New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3237184 | 38 (0.610) | 4 (0.070) | 4/330 | NT | 9.5% | coding (678/1035 nt) | PP_2835 | putative oxidoreductase |
? | AE015451 | = 3237241 | 40 (0.670) | coding (735/1035 nt) | PP_2835 | putative oxidoreductase |
ATCGACCCGGTGTTCACCCCCAACCCGATTGCTGCCGGTATCCCGACCCAGGGTGAGCCGATCCTGCTGGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTCCTCGACGAAACCAGCTTCCTGGGGGGATTGGTTCTGGCAAGCCGCCCGCTAGACCCCGAACGCCCGGTACGCCTGCCC > AE015451/3236951‑3237418 | aTCGACCCGGTGTTCACCCCCAACCCGATTGCTGCCGGTATCCCGACCCAGGGTGAGCCGATCCTGCTGGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGc > 1:584377/1‑236 (MQ=255) ggTGTTCACCCCCAACCCGATTGCTGCCGGTATCCCGACCCAGGGTGAGCCGATCCTGCTGGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGcc < 1:80247/236‑1 (MQ=255) ccGATTGCTGCCGGTATCCCGACCCAGGGTGAGCCGATCCTGCTGGATGTGAGCATGTCCACCGTCCCCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCt < 1:701614/236‑1 (MQ=255) gctgcCGGTATCCCGACCCAGGGTGAGCCGATCCTGCTGGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAgg < 2:734881/221‑1 (MQ=255) ggTATCCCGACCCAGGGTGAGCCGATCCTGCTGGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGTAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGt < 1:617253/236‑1 (MQ=255) ccAGGGTGAGCCGATCCTGCTGGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCa > 1:729631/1‑236 (MQ=255) ccAGGGTGAGCCGATCCTGCTGGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCa > 1:971563/1‑236 (MQ=255) gAGCCGATCCTGCTGGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGcggcccggcc > 2:116918/1‑183 (MQ=255) ccGATCCTGCTGGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGc > 1:441283‑M2/1‑234 (MQ=255) gATCCTGCTGGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCCCAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTg > 1:330419/1‑208 (MQ=255) tgctgGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGctggc < 1:1122052‑M2/232‑6 (MQ=255) tgctgGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAACGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCcac > 2:530408/1‑182 (MQ=255) cAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGgcg > 1:42660/1‑234 (MQ=255) cATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCCGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGcc > 1:406356/1‑202 (MQ=255) aTGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTggg > 1:397561/1‑228 (MQ=255) ccACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATg < 2:584376/234‑1 (MQ=255) cgccGTCGCCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGGGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGcc < 2:307723/159‑1 (MQ=255) aCCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTg > 2:459031/1‑220 (MQ=255) cTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTg < 1:643602/236‑1 (MQ=255) cTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCCCAAGGGTTTTGCCCTTg > 1:677971/1‑163 (MQ=255) ggCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGAt > 1:746594/1‑219 (MQ=255) gATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGctggccg > 1:500435‑M2/1‑174 (MQ=255) gccggccgGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGc > 2:965420/1‑221 (MQ=255) ccggccggCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGt < 2:729630/207‑1 (MQ=255) cggccggcGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTCCCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCtt < 2:124098/139‑1 (MQ=255) gCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTc > 1:441793/1‑236 (MQ=255) gCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTc > 1:1042408/1‑236 (MQ=255) gCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGGGATTGACCCGCGCAt > 1:505566/1‑214 (MQ=255) aaTGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCg > 2:239375/1‑165 (MQ=255) tGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGccccgaggcgagggcttcgaccaacagcgcaagggcaaaa > 2:493550‑M1/1‑76 (MQ=255) tGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTCCTcg > 1:634223/1‑236 (MQ=255) tGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGGTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATg > 2:137890/1‑158 (MQ=255) cTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTCTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCCCTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCAt > 1:90537/1‑200 (MQ=255) aGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCACGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGa > 1:990478/1‑212 (MQ=255) aGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTCCTCGACGAAACCAGCt > 1:1121052/1‑235 (MQ=255) aGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTCCTCGACGAAACCAGCt > 1:952583/1‑235 (MQ=255) cGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGccccgaggtgagggcttcgaccaacagcgcaagggcaaaaccttcgtggccaaaggcctggccgccgagcgggaggatgctgccttgcgggc > 2:684427‑M1/1‑53 (MQ=255) gATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTcggcg < 1:56771/190‑1 (MQ=255) gtttCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGc < 1:270306/90‑1 (MQ=255) cTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTgg > 2:989172/1‑139 (MQ=255) cttACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTGGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCaa < 2:755571/118‑1 (MQ=255) ttACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTCCTCGACGAAACCAGCTTCCTGGGGGGATTGGTTCTGGc > 1:931991/1‑235 (MQ=255) tgcccgcccgCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCCCCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTg < 2:242753/150‑1 (MQ=255) gcccgcAAGGCAGCATCCTCCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACGAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGctggccgccgagcggcaggatgctgccttgcgggcgggtaaagaaatcgcccg > 2:684427‑M2/1‑92 (MQ=255) gcAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTCCTCGACGAAACCAGCTTCCTGGGGGGAtt > 1:927198/1‑216 (MQ=255) cAAGGCAGCATCCTGCCGCTGGGCGGCCAGccccgaggtgagggcttcgaccaacagcgcaagggcaaaacctttgtggccaaaggcctggccgccgagcggc > 2:708409‑M1/1‑30 (MQ=255) aaGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGccccgaggtgagggcttcgaccaacagcgcaagggcaaaacctttgtggccaaaggcctggccgccgagcggcaggg > 2:299102‑M1/1‑29 (MQ=255) ggCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTCCTCGACGAAACCAGCTTCCTGGGGGGATTGGTTCTGGCAAgc < 2:399803/225‑1 (MQ=255) ccctGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGctggccgccgagcggcaggatgctgcctt > 2:299102‑M2/2‑77 (MQ=255) gCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGctggccgcccagcggcaggatgctgccttg > 2:708409‑M2/1‑73 (MQ=255) cggcCAGccccgaggtgagggcttcgaccaacagcgcaagggcaaaacctttgtggccaaaggcctggccgccgagcggcaggatgctgccttgcgggcgggtaaagaaatcgcccgggtcatcgctgagctgcccgtcattgctcaccagcacagggtgcggcagacgccggccggcatc > 1:500435‑M1/1‑7 (MQ=255) gcCAGccccgaggtgagggcttcgaccaacagcgcaagggcaaaacctttgtggccaaaggcctggccgccgagcggcaggatgctgccttgcgggcgggtaaagaaatcgcccgggtcatcgctgagctgcccgtcattgctcaccagcacagggtgcggcagacgccggccggcatcgcggcattggccgaccaggccgagggtgacggtggacatgctgacatccagca < 1:1122052‑M1/232‑228 (MQ=255) gcCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTCCTCGACGAAACCAGCTTCCTGGGGGGATTGGTTCTGGCAAGCCGCCCGCTAGACCCCGAACGCCCGGTACGCCt < 1:456009/235‑1 (MQ=255) cAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTCCTCGACGAAACCAGCTTCCTGGGGGGATTGGTTCTGGCAAGCCGCCCGCTAGACCCCGAACGCCCGGTACGCCTGcc < 1:459032/236‑1 (MQ=255) gccccgaggtgagggcttcgaccaacagcgcaagggcaaaacctttgtggccaaaggcctggccgccgagcggcaggatgctgccttgcgggcgggtaaagaaatcgcccgggtcatcgctgagctgcccgtcattgctcaccagcacagggtgcggcagacgccggccggcatcgcggcattggccgaccaggccgagggtgacggtggacatgctgacatccagcaggatcgg > 1:441283‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATCGACCCGGTGTTCACCCCCAACCCGATTGCTGCCGGTATCCCGACCCAGGGTGAGCCGATCCTGCTGGATGTCAGCATGTCCACCGTCACCCTCGGCCTGGTCGGCCAATGCCGCGATGCCGGCCGGCGTCTGCCGCACCCTGTGCTGGTGAGCAATGACGGGCAGCTCAGCGATGACCCGGGCGATTTCTTTACCCGCCCGCAAGGCAGCATCCTGCCGCTCGGCGGCCAGGCCTTTGGCCACAAAGGTTTTGCCCTTGCGCTGTTGGTCGAAGCCCTCACCTCGGGGCTGGCCGGCCGTGGGCGCAAGGATGCACCGGATCAGTGGGGCGCCTCGGCCACTGCGCTGGTGATTGACCCGCGCATGTTCGGCGGCCTGGAGGCGTTCCTCGACGAAACCAGCTTCCTGGGGGGATTGGTTCTGGCAAGCCGCCCGCTAGACCCCGAACGCCCGGTACGCCTGCCC > AE015451/3236951‑3237418 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |