New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5881075 | 43 (1.080) | 3 (0.080) | 3/318 | NT | 5.7% | coding (164/1368 nt) | PP_5154 | putative Oxidoreductase, FAD‑binding |
? | AE015451 | = 5881138 | 59 (1.560) | coding (101/1368 nt) | PP_5154 | putative Oxidoreductase, FAD‑binding |
TGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCGGGATAAGCTCAGATTGTGTCGCGTATGCTAGCATAGCCCTCCCG > AE015451/5880926‑5881364 | tGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCgg < 2:259546/232‑1 (MQ=255) acgacCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCAAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAAt < 1:601167/235‑1 (MQ=255) acCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGAtgg < 1:747027‑M2/211‑4 (MQ=255) cccTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTg < 1:326772/235‑1 (MQ=255) gcAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAg < 2:504473/232‑1 (MQ=255) aGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCg < 1:519168/194‑1 (MQ=255) aaGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAAt < 1:480192/193‑1 (MQ=255) aaGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGGAATGCTTGGTCCAGGcc > 2:62218/1‑202 (MQ=255) aGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATCCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGtcagtcag < 1:424131/236‑1 (MQ=255) cATGTAGGCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCtt < 1:154801/192‑1 (MQ=255) gTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGt < 1:448123/236‑1 (MQ=255) aGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGt > 2:627141/1‑234 (MQ=255) gTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCg < 2:701033/235‑1 (MQ=255) gAAGGCGAGGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGAtg > 2:655397‑M2/1‑143 (MQ=255) gAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACa < 1:297610/235‑1 (MQ=255) aaGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAg > 1:613050/1‑236 (MQ=255) gccgccACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGcc < 2:5920/161‑1 (MQ=255) gccACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCg < 1:165203/133‑1 (MQ=255) ccACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCg > 1:430780/1‑203 (MQ=255) ccACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCg < 2:430779/203‑1 (MQ=255) ggCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGgggtgg < 1:411948/235‑1 (MQ=255) ggCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGgggtgggt < 2:747026/231‑1 (MQ=255) aaaGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCGCCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAg < 1:97479/202‑1 (MQ=255) cGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCTCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGaa < 1:197287/231‑1 (MQ=255) gcgcCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCg < 2:537140/152‑1 (MQ=255) ccgccAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATAGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTAt > 1:491642/1‑235 (MQ=255) cAGCTCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCAc < 1:26764/231‑1 (MQ=255) aGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGa > 1:329353/1‑235 (MQ=255) cgcCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGGCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGa > 2:258158/1‑233 (MQ=255) gcCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGAtggcgctggtgccctctggcgggcgcaccgggctttctgccggcgccgtggcggccaatggcgaggttgtcgtcgcctt > 2:647867‑M2/1‑67 (MQ=255) gcCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGAtggcgctggtgccctctggcgggcgcaccgggctttctgccggcgccgtggcggccaatggcgaggttgtcgtcgcctt < 1:647868‑M2/146‑80 (MQ=255) cTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAAc < 1:374478/201‑1 (MQ=255) tgtgCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGGCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGGGGGTCATCGCTGGAActct > 1:183331/1‑202 (MQ=255) tgCGCATTGGCGCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTGTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGttcttc < 2:247444/167‑1 (MQ=255) tgCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCCGTCCTTGCCCTACg > 2:242684/1‑106 (MQ=255) cgcATTGGCCCAGTGGACAATGGCTTGAACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCGTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCAcc < 2:475405/233‑1 (MQ=255) cgcATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGgggtg < 2:729084/180‑1 (MQ=255) cATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACtt < 2:189581/202‑1 (MQ=255) cATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTGGGTCCCGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGtcatc < 2:64404/155‑1 (MQ=255) aTTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCg < 1:738147/235‑1 (MQ=255) tGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTGTGAGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCggg < 1:167217/235‑1 (MQ=255) ggCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCActct < 1:62218/222‑1 (MQ=255) ggCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCg < 2:431384/232‑1 (MQ=255) ggCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCg > 1:431385/1‑232 (MQ=255) gCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCGGGATa > 1:629186/1‑236 (MQ=255) gCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGGaa > 1:210868/1‑72 (MQ=255) acacTGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGCCGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCt < 1:231419/203‑1 (MQ=255) ggCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCGGGATAAGCTCAGATTgtgt > 1:316871/1‑236 (MQ=255) gCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGgtcag > 1:286434/1‑99 (MQ=255) gCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGgtcag < 2:286433/99‑1 (MQ=255) gCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACtt < 1:750886/178‑1 (MQ=255) gCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACtt > 2:750885/1‑178 (MQ=255) gCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCGGGATAAGCTCAGATTGTGTcgcg > 1:283621/1‑235 (MQ=255) gCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGACATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGcc > 2:453944/1‑112 (MQ=255) aCCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTc > 2:440906/1‑180 (MQ=255) aCCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCGGGATAAGCTCAGATTGTGTCGCGTAt > 1:547541/1‑236 (MQ=255) ggtCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATa < 2:82073/135‑1 (MQ=255) cTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTggca > 2:420668/1‑157 (MQ=255) agcgtTGTGGGGACGGCGAtggcgctggtgccctctggcgggcgcaccgggctttctgccggcgccgtggcg > 2:526490‑M2/3‑19 (MQ=255) ttttGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCa > 1:103541/1‑168 (MQ=255) gtttGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCg < 2:152525/196‑1 (MQ=255) ggAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCt < 2:103541/188‑1 (MQ=255) ggAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCgg > 1:590922/1‑193 (MQ=255) ggAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCGGGATAAGCTCAGATTGTGTCGCGTATGCTAGCATAGCCCTCCCg > 1:520344/1‑236 (MQ=255) aTGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCGGGATAAGCTCAGATTGTGTCGCGt < 2:329352/207‑1 (MQ=255) | TGACGACCCCTGGCTGGCAAACCACAGTACGGTCGAAAGCATTGAAGCCAAGGATCTGGTTCATGTAGTCGAAGGCGACGACAACCTCGCCATTGGCCGCCACGGCGCCGGCAGAAAGCCCGGTGCGCCCGCCAGAGGGCACCAGCGCCACCTTGTGCGCATTGGCCCAGTGCACAATGGCTTGCACCTGTTCTATCGTTTTGGGAAAGACGATGGCGCTGGGCGCAGGCGGGTAATGCTTGGTCCAGTCCTTGCCATACGCTTCGAGGGAAACCGGGTCAGTCAGGACCTTGCCAGGGTCGACAAGGGTCATCAGTTCTTCAATAACAGCGGGGTGGGTCATCGCTGGAACTCTCGACTTATTCATGGTCACCCTGAGCACTCTTCACCTGTCGGGATAAGCTCAGATTGTGTCGCGTATGCTAGCATAGCCCTCCCG > AE015451/5880926‑5881364 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |