| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AE015451 | 3953277 = | 62 (1.000) | 4 (0.070) | 4/330 | NT | 6.2% | coding (1246/1977 nt) | PP_5606 | conserved exported protein of unknown function with YVTN beta‑propeller repeat |
| ? | AE015451 | 3953322 = | 62 (1.040) | coding (1201/1977 nt) | PP_5606 | conserved exported protein of unknown function with YVTN beta‑propeller repeat | |||||
TCAACGACGATGGCGGCGCGGGCCTGGTGACCGCGGTTGTTGTAGCCGGACATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTG > AE015451/3953054‑3953511 | tCAACGACGATGGCGGCGCGGGCCTGGTGACCGCGGTTGTTGTAGCCGGACATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCt < 1:968090/236‑1 (MQ=255) aaCGACGATGGCGGCGCGGGCCTGGTGACCGCGGTTGTTGTAGCCGGACATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCt < 2:423132/234‑1 (MQ=255) cgGGCCTGGTGACCGCGGTTGTTGTAGCCGGACATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGAtt > 2:1132716/1‑227 (MQ=255) tgttgtAGCCGGACATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGaggccagg < 1:891816/236‑1 (MQ=255) tgtAGCCGGACATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGaggccagg < 2:968230/233‑1 (MQ=255) aCATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAg > 1:722843/1‑236 (MQ=255) aTCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAgg < 1:136165/235‑1 (MQ=255) aTGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCAc < 1:557373/214‑1 (MQ=255) ccTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCa > 1:957276/1‑184 (MQ=255) ccTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGa > 1:474009/1‑235 (MQ=255) gCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGaggccaggcc < 2:749523/203‑1 (MQ=255) cATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGcc > 2:1099142/1‑167 (MQ=255) aTAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCttt > 2:641329/1‑222 (MQ=255) 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ccGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCACTACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCGGGTCTCCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCg < 2:595746/234‑1 (MQ=255) cGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCgg > 2:988671/1‑234 (MQ=255) cGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACCATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATa < 1:702527/186‑1 (MQ=255) gTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGAtgt > 1:589116/1‑236 (MQ=255) 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aCGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAg < 1:1043379/236‑1 (MQ=255) ggCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGccc < 2:694234/234‑1 (MQ=255) gCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGt > 1:774101/1‑236 (MQ=255) ggcctggCCTCGCCCATGCTGGCCAGATTGATCCTGCTCACTTTCGGCGCGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGtt < 2:158224‑M1/96‑1 (MQ=255) acagCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACATCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCTTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTc < 1:605680/232‑1 (MQ=255) cctggCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAg < 1:1083532‑M1/231‑1 (MQ=255) ggCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGc < 2:411868‑M1/232‑1 (MQ=255) cccTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTg > 1:28750/1‑236 (MQ=255) | TCAACGACGATGGCGGCGCGGGCCTGGTGACCGCGGTTGTTGTAGCCGGACATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTG > AE015451/3953054‑3953511 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |