New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1196535 = | 44 (0.710) | 4 (0.070) | 4/328 | NT | 8.1% | coding (596/1755 nt) | xcpQ | Type II secretion pathway protein XcpQ |
? | AE015451 | 1196595 = | 49 (0.830) | coding (656/1755 nt) | xcpQ | Type II secretion pathway protein XcpQ |
CCACCCGCGTATTCAGCGTGCGCAACGCCGCCAGCGAACAGGTACTGGGCATCCTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCATGGTCGGCCCCGACAGCGAGCTGGCGGCGTACCGGG > AE015451/1196334‑1196765 | ccACCCGCGTATTCAGCGTGCGCAACGCCGCCAGCGAACAGGTACTGGGCATCCTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCa > 2:870975/1‑229 (MQ=255) cgTATTCAGCGTGCGCAACGCCGCCAGCGAACAGGTACTGGGCATCCTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTgcgc > 2:518886/1‑220 (MQ=255) gcgcAACGCCGCCAGCGAACAGGTACTGGGCATCCTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAg > 1:1082971/1‑235 (MQ=255) gcgcAACGCCGCCAGCGAACAGGTACTGGGCATCCTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGGGGTCAAg > 1:908753/1‑235 (MQ=255) cgcAACGCCGCCAGCGAACAGGTACTGGGCATCCTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGt > 1:424760/1‑236 (MQ=255) gTACTGGGCATCCTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGc < 2:418758/191‑1 (MQ=255) tCAAACCGCTGATCGACGCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTgg < 1:994501/195‑1 (MQ=255) cAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGt < 2:552927/159‑1 (MQ=255) cAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTTCGCCATGCCAAt > 1:541319/1‑181 (MQ=255) cAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCg > 1:642260/1‑235 (MQ=255) accatgaccacggcattggtcccttcttcgtattccaggcggatgcccgagccaccggcggctggcaccaccggccggtccttgccctctgcctcccccgcgccttcaaccggcaccgccccttcctggctgagccctcGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTgg > 1:335261‑M1/140‑187 (MQ=255) gATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAgg < 2:1082970/234‑1 (MQ=255) gcgAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTAc > 2:784508/1‑148 (MQ=255) gAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCa > 1:1058507/1‑195 (MQ=255) cattggtaccttcttcgtattccaggcggatgcccgagccaccggcggctggcaccaccggccggtccttgccctctgcctcacccgcgccttccaccggcaccgccccttcctggctgagccctcGCAGCACCCCGGTGAGCTACTTGCGCCATGCCCATGCCGGCg < 2:335260‑M1/42‑1 (MQ=255) tGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGaa < 2:463755/217‑1 (MQ=255) ttattaCACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTa > 2:313142/1‑136 (MQ=255) ttattaCACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGa < 2:692740/223‑1 (MQ=255) cttcgtattccaggcggatgcccgagccaccggcggctggcaccaccggccggtccttgccctctgcctcacccgcgccttcaaccggcaccgccccttcctggctgagccctcGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAgg > 1:22055‑M1/115‑178 (MQ=255) gtagtccaggcggatgcccgagccaccggcggctggcaccaccggccggtccttgccctctgccgcacccgcgccgtcaaccggcaccgccccttcctggctgagccctcGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAg > 2:91012‑M1/111‑173 (MQ=255) cccGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAggg > 1:552108/1‑169 (MQ=255) cccGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACCTGCGCCATGCCACTGCCGGCGGAGTGGTCac > 2:302523/1‑155 (MQ=255) ccGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCggt > 2:1023495/1‑233 (MQ=255) cggcggCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGGGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGCGCCg > 1:174171/1‑191 (MQ=255) ggcggcGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCATCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAg > 1:687004/1‑175 (MQ=255) aCCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCt > 2:730187/1‑160 (MQ=255) aCCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGc > 2:973100/1‑175 (MQ=255) aCCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGc < 1:973101/175‑1 (MQ=255) aCCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAgccgcc > 1:909295/1‑236 (MQ=255) aCCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGGGAGGCCGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGGCAgccgcc > 1:280320/1‑236 (MQ=255) cggcggctggcaccaccggccggtccttgccctctgcctcacccgcgccttcaaccggcaccgccccttcctggctgagccctcGCAGCAcc < 2:145645‑M1/8‑1 (MQ=255) agcaACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAAt < 1:870976/235‑1 (MQ=255) agcaACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAACGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGCTGcc > 2:1082340/1‑203 (MQ=255) ccTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACgaa > 1:639435/1‑235 (MQ=255) cTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGCCCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGAGCTACTTg < 2:237500/84‑1 (MQ=255) cGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCGCCCAGGTGATCTACGTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAgg < 2:249808/158‑1 (MQ=255) gCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATcc > 2:672725/1‑208 (MQ=255) cAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATg < 2:888165/233‑1 (MQ=255) cAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGCGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGaa > 1:865290/1‑214 (MQ=255) cAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGGTGAAGGCGCGGGGGAGGCCGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCa > 1:197243/1‑184 (MQ=255) gctgcGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTgg > 2:717591/1‑233 (MQ=255) ctgcGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCAt < 1:520261/236‑1 (MQ=255) cgccgcCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCgggg > 1:800514/4‑194 (MQ=255) cgcCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCa < 2:639434/232‑1 (MQ=255) cgcCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCATg > 2:777608/1‑234 (MQ=255) cGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGT‑GTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCggtggt > 2:758501/1‑161 (MQ=255) cTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCATGGTCGGCCCCGACAGCGAg < 1:518887/236‑1 (MQ=255) tcctggctgtgccctcgcagc > 2:342400‑M1/17‑21 (MQ=255) cGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCg > 2:1087060/1‑169 (MQ=255) cGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTg > 2:1010112/1‑200 (MQ=255) cagcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAgg < 2:345779/102‑1 (MQ=255) cagcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAgg > 1:345780/1‑102 (MQ=255) cagcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAAGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACAGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCATGGTCGGCCCCGACAGCGAGCTGGCGGCGTACCggg > 1:640831/1‑236 (MQ=255) cagcggcagcACCCAGGCCATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCg > 2:125792/1‑47 (MQ=255) | CCACCCGCGTATTCAGCGTGCGCAACGCCGCCAGCGAACAGGTACTGGGCATCCTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGGGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCATGGTCGGCCCCGACAGCGAGCTGGCGGCGTACCGGG > AE015451/1196334‑1196765 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |