New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 299909 | 56 (0.910) | 7 (0.120) | 7/326 | NT | 12.0% | coding (1217/2586 nt) | yhgF | putative transcriptional accessory protein |
? | AE015451 | = 300062 | 50 (0.850) | coding (1064/2586 nt) | yhgF | putative transcriptional accessory protein |
CAGCTTGTCGCTTTCGCGGCTGGCGGTACCGTTGCCAATGGCGATCAGCTCCACCGAGTGTTTGGCGCACAGTGCGGCCATGATGGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCACTTGTCGGCCGGCCGGCTGCGGTTCTCGATGCCGACGTGGTTGCCGATCATCAGCTCGCATGGGTGCAGGGTGCCGGGCAGTTCTT > AE015451/299680‑300143 | cAGCTTGTCGCTTTCGCGGCTGGCGGTCCCGGTGCCAATGGCGATCAGCTCCACCGAGTGTTTGGCGCACAGTGCGGCCATGATGGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCG < 1:332711‑M1/230‑1 (MQ=255) tCGCGGCTGGCGGTACCGTTGCCAATGGCGATCAGCTCCACCGAGTGTTTGGCGCACAGTGCGGCCATGATGGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCcagc < 1:865312/228‑1 (MQ=255) gcgGCTGGCGGTACCGTTGCCAATGGCGATCAGCTCCACCGAGTGTTTGGCGCACAGTGCGGACATGATGGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCcagcag < 1:335000/228‑1 (MQ=255) cgGCTGGCTGTACCGTTGCCAATGGCGATCAGCTCCACCGAGTGTTTGGCGCACAGTGCGGCCATGATGGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGacaagtggctgggtgaagtggt < 1:67561‑M1/236‑23 (MQ=255) cgGCTGGCGGTACCGTTGCCAATGGCGATCAGCTCCACCGAGTGTGTGGCGCACAGGGCGGCCATGATGGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCcag < 1:80000/224‑1 (MQ=255) tGGCGGTACCGTTGCCAATGGCGATCAGCTCCACCGAGTGTTTGGCGCACAGTGCGGCCATGATGGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAg > 1:955666/1‑235 (MQ=255) gAGTGTTTGGCGCACAGTGCGGCCATGATGGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGggc < 2:773843/179‑1 (MQ=255) aGTGTTTGGCGCACAGTGCGGCCATGATGGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCcagcagca < 2:811532/189‑1 (MQ=255) cGGCCATGATGGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACAtt > 1:574899/1‑199 (MQ=255) atgGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACa < 2:1078460/232‑1 (MQ=255) gAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCgg > 1:299234/1‑235 (MQ=255) gAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGt > 1:776394/1‑236 (MQ=255) gAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTGCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCcagcagcag > 2:567883/1‑161 (MQ=255) 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ggTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTcgc < 2:467993/204‑1 (MQ=255) gTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTcgcg > 2:910824/1‑204 (MQ=255) ccAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAggtggg > 1:163643/1‑233 (MQ=255) cAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGccccc < 1:539125/141‑4 (MQ=255) cAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCcagc < 1:318593/141‑1 (MQ=255) ttcGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGacaagtggctgggtgaagtggtgcgctggacctggaaggtcaagctgtacacccacctggaaaccgacctgttcggcgagctgcgcgacagtgccgaaggcgaggcgatcaatg < 1:898778‑M1/235‑115 (MQ=255) gccGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACa < 2:299233/203‑1 (MQ=255) tcGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGacaagtggctgggtgaagtggtgcgctggacctggaaggtcaagctgtacacccacctggaaaccgacctgttcggcgagctgcgcgacagt > 2:898777‑M1/1‑120 (MQ=255) tcGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACa > 2:681995/1‑204 (MQ=255) tcGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACa < 1:681996/204‑1 (MQ=255) ggCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCt < 1:1069094/235‑1 (MQ=255) cgcgTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGacaagtggctgggtgaagtggtgcgctggacctggaaggtcaagctgtacacccacctggaaaccgacctgttcggc > 1:1073212‑M1/1‑116 (MQ=255) 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agcagTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCa > 1:1038275/1‑236 (MQ=255) cagTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCt < 1:312461/197‑1 (MQ=255) tGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGAtcg < 1:104537/129‑1 (MQ=255) tGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCa > 2:234818/1‑143 (MQ=255) 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tCGAAGCCCAGGGGGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCACTTGTCGGCCGGCCGGCTGCGGTTCTCGATGCCGACGTGGTTGCCGATCATCAGCTc < 1:67097/236‑1 (MQ=255) cGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCACTTGTCGGCCGGCCGGCTGCGGTTCTCGATGCCGACGTGGTTGCCGATCATCAGCTCg > 1:646143/1‑236 (MQ=255) cccAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACa > 1:97352/1‑109 (MQ=255) cccAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCACTTGTCGGCCGGCCGGCTGCGGTTCTCGATGCCGACGTGGTTGCCGatca < 2:284940/223‑1 (MQ=255) cccAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCAGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACa < 2:97352/109‑1 (MQ=255) gggggCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCACTTGTCGGCCGGCCGGCTGCGGTTCTCGATGCCGACGTGGTTGCCGATCATCAGCTc < 1:298666/222‑1 (MQ=255) cgGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCACTTGTCGGCCGGCCGGCTGCGGTTCTCGATGCCGACGTGGTTGCCGATCATCAGc < 2:1038274/216‑1 (MQ=255) gggggCCGGCCGacaagtggctgggtgaagtggtgcgctggacctggaaggtcaagctgtacacccacctggaaaccgacctgttcggcgagctgcgcgacagtgccgaaggcgaggcgatcaatgtgttcgcccacaacctgcatgacctgctgctggccgccccggccggcccccgcgccaccctgggcttcgacccgggcctgcccaccggctg > 1:344969‑M1/1‑12 (MQ=255) ggccggccGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCGTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCACTTGTcggccggccgg < 1:712979/173‑1 (MQ=255) ccggccggGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCACTTGTCGGCCGGCCGGCTGCGGTTCTCGATGCCGACGTGGTTGCCGATCATCAGCTCGCATGGGTGCAGGGTGCCggg > 2:489830/1‑233 (MQ=255) ccggccggGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCACTTGTCGGCCGGCCGGCTGCGGTTCTCGATGCCGACGTGGTTGCCGATCATCAGCTCGCATGGGTGCAGGGTGCCGGGCa > 1:1006675/1‑235 (MQ=255) ccggccgacaagtggctgggtgaagtggtgcgctggacctggaaggtcaagctgtacacccacctggaaaccgacctgttcggcgagctgcgcgacagtgccgaaggcgaggcgatcaatgtgttcgcccacaacctgcatgacctgctgctggccgccccggccggcccccgcgccaccctgggcttcgacccgggcctgcgcaccggctgcaagatcgccgtggtcgacgc > 2:421896‑M1/1‑7 (MQ=255) cggGGCTGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCACTTGTcggccggccgg < 2:809466/166‑1 (MQ=255) cggGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAgc > 2:433175/1‑131 (MQ=255) cggGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAgc < 1:433176/131‑1 (MQ=255) agacaagtggctgggtgaagtggtgcgctggacctggaaggtcaagctgtacacccacctggaaaccgacctgttcggcgagctgcgcgacagtgccgaaggcgaggcgatcaatgtgttcgcccacaacctgcatgacctgctgctggccgccccggccggcccccgcgccaccctgggcttcgacccgggcctgcgcaccggctgcaagatcgccgtggtcgacgcaaccggca < 2:512145‑M1/235‑235 (MQ=255) | CAGCTTGTCGCTTTCGCGGCTGGCGGTACCGTTGCCAATGGCGATCAGCTCCACCGAGTGTTTGGCGCACAGTGCGGCCATGATGGAAATGGTGCGGTCCCAGTCGTTCTTCGGCGCGTGCGGGTAGACCGTGGTGTGGTCCAGCAGTTTGCCGGTTGCGTCGACCACGGCGATCTTGCAGCCGGTGCGCAGGCCCGGGTCGAAGCCCAGGGTGGCGCGGGGGCCGGCCGGGGCGGCCAGCAGCAGGTCATGCAGGTTGTGGGCGAACACATTGATCGCCTCGCCTTCGGCACTGTCGCGCAGCTCGCCGAACAGGTCGGTTTCCAGGTGGGTGTACAGCTTGACCTTCCAGGTCCAGCGCACCACTTCACCCAGCCACTTGTCGGCCGGCCGGCTGCGGTTCTCGATGCCGACGTGGTTGCCGATCATCAGCTCGCATGGGTGCAGGGTGCCGGGCAGTTCTT > AE015451/299680‑300143 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |