New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2524484 = | 44 (0.710) | 3 (0.050) | 3/324 | NT | 7.7% | coding (1206/1686 nt) | PP_2213 | putative acyl‑CoA synthetase |
? | AE015451 | 2524563 = | 30 (0.510) | coding (1285/1686 nt) | PP_2213 | putative acyl‑CoA synthetase |
TGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATCACCACCTCCGGTTACCGTGTGGGGCCATTCGATGTGGAAAGCGCGTTGATCGAGCACCCGGCGGTGATCGAGGCAGCGGT > AE015451/2524252‑2524702 | tGAACACCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTcg < 1:695345/236‑1 (MQ=255) ttcttccagctcgacgctgccggcgtagccgctggccaataccacgaacgccttgatcagctcggtacgctccgggtcgggcttgccgatcaccgctgcctcgatcaccgccgggtgctcgatcaacgcgctttccacatcgaatggccccacacggtaaccggaggtggtgatcacgtcgtcgctacggccaacgaagctgatgctgccatccgggttcagctcgacagtGTcgc > 1:1000964‑M1/232‑236 (MQ=255) gTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTc < 1:488048/229‑1 (MQ=255) tCGCCGACGAGCTGGGCGTGCCCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTg < 2:406738/223‑1 (MQ=255) gACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTcgccg > 2:1038784/1‑196 (MQ=255) aCCATTCTCGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTAcc < 2:761963/217‑1 (MQ=255) acgccttgatcagctcggtacgctccgggtcgggcttgccgatcaccgctgcctcgatcaccgccgggtgctcgatcaacgcgctttccacatcgaatggccccacacggtaaccggaggtggtgatcacgtcgtcgctacggccaacgaagctgatgctgccatccgggttcagctcgacagtGgcgc < 2:313402‑M1/5‑1 (MQ=255) gATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTtcgtc < 1:566475/234‑1 (MQ=255) cGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGGTACCACGGc > 1:313403/1‑196 (MQ=255) gggcttgccgatcaccgctgcctcgatcaccgccgggtgctcgatcaacgcgctttccacatcgaatggccccacacggtaaccggaggtggtgatcacgtcgtcgctacggccaacgaagctgatgctgccatccgggttcagctcgacagtGtcgccgcg < 2:591261‑M1/9‑2 (MQ=255) aTGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGc > 1:309113/1‑186 (MQ=255) tGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCtgt > 2:167431/1‑162 (MQ=255) gcgttgCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGtac < 2:692171/207‑1 (MQ=255) gCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTCACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCtt > 2:706346/1‑198 (MQ=255) cTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTTCCGGCCa > 1:339103/1‑190 (MQ=255) ccaccaTGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTtcgtcg < 2:373949/194‑1 (MQ=255) caccaTGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGAc > 2:428292/1‑179 (MQ=255) aTGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAgcggcg > 1:2360/1‑210 (MQ=255) tcgatcaccgccgggtgctcgatcaacgcgctttccacatcgaatggccccacacggtaaccggaggtggtgatcacgtcgtcgctacggccaacgaagctgatgctgccatccgggttcagctcgacagtGtcgca > 1:319558‑M1/132‑136 (MQ=255) ggCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCgg > 1:905823/1‑188 (MQ=255) ggCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGa < 2:463260/223‑1 (MQ=255) caTCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTc < 2:309112/207‑1 (MQ=255) agccGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAg < 2:381625/120‑1 (MQ=255) aTCCGGTGCACCTGGGTGCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTtcgt < 2:60616/175‑1 (MQ=255) ggTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTtcgtc > 2:971033/1‑172 (MQ=255) aCCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGAccca > 1:219462/1‑155 (MQ=255) ggTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACAGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCaa > 1:128181/1‑167 (MQ=255) tCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTtcgtc < 1:1101881/159‑1 (MQ=255) ccGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATgg > 2:756699/1‑202 (MQ=255) ccGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGCCGGCAAGTACTACCTCAg > 1:902726/1‑172 (MQ=255) ccGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCGGCCGACCAAAGCCTtcgtcg > 1:135026/1‑156 (MQ=255) ggCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTc < 2:1033485/183‑1 (MQ=255) cccGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATCACCACCTCCgg < 1:375959/236‑1 (MQ=255) gccccacacggtaaccggaggtggtgatcacgtcgtcgctacggccaacgaagctgatgctgccatccgggttcagctcgacagtGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAgcgg < 1:771166‑M1/75‑1 (MQ=255) gccccacacggtaaccggaggtggtgatcacgtcgtcgctacggccaacgaagctgatgctgccatccgggttcagctcgacagtGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAgcgg > 2:771165‑M1/86‑160 (MQ=255) aTCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTcg < 1:1094667/78‑1 (MQ=255) aTCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTcg > 2:1094666/1‑78 (MQ=255) ccggaggtggtgatcacgtcgtcgctacggccaacgaagctgatgctgccatccggggtcagctcgacagtGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCctcgtca < 1:1077351‑M1/56‑2 (MQ=255) gtggtggACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGt < 2:446499/203‑1 (MQ=255) gACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTcggcggctgc > 2:147470/1‑86 (MQ=255) gACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGtactac > 2:724479/1‑129 (MQ=255) gCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATcacc > 2:801760/1‑199 (MQ=255) gCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATcacc < 1:801761/199‑1 (MQ=255) gTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTc > 1:238142/1‑122 (MQ=255) aCGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATCACCACCTCCGGTTACCGTGTGGGGCCAt < 2:977781/216‑1 (MQ=255) gagcggCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATCACCACCTCCgg < 1:307994/192‑1 (MQ=255) gCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCg > 2:619677/1‑135 (MQ=255) cagccagGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATCACCACCTCCGGTTACCGTGTGGGGCCATTCGATGTGGAAAGCGCGTTGATCGAGCACCCGGCGGt < 1:460932/236‑1 (MQ=255) agccagGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATCACCACCTCCGGTTACCGTGTGGGGCCATTCGATGTGGAAAGCGCGTTGATCGAGCACCCGGCGGTg > 1:1104950/1‑236 (MQ=255) cATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATCACCACCTCCGGTTACCGTGTGGGGCCATTCGATGTGGAAAGCGCGTTGATCGAGCACCCGGCGGTGATCGAgg < 1:535487/236‑1 (MQ=255) gCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATCACCACCTCCGGTTACCGTGTGGGGCCGTTCGATGTGGAAGGCGCGTTGATCGAGCACCCGGCGGTGATCGAGGCAGc > 2:1073989/1‑233 (MQ=255) gCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATCACCACCTCCGGTTACCGTGTGGGGCCATTCGATGTGGAAAGCGCGTTGATCGAGCACCCGGCGGTGATCGAGGCAGCGGt > 1:451932/1‑236 (MQ=255) gCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATCACCACCTCCGGTTACCGTGTGGGGCCATTCGATGTGGAAAGCGCGTTGATCGAGCACCCGGCGGTGATCGAGGCAGCGGt > 1:1124606/1‑236 (MQ=255) gTTGGCCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTtcgtc < 2:567443/69‑1 (MQ=255) gTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGcgacga > 2:1133809/1‑139 (MQ=255) | TGAACCCCGAAGTGATCCGCTGGTTCGCCGACGAGCTGGGCGTGACCATTCACGATCACTACGGCCAGACCGAACTGGGCATGGTGCTGTGCAACCACCATGGCCTGCAGCATCCGGTGCACCTGGGTTCTGCCGGCTATGCCATCCCCGGCCACCGCATCGTGGTGGTGGACGAGCAAGGTAACGAACTGCCAGCCGGCCAGCCAGGCATCCTCGCCGTTGACCGTGAGCAGTCGCCGCTGTGCTGGTTCGGCGGTTACCACGGCCTGCCGACCAAAGCCTTCGTCGGCAAGTACTACCTCAGCGGCGACACTGTCGAGCTGAACCCGGATGGCAGCATCAGCTTCGTTGGCCGTAGCGACGACGTGATCACCACCTCCGGTTACCGTGTGGGGCCATTCGATGTGGAAAGCGCGTTGATCGAGCACCCGGCGGTGATCGAGGCAGCGGT > AE015451/2524252‑2524702 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |