| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 2832682 = | 74 (1.200) | 7 (0.120) | 7/324 | NT | 9.0% | intergenic (‑30/+37) | PP_2485/PP_2486 | conserved protein of unknown function/NADH‑dependent flavin oxidoreductase, Oye family |
| ? | AE015451 | 2832710 = | 71 (1.220) | intergenic (‑58/+9) | PP_2485/PP_2486 | conserved protein of unknown function/NADH‑dependent flavin oxidoreductase, Oye family | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TCCCTGAGTGGGACGTCGCGAAACCAGAGCGCCGAAAAACCAAGCGCCTCTGCACGTTTGGCCAGCGCTACCTGATCTAGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTCGCCCCAGCCAGCTTTTATCACGCGATTTCCTCGTTCAGCGGTGTACT > AE015451/2832447‑2832915 | tCCCTGAGTGGGACGTCGCGAAACCAGAGCGCCGAAAAACCAAGCGCCTCTGCACGTTTGGCCAGCGCTACCTGATCTAGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAg < 1:259481/236‑1 (MQ=255)cttcagcggcaagattctctatgccggcaagtacaccgctgaacgaggaaatcgcgtgataaaagctggctggggcgacctgatcgcttttggtcgccccttcattgcgaaccccgacctgcccgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaacgctcaatg > 1:766207‑M1/236‑236 (MQ=255) tGGGACGTCGCGAAACCAGAGCGCCGAAAAACCAAGCGCCTCTGCACGTTTGGCCAGCGCTACCTGATCTAGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGcc < 1:97748/235‑1 (MQ=255) gcaagattctctatgccggcaagtacaccgctgaacgaggaaatcgcgtgataaaagctggctggggcgacctgatcgcttttggtcgccccttcattgcgaaccccgacctgcccgctcgtatcgccaacaactggccgcttaaccctgttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaacgctcaatGCCACGcc > 1:625525‑M1/228‑235 (MQ=255) gcaagattctctatgccggcaagtacaccgctgaacgaggaaatcgcgtgataaaagctggctggggcgacctgatcgcttttggtcgccccttcattgcgaaccccgacctgcccgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaacgctcaatGCCACg > 2:752857‑M1/228‑233 (MQ=255) agattctctatgccggcaagtacaccgctgaacgaggaaatcgcgtgataaaagctggctggggcgacctgatcgcttttggtcgccccttcattgcgaaccccgacctgcccgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaacgctcaatGCCACGccc < 1:647645‑M1/9‑1 (MQ=255) gcgAAACCAGAGCGACGAAAAACCAAGCGCCTCTGCACGTTTGGCCAGCGCTACCTGATCTAGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAg < 1:776476/219‑1 (MQ=255) ggcaagtacaccgctgaacgaggaaatcgcgtgataaaagctggctggggcgacctgatcgcttttggtcgccccttcattgcgaaccccgacctgcccgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaacgctcaatGCCACGcccc < 2:529099‑M1/10‑1 (MQ=255) gcCGAAAAACCAAGCGCCTCTGCACGTTTGGCCAGCGCTACCTGATCTAGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCAtt > 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aGCGCTACCTGATCTAGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGgt > 1:331616/1‑236 (MQ=255) cgcTACCTGATCTAGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGt < 1:812236/227‑1 (MQ=255) ggcgacctgatcgcttttggtcgccccttcattgcgaaccccgacctgcccgctcgtatcgccaacacctggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaacgctcaatg > 2:425051‑M1/163‑163 (MQ=255) gATCTATCATGCTCGGTGTATCGCCTGCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCATGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGGTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGcc < 2:174507/165‑1 (MQ=255) 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ccTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGACGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATg > 2:627184/1‑229 (MQ=255) catgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaacgctcaatGCCACg > 2:391883‑M1/65‑70 (MQ=255) catgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaacgctcaatGCCACg < 1:391884‑M1/6‑1 (MQ=255) ctTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACAtgct < 1:668942/154‑1 (MQ=255) ttGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGt < 2:354030/116‑1 (MQ=255) aGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATc > 1:1013053/1‑236 (MQ=255) taccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaacgctcaatGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAg < 1:530718‑M1/184‑1 (MQ=255) ggATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGa > 1:1029363/1‑183 (MQ=255) aTCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCgg > 2:639578/1‑190 (MQ=255) tCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGAt > 2:1007113/1‑229 (MQ=255) tGCTCGTTTGGTACATGCTTAACGTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCgg < 2:353601/123‑1 (MQ=255) gCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTCAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGc > 2:10322/1‑163 (MQ=255) gCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGAACAAAAGCGATCAGGTCGcccc > 1:89913/1‑236 (MQ=255) cTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCg < 2:748227/120‑1 (MQ=255) cTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCg > 1:748228/1‑120 (MQ=255) tCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCCGTTGTTGGCGa > 2:4896/1‑174 (MQ=255) tCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTCGCCccag > 1:1003255/1‑236 (MQ=255) cGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAgg < 1:677602/226‑1 (MQ=255) cATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTCGCCCCAGCCAGCttt > 2:605118/1‑234 (MQ=255) cgacttacaaatcctaaacgctcaatGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAg < 1:1001010‑M1/138‑1 (MQ=255) cgacttacaaatcctaaacgctcaatGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAg > 2:1001009‑M1/27‑164 (MQ=255) ttCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTCGCCCCAGCCAGCTTTTATCACGCGAtt < 1:685894/236‑1 (MQ=255) 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1:1003700/1‑234 (MQ=255) gCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGt > 1:348965/1‑68 (MQ=255) gCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGt < 2:348964/68‑1 (MQ=255) aaacgctcaatGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTCGCCCCAGCCAGCTTTTATCACGCGAtt > 2:530717‑M1/12‑225 (MQ=255) aaCGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGGAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTCGcccc < 2:331615/200‑1 (MQ=255) gAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTCGCCCCAGCCAGCTTTTATCACGCGATTTCCTCGTTCAGCGGTGTACt > 1:155691/1‑236 (MQ=255) gGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCAGTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGaa > 2:80649‑M1/2‑164 (MQ=255) aGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTCGCCCCAGCCAGCTTTTATCACGCGATTTCCTCGTTCAGCGGTGTACt < 1:1007114/235‑1 (MQ=255) | TCCCTGAGTGGGACGTCGCGAAACCAGAGCGCCGAAAAACCAAGCGCCTCTGCACGTTTGGCCAGCGCTACCTGATCTAGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTCGCCCCAGCCAGCTTTTATCACGCGATTTCCTCGTTCAGCGGTGTACT > AE015451/2832447‑2832915 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |