGTTCagccagcc > 1:73341/1‑236 (MQ=255) cTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTgg > 2:189067/1‑170 (MQ=255) tAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCt > 2:258842/1‑196 (MQ=255) aGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGtt < 2:651083/215‑1 (MQ=255) cAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaaccctccatgcattgactcagcaggcgaacagaggcaaattgccacgcttgtcgtacttacaaatcacctgcgcattgaatggatatcatgtgaagcttttaaaaaaagactactaccttcggcataagcgcattgcaaaa > 1:295773‑M2/1‑44 (MQ=255) gagtGTTGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGTCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATg < 1:42799/236‑1 (MQ=255) gggTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGt > 1:746529/1‑235 (MQ=255) gggTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGt > 1:303779/1‑235 (MQ=255) cTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTCCCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCCCCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGtgttgt < 2:99335/131‑1 (MQ=255) aaaaaTTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGCATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGgcg > 1:693032/1‑177 (MQ=255) aaaaTTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTTCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCGGGTCAgcg < 1:412387/236‑1 (MQ=255) attatattatCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGTTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTAAGGCCTGGgcg > 2:651581/1‑173 (MQ=255) tatattatCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTTGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCGGGTCAGcgcg < 2:384414/233‑1 (MQ=255) aGTCGCTTGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGcc < 2:565599/195‑1 (MQ=255) cGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGtc < 2:622318/56‑1 (MQ=255) cGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGtc > 1:622319/1‑56 (MQ=255) gCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGtccacgc > 1:548521/1‑134 (MQ=255) tAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGACTGTTCAACCGGGTCAGCGCGTCCTTGCTGGGCTgcg > 2:27259/1‑234 (MQ=255) | CGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCGGGTCAGCGCGTCCTTGCTGGGCTGCG > AE015451/3450483‑3450940 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |