| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 5435853 | 53 (1.330) | 6 (0.160) | 6/318 | NT | 11.6% | coding (32/873 nt) | fieF | divalent cation efflux transporter |
| ? | AE015451 | = 5435909 | 41 (1.080) | coding (88/873 nt) | fieF | divalent cation efflux transporter | |||||
GCCATTCTGGAAAGCGAACTGGGCCAGCGCCTGCCGCTGAACGACCCACGGCTGATCCAGCACCGCGGCAGCATCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCCTTGGCCGGTATGGCGCAGGCGCTGTTCATCGGTGGCAGTGCGGTGCTGATCGGGGTGCAGGCGGTCGAGCGTCT > AE015451/5435686‑5436144 | gCCATTCTGGAAAGCGAACTGGGCCAGCGCCTGCCGCTGAACGACCCACGGCTGATCCAGCACCGCGGCAGCATCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAag > 1:511684‑M2/1‑224 (MQ=255) cGAACTGGGCCAGCGCCTGCCGCTGAACGACCCACGGCTGATCCAGCACCGCGGCAGCATCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAaggcgctggtgttcagccggggtagt > 1:268122‑M2/1‑210 (MQ=255) cGAACTGGGCCAGCGCCTGCCGCTGAACGACCCACGGCTGATCCAGCACCGCGGCAGCATCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAg < 2:283882/232‑1 (MQ=255) cTGAACGACCCACGGCTGATCCAGCACCGCGGCAGCATCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCCCTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGc < 1:94196/236‑1 (MQ=255) gACCCACGCCTGATCCAGCACCGCGGCAGCATCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTCCCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCg < 1:165628/236‑1 (MQ=255) tGATCCAGCACCGCGGCAGCATCGAACACCTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCAc < 1:158297/235‑1 (MQ=255) aGCACCGCGGCAGCATCGAACAACTGGCCAGCCTGGCCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGc > 1:176025/1‑176 (MQ=255) ggCAGCATCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTgg < 1:595624/233‑1 (MQ=255) gcagcaTCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAg > 1:437728/1‑191 (MQ=255) cagcaTCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGTATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCg > 1:282765/1‑236 (MQ=255) cagcaTCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTc > 1:392764/1‑235 (MQ=255) cagcaTCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGAGCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGGGCGGGTCGGTGAGcc > 1:565196/1‑192 (MQ=255) gCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGGCTCGGCACTGGACGCCgcg > 2:741942/1‑212 (MQ=255) gCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCGGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACGACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAaggcgctggtgttcagccg > 2:27214‑M2/1‑140 (MQ=255) cAGCCTGGGGCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTAGTGCTGAGCAaggcgctggtgttca > 1:535084‑M2/1‑138 (MQ=255) gggcctggTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCAc > 1:347446/1‑236 (MQ=255) ctggTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCaa > 2:471517/1‑216 (MQ=255) ccGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGAcc > 2:569820/1‑175 (MQ=255) ccGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGc > 2:693908/1‑219 (MQ=255) ccGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGc < 1:693909/219‑1 (MQ=255) aGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTgc < 2:677550/231‑1 (MQ=255) gAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGAcc > 2:547941/1‑165 (MQ=255) gAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCgg > 1:435333/1‑211 (MQ=255) gAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCcga > 1:59147/1‑236 (MQ=255) gatgatCTCTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATg < 1:399317/236‑1 (MQ=255) gatgatCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATg < 1:290873/236‑1 (MQ=255) aCTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGa > 2:524283/1‑137 (MQ=255) aCTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAggg > 2:528331/1‑235 (MQ=255) tACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCGCTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTgc < 1:532503/194‑1 (MQ=255) cccGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTAc < 1:535713/184‑1 (MQ=255) cccGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGcc > 1:59943/1‑232 (MQ=255) cGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCGCTACg > 2:392183/1‑183 (MQ=255) gCTGAACTCCAGCGCCTGCTCGGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCCtt < 1:213322/236‑1 (MQ=255) cTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCcgacga > 1:379710/1‑199 (MQ=255) cTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGGGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCCCGGTCCTCAAc > 1:98773/1‑161 (MQ=255) gAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCCTTGGc > 1:565558/1‑236 (MQ=255) cacCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGc < 2:555145/143‑1 (MQ=255) cacCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGc > 1:555146/1‑143 (MQ=255) tCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCcga > 2:477430/1‑178 (MQ=255) ccACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCcgacgacga < 2:176025/175‑1 (MQ=255) cACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCCTTGGCCGGTATGGCGCAGGCGCTGTTCATCgg < 2:719864/226‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCCTTGGCCGGTATGGCGCAGgcgc < 2:347445/214‑1 (MQ=255) gCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCCTTGGCCGGTATGGCGCAGGCGCTGTTCATCGGTGGCAGTGCGGTGCt < 1:521786/236‑1 (MQ=255) cGGCATCCTGGTGCTGAGCAaggcgctggtgttcagccggggtagtgatcatccgtggtcagtgtccttgtggctcaggctgccgggaccaggcccaggctggccagttgttcgatgctgccgcggtgctggatcagccgtgggtcgttcagcggcaggcgctggcccagttcgctttccagaatggcctgcaacttcaggttgtcgaccttgccatcggggctgacggcttcctc < 2:520240‑M2/236‑217 (MQ=255) ggCATCCTGGTGCTGAGCAaggcgctggtgttcagccggggtagtgatcatccgt < 1:382455‑M2/55‑37 (MQ=255) ggCATCCTGGTGCTGAGCAaggcgctggtgttcagccggggtagtgatcatccgt > 2:382454‑M2/1‑19 (MQ=255) ggCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCCTTGGCCGGTATGGCGCAGGCGCTGTTCATCGATGGCAGTGCGGTGCTGATCGGGGt > 1:593988/1‑236 (MQ=255) tCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCCTTGGCCGGTATGGCGCAGGCGCTGTTCATCGGTGGCAGTGCGGTGCTGATCGGGGTGCAg > 1:650700/1‑236 (MQ=255) cTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCTTTGGCCGGTATGGCGCAGGCGCTGTTCATCGGTGGCAGTGCGGTGCTGATCGGGGTGCAGGCGGTc < 2:392763/234‑1 (MQ=255) cAaggcgctggtgttcagccggggcagtgatcatccgtggtca < 2:234426‑M2/43‑42 (MQ=255) aaGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCCTTGGCCGGTATGGCGCAGGCGCTGTTCATCGGTGGCAGTGCGGTGCTGATCGGGGTGCAGGCGGTCGAGc > 2:556039/1‑232 (MQ=255) aaGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCCTTGGCCGGTATGGCGCAGGCGCTGTTCATCGGTGGCAGTGCGGTGCTGATCGGGGTGCAGGCGGTCGAGCGTCt > 1:24075/1‑236 (MQ=255) | GCCATTCTGGAAAGCGAACTGGGCCAGCGCCTGCCGCTGAACGACCCACGGCTGATCCAGCACCGCGGCAGCATCGAACAACTGGCCAGCCTGGGCCTGGTCCCGGCAGCCTGAGCCACAAGGACACTGACCACGGATGATCACTACCCCGGCTGAACACCAGCGCCTGCTCCGCCTTGCCACGCGCGCATCACTGGCGGTGGCCGGCATCCTGGTGCTGAGCAAGGCGCTGGCCTGGTGGCTGAGCGGGTCGGTGAGCCTGCTGGCCGGGCTGACCGACTCGGCACTGGACGCCGTGGCCTCGTTCCTCAACCTGCTGGCGGTGCACTACGCCCTGCGCCCGGCCGACGACGATCACCGGTTCGGCCATGGCAAGGCCGAGGCCTTGGCCGGTATGGCGCAGGCGCTGTTCATCGGTGGCAGTGCGGTGCTGATCGGGGTGCAGGCGGTCGAGCGTCT > AE015451/5435686‑5436144 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |