New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3953277 = | 62 (1.000) | 4 (0.070) | 4/330 | NT | 6.2% | coding (1246/1977 nt) | PP_5606 | conserved exported protein of unknown function with YVTN beta‑propeller repeat |
? | AE015451 | 3953322 = | 62 (1.040) | coding (1201/1977 nt) | PP_5606 | conserved exported protein of unknown function with YVTN beta‑propeller repeat |
TTGTTGTAGCCGGACATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTGGACCGTGTGGCGCAACTGATGGCTGCGGGCATCGAACACCCGTACG > AE015451/3953090‑3953557 | gctgaacagggcctggggccgatgcgcttcagccatgatggccgctacggcatcgtgctcaatacccttgagaaccaggcactggtcatcgacgccagtaccgacaagctgatccaccacatcccggtggcggccgaaccgtaccagctgacgttcaccaaaggctatgcctatgtgcgtggcctggcctcgccgaaagtgagcatgatcaatctggccagcctgggcgaggcc < 2:411868‑M2/2‑1 (MQ=255) tgttgtAGCCGGACATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGaggccagg < 1:891816/236‑1 (MQ=255) ctgaacagggcctggggccgatgcgcttcagccatgatggccgctacggcatcgtgctcaatacccttgagaaccaggcactggtcatcgacgccagtaccgacaagctgatccaccacatcccggtggcggccgaaccgtaccagctgacgttcaccaaaggctatgcctatgtgcgtggcctggcctcgccgaaagtgagcatgatcaatctggccagcctgggcgaggccagg < 1:1083532‑M2/5‑1 (MQ=255) tgtAGCCGGACATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGaggccagg < 2:968230/233‑1 (MQ=255) aCATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAg > 1:722843/1‑236 (MQ=255) aTCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAgg < 1:136165/235‑1 (MQ=255) aTGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCAc < 1:557373/214‑1 (MQ=255) ccTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGa > 1:474009/1‑235 (MQ=255) gCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGaggccaggcc < 2:749523/203‑1 (MQ=255) 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ccGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCACTACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCGGGTCTCCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCg < 2:595746/234‑1 (MQ=255) cGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCgg > 2:988671/1‑234 (MQ=255) cGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACCATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATa < 1:702527/186‑1 (MQ=255) gTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGAtgt > 1:589116/1‑236 (MQ=255) 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cACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCa > 1:694235/1‑236 (MQ=255) aCGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAg < 1:1043379/236‑1 (MQ=255) ggCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGccc < 2:694234/234‑1 (MQ=255) gCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGt > 1:774101/1‑236 (MQ=255) ggcctggCCTCGCCCATGCTGGCCAGATTGATCCTGCTCACTTTCGGCGCGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGtt < 2:158224‑M1/96‑1 (MQ=255) acagCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACATCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCTTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTc < 1:605680/232‑1 (MQ=255) cctggCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAg < 1:1083532‑M1/231‑1 (MQ=255) ggCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGc < 2:411868‑M1/232‑1 (MQ=255) gcctcgccgaaagtgagcatgatcaatctggccagcctgggcgaggCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGa < 1:409168‑M2/99‑1 (MQ=255) cccTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTg > 1:28750/1‑236 (MQ=255) CTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTGGa < 1:523267‑M1/236‑1 (MQ=255) CCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCt > 2:1057577‑M1/1‑196 (MQ=255) cAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGccc < 2:581522/217‑1 (MQ=255) aaGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGaggcca < 2:775462/40‑1 (MQ=255) aaGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGaggcca > 1:775463/2‑41 (MQ=255) tGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCTCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGccc > 2:605679/1‑205 (MQ=255) tGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTGGACCGTGTgg > 2:614853/1‑233 (MQ=255) gCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAgcg < 2:745909/194‑1 (MQ=255) aTCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCa > 2:936045/1‑187 (MQ=255) aTCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTGGACCGTGTGGCGCa > 2:786292/1‑226 (MQ=255) tCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTGGACCGTGTGGCGCAACTGATGGCTg < 1:614854/236‑1 (MQ=255) gCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGc < 2:474008/155‑1 (MQ=255) aCTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTGGACCGTGTGGCGCAACTGATGGCTGCGGGCa > 2:962962/1‑234 (MQ=255) aCTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTGGACCGTGTGGCGCAACTGATGGCTGCGGGCATc < 1:835506/236‑1 (MQ=255) ttCGGCAAGGCCAGGCCACGCACATAGGCCTAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAATGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCTTCATGGCTGAAgcg < 2:1052752/173‑1 (MQ=255) cGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCAGAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATg < 2:529286/145‑1 (MQ=255) ccaggccaCGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTGGACCGTGTGGCGCAACTGATGGCTGCGGGCATCGAACACCCGTACg > 1:110074/1‑236 (MQ=255) | TTGTTGTAGCCGGACATCGGTGCATTCATGCCTTCGGCATAGAAGTAGGTGGTGTTGTCCACCGGGTTGACCACGAACACCGAATTGTCATCACGCGATACCGACAGCCCCTGGGCCAGTGGCAGGTCACCGGCCTGGCGCGGCGCTGCCGGGCCAGCCTCGAAGCCTTGCACGATGGGCGAACGCCCCTCGCCCAGGCTGGCCAGATTGATCATGCTCACTTTCGGCGAGGCCAGGCCACGCACATAGGCATAGCCTTTGGTGAACGTCAGCTGGTACGGTTCGGCCGCCACCGGGATGTGGTGGATCAGCTTGTCGGTACTGGCGTCGATGACCAGTGCCTGGTTCTCAAGGGTATTGAGCACGATGCCGTAGCGGCCATCATGGCTGAAGCGCATCGGCCCCAGGCCCTGTTCAGCCTGGACCGTGTGGCGCAACTGATGGCTGCGGGCATCGAACACCCGTACG > AE015451/3953090‑3953557 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |