New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4792835 | 67 (1.080) | 4 (0.070) | 4/330 | NT | 5.9% | coding (1005/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase (subunit of ferribactin synthase) |
? | AE015451 | = 4792856 | 63 (1.060) | coding (984/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase (subunit of ferribactin synthase) |
GGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTCGCCACGGTAGCTGGGCAGCGCCGGACGCAGGTGATCGCTCGGCAATTGCAACACGGGGTG > AE015451/4792622‑4793089 | ggTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGc > 1:103639‑M2/1‑235 (MQ=255) tGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGc < 1:713255/236‑1 (MQ=255) tGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGc < 1:690747/236‑1 (MQ=255) tGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGc < 1:507740/236‑1 (MQ=255) tGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGc > 2:29001/1‑218 (MQ=255) cGGGCTCACGCCCCCGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCcgcg < 1:531967/236‑1 (MQ=255) gCTCACGCCCCCGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACt < 1:607271/236‑1 (MQ=255) cGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAg < 1:31568/236‑1 (MQ=255) cAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTgcggttgcggtt > 2:823313/1‑183 (MQ=255) cAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTgg > 2:262314/1‑185 (MQ=255) cAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTAcc > 1:568417/1‑208 (MQ=255) cAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTacaaca > 1:25068/1‑236 (MQ=255) cAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTacaaca > 1:755160/1‑236 (MQ=255) 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1:500401/235‑1 (MQ=255) cTGGTCGAACGGCACGGCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCcagc < 1:1079261/235‑1 (MQ=255) tCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGc < 2:1039902/168‑1 (MQ=255) gAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTAc > 1:417254/1‑180 (MQ=255) cGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGGTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTacaa < 2:872055/199‑1 (MQ=255) gTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCCCCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACt < 1:301479/179‑1 (MQ=255) ctgcgccGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCGCTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACCCCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTg < 2:404956/169‑1 (MQ=255) gcgccGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACg > 1:894122/1‑209 (MQ=255) cgccgcACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGt < 2:391551/221‑1 (MQ=255) 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atgaAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCa > 1:322882/1‑183 (MQ=255) atgaAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAg < 1:939089/200‑1 (MQ=255) cAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGa > 2:758903/1‑55 (MQ=255) cAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGa < 1:758904/55‑1 (MQ=255) cAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTCGCCACGGTAGCTGGGCAGCGCCGGa > 2:1094111/1‑225 (MQ=255) aaCCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTggccagg < 1:1007627/169‑6 (MQ=255) gATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTCGCCACGGTAGCTGGGCAGCGCCGGACGCAGGTGATCGCTCg > 1:591051/1‑236 (MQ=255) accAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTGGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAgg < 2:126162/151‑1 (MQ=255) aCTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGaaa < 2:371801/79‑1 (MQ=255) cTGcggttgcttcatcaatacccaggtgctgcagaccgacatcgatccgactcagggtggtgcgcacctgctgagccaggtcaaagcctgtgcggcgcaggcgcaatcgcaccaggacgtgccgttcgaccagctggtggaagcgctgggcctggagcgcaccgggggcgtgagcccgctgttccaggtgcttttcaaccatcagtcgatggtcaccgacgtcgccactgtgcgca < 1:970550‑M2/236‑234 (MQ=255) cTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTg > 2:359004/1‑120 (MQ=255) tgcggttgcggtTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTCGCCACGGTAGCTGGGCAGCGCCGGACg > 2:460168/1‑202 (MQ=255) | GGTGACCATCGACTGATGGTTGAAAAGCACCTGGAACAGCGGGCTCACGCCCCCGGTGCGCTCCAGGCCCAGCGCTTCCACCAGCTGGTCGAACGGCACGTCCTGGTGCGATTGCGCCTGCGCCGCACAGGCTTTGACCTGGCTCAGCAGGTGCGCACCACCCTGAGTCGGATCGATGTCGGTCTGCAGCACCTGGGTATTGATGAAGCAACCGATCAGCCCCTCCACTTCACTGCGGTTGCGGTTGGCGATCGGCACACCGACGCGTACCCGCGACTGGCCGCTGTAGCGGTACAACAAGGTCTTGAAAGCGGCCAGCAGCACCACGAACAGCGTGACGTTGTGCCGCCTGGCCAGGGCCTGCAGGCGCTGGGCCAACGCTGCATCGATTTGCAGCTCCAGGCGTTCGCCACGGTAGCTGGGCAGCGCCGGACGCAGGTGATCGCTCGGCAATTGCAACACGGGGTG > AE015451/4792622‑4793089 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |