| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 5205320 | 63 (1.020) | 3 (0.050) | 3/326 | NT | 3.9% | coding (1113/1209 nt) | PP_4586 | conserved exported protein of unknown function |
| ? | AE015451 | = 5205480 | 89 (1.520) | coding (953/1209 nt) | PP_4586 | conserved exported protein of unknown function | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CACATCCGAACGCCGCCCCAGCACGTTCTCGCTGATCTGCACGAAGTCCTCGGTACTGACGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCGGGCACTGTTCAGGTACAACGAGCCCTGCGCAGCCATAGCCCC > AE015451/5205248‑5205706 | cacaTCCGAACGCCGCCCCAGCACGTTCTCGCTGATCTGCACGAAGTCCTCGGTACTGACGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGGCCTGCTTGCTCAGACg < 2:393347‑M2/234‑2 (MQ=255) cccAGCACGTTCTCGCTGATCTGCACGAAGTCCTCGGTACTGACGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGt > 1:597743/1‑235 (MQ=255) cAGCACGTTCTCGCTGATCTGCACGAAGTCCTCGGTACTGACGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCa > 1:35930/1‑225 (MQ=255) cGTTCTCGCTGATCTGCACGAAGTCCTCGGTACTGACGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTg < 2:1003085/226‑1 (MQ=255) tcGCTGATCTGCACGAAGTCCTCGGTACTGACGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTCTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGAc < 2:638453/205‑1 (MQ=255) gCTGATCTGCACGAAGTCCTCGGTACTGACGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGAc < 1:422807/203‑1 (MQ=255) aaGTCCTCGGTACTGACGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGTTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATcccgc > 2:986196/1‑229 (MQ=255) agagacaggTACTGACGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAgcgg < 1:610606/229‑1 (MQ=255) gTACTGACGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTaaca > 1:817468/1‑235 (MQ=255) cGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTg > 1:128315/1‑236 (MQ=255) cAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTACCACCTCGTTGGCGtaat > 1:117321/1‑236 (MQ=255) cAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGtaat > 1:512680/1‑236 (MQ=255) cAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGtaat > 1:1009446/1‑236 (MQ=255) cAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGta > 2:745248/1‑234 (MQ=255) cAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGta > 2:706870/1‑234 (MQ=255) cAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTACCTTATCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCg > 2:610605/1‑189 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tCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATcccgcc > 2:1011450/1‑182 (MQ=255) tCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAg < 2:964639/221‑1 (MQ=255) tCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAg > 1:964640/1‑221 (MQ=255) cGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATcccgcc > 1:605982/1‑181 (MQ=255) 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acgTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGt > 1:639417/1‑236 (MQ=255) acgTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATGTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATcccgccc < 2:105102/172‑1 (MQ=255) gTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCCCGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTGGAGCCGGTTGCCCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGt < 1:373795/234‑1 (MQ=255) gTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCAACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATcccgccc < 2:1121838/170‑1 (MQ=255) 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aCAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGACAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCCCAATCTGCGCGCACAGTTGCAcctgt > 1:54637/1‑221 (MQ=255) cGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGt < 1:932962/180‑1 (MQ=255) gCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACggg < 2:974350/229‑1 (MQ=255) cACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACGCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGc > 1:40/1‑153 (MQ=255) ggCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGtttt < 1:1129403/236‑1 (MQ=255) gCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACgcgcctgcccagcgtcagtaccgaggacttcgtgcagatcagcgagaacgtgctggggcggcgttcggatgtgctgcagagcaaggtgttgcactaaggcccgtatgaaaagccttgcctgaccttcgtctcaa < 2:819546‑M2/201‑135 (MQ=255) cACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTgc < 2:937421/187‑1 (MQ=255) tGGGCCGGGCTTGCGCGCTCAGCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGAGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGTGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTg > 2:1073879/1‑234 (MQ=255) tGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGaa > 2:784553/1‑235 (MQ=255) ggCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACgcgcctgcccagcgtccgtaccgaggactacgtgcagatcagcgagaacgtgctggggcggcgttcggatgtgctgcagagcaaggtgttgcact < 2:908018‑M2/149‑96 (MQ=255) ggCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGc > 1:419877/1‑236 (MQ=255) gCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGcc < 1:662918/236‑1 (MQ=255) ttGCGCGCTCCCCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCgg < 1:334727/236‑1 (MQ=255) ttGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCCAGCGGCGTCACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCCCTCTACCAGCCAGTCCCTGCCGTCACGCCCCCCAATCTg > 2:314339/1‑172 (MQ=255) tGCGCGCTCACCCTTTAGCCGTTTGCCCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCggg < 1:60499/236‑1 (MQ=255) tGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCCGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGCACAGTTGccc > 2:204297/1‑184 (MQ=255) tGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGcc > 2:962171/1‑233 (MQ=255) gcgcgcTCCCCCTTGAGCCGGTTGCCCTTTGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCggg < 1:28513/235‑1 (MQ=255) gcgcgcTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTgg > 2:274655/1‑112 (MQ=255) gcgcgcTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTgg < 1:274656/112‑1 (MQ=255) gcgcTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCg < 2:523866/231‑1 (MQ=255) cgcTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGctgtctct > 1:808705/1‑228 (MQ=255) gcTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTc < 2:814471/122‑1 (MQ=255) gcTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGcc < 2:861935/208‑1 (MQ=255) aCCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCGGGCACTGTTCa < 1:784554/236‑1 (MQ=255) cTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGttt < 2:808704/205‑1 (MQ=255) cGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGTCCATGGGCCgg < 2:89906/216‑1 (MQ=255) tGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCGGGCACTGTTCAGGTAc < 2:710133/227‑1 (MQ=255) gACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTTCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTAccagcc > 2:862260/1‑119 (MQ=255) gACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCGGGCACTGTTCAg > 2:494838/1‑222 (MQ=255) gACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCGGGCACTGTTCAGGTACAACGAGccc > 1:594463/1‑235 (MQ=255) gACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCGGGCACTGTTCAGGTACAACGAGCCCt < 1:745249/236‑1 (MQ=255) gACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGGTGCACCAATTCGCGCAGCCACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCGGGCa > 1:453985/1‑214 (MQ=255) aCCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTgcgc < 2:346188/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCgg < 1:1063978/208‑1 (MQ=255) ttGGCGCCCTGCTTGCTCAGAc < 2:27264/22‑1 (MQ=255) gcgcCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCg < 2:100692/93‑1 (MQ=255) cTGCTTGCTCAGACgcgcctgcccagcgtcagtaccgaggacttcgtgca > 2:283113‑M2/1‑14 (MQ=255) tgctCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGAcc > 2:125556/1‑185 (MQ=255) ctCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCGGGCACTGTTCAGGTACAACGAGCCCTGCGCAGcctggacttc < 2:408026/233‑9 (MQ=255) aGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCAGCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTgc < 2:54637/126‑1 (MQ=255) | CACATCCGAACGCCGCCCCAGCACGTTCTCGCTGATCTGCACGAAGTCCTCGGTACTGACGCTGGGCAGGCGCATCAGCCCACGCACTACATCGTCCAACGAACGTTTGGCCTGGGTGTGAATGCGGATTTCCTTGTCCAATGCCTGCAACAGCATCACGCCACGGGCCACCTGGGCCGGGCTTGCGCGCTCACCCTTGAGCCGGTTGACCTTGGCGCCCTGCTTGCTCAGACGCGCCTGCCAGACCTGGTAGCGGTCATCACTCATCCCGCCCGAGCGGCGTAACAACTCGTTGGCGTAATAATCGGTCAGGCTCTCTACCAGCCAGTCACTGCCGTCACGCCCCTCAATCTGCGCGAACAGTTGCACCAATTCGCGCAGCAACGGGCTATTGCCGTTTTCGCTGACCATGGGCCGGGCACTGTTCAGGTACAACGAGCCCTGCGCAGCCATAGCCCC > AE015451/5205248‑5205706 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |