| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AE015451 | = 5384862 | 64 (1.030) | 6 (0.100) | 6/320 | NT | 9.3% | coding (1326/1671 nt) | lldP | L‑lactate permease |
| ? | AE015451 | = 5384850 | 58 (1.010) | coding (1314/1671 nt) | lldP | L‑lactate permease | |||||
CCGGCGGTGTTCAAGCTCGACCCGATCTCCGCCACCGGCACCGCGATCTTCCTTTCGGCGCTGATCTCGATGGCGGTGCTGAAGATCAACTTCAAAACTGGTCTTACCACTTTCAAAGAAACCTTCTGGGAACTGCGCTGGCCGATTCTGTCGATCGGCATGGTGTTGGCCTTCGCCTTCGTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTCGCCGCAATCGATCGCCGTGGCCTGCGCCGCTACCGGCC > AE015451/5384626‑5385082 | ccGGCGGTGTTCAAGCTCGACCCGATCTCCGCCACCGGCACCGCGATCTTCCTTTCGGCGCTGATCTCGATGGCGGTGCTGAAGATCAACTTCAAAACTGGTCTTACCACTTTCAAAGAAACCTTCTGGGAACTGCGCTGGCCGATTCTGTCGATCGGCATGGTGTTGGCCTTCGCCTTCGTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCG < 1:367209‑M1/235‑1 (MQ=255) ggcggTGTTCAAGCTCGCCCCGATCTCCGCCACCGGCACCGCGATCTTCCTTTCGGCGCTGATCTCGATGGCGGTGCTGAAGATCAACTTCAAAACTGGTCTTACCACTTTCAAAGAAACCTTCTGGGAACTGCGCTGGCCGATTCTGTCGATCGGCATGGTGTTGGCCTTCGCCTTCGTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGgcg < 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gACCCGATCTCCGCCACCGGCACCGCGATCTTCCTTTCGGCGCTGATCTCGATGGCGGTGCTGAAGATCAACTTCAAAACTGGTCTTACCACTTTCAAAGAAACCTTCTGGGAACTGCGCTGGCCGATTCTGTCGATCGGCATGGTGTTGGCCTTCGCCTTCGTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGttctt > 1:349631/1‑236 (MQ=255) cGATCTCCGCCACCGGCACCGCGATCTTCCTTTCGGCGCTGATCTCGATGGCGGTGCTGAAGATCAACTTCAAAACTGGTCTTACCACTTTCAAAGAAACCTTCTGGGAACTGCGCTGGCCGATTCTGTCGATCGGCATGGTGTTGGCCTTCGCCTTCGTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCg > 1:509120/1‑236 (MQ=255) gATCTCCGCCACCGGCACCGCGATCTTCCTTTCGGCGCTGATCTCGATGGCGGTGCTGAAGATCAACTTCAAAACTGGTCTTACCACTTTCAAAGAAACCTTCTGGGAACTGCGCTGGCCGATTCTGTCGATCGGCATGGTGTTGGCCTTCGCCTTCGTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGgccggtaccggccag > 1:559686‑M2/1‑202 (MQ=255) 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cttcgTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCt > 2:197504/1‑128 (MQ=255) cttcgTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGCTCCGGGTCAACGa > 1:792549/1‑189 (MQ=255) cttcgTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCtgg > 1:1088976/1‑200 (MQ=255) cACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCcagcaccagggccatgggcgaggacatgcccgagtagttggtgacgaggcgaaggccaacaccatgccgagcgacagaatcggcaagagcaggtcccagaaggg > 1:119788‑M1/1‑55 (MQ=255) ctCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTCGCCGCAat < 1:197504/236‑1 (MQ=255) tCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCtggtg < 1:551385/186‑1 (MQ=255) gggCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGt > 1:238881/1‑165 (MQ=255) gccATGTCTTCGACCATGGCCCTCGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCCTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCCCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCg < 2:715682/130‑1 (MQ=255) tGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGgccggtaccggccagcaccagggccatggtcgaggacatgcccgagtagttggtgacgaaggcgaaggccaacaccatgccgatcgacagaatcggccagcgcagttcccagaaggtttctttgaaagtggtaagaccagttttgaagttgatcttcagcaccgccatcgagatcagcgccgacaggaagatcgcggggcaggtg < 1:274467‑M2/231‑206 (MQ=255) tGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCcaccac > 2:327848/1‑142 (MQ=255) cTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTCGCCGCAATCGATCGCCGt < 1:980577/234‑1 (MQ=255) catgtgccTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCTTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAAcc < 1:103826/190‑1 (MQ=255) cATGGCCCTGGTGCTGgccggtaccggccagcaccagggccatggtcgcggacatgcccgagtagttggggacgaaggcgaaggccaacaccatgccgatcgacagaatcggccag < 2:41175‑M2/116‑101 (MQ=255) cccTGGTGCTGGCCGGTACCGTCGCCGCGTTGCCGTGCTTCGCGCCGTTCCTCGCCTGGCTGGGCGTGGTCCTGACCGGCTCggg > 2:360156/1‑84 (MQ=255) cccTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCAcc > 2:993408/1‑135 (MQ=255) cccTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTCGCCGCAATCGATCGCCGTGGCCTGcgccgc > 1:551774/1‑235 (MQ=255) cTGGTGCTGgccggtaccggccagcaccagggccatggtcgaggacatgcccgagtagttggtgacgaaggcgaaggccaacaccatgccgatcgacagaatcggccagcgcagttcccagaaggtttctttgaaagtggtaagaccagttttgaacttgatcttcagca > 1:697909‑M2/1‑9 (MQ=255) gCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCCACACCCGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTcgccc > 1:233355/1‑201 (MQ=255) caggCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGCGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGc > 1:164961/3‑92 (MQ=255) cTGGCCGGTACCGGCcagcaccagggccatggtcgaggacatgcccgagtagttggtgacgaaggcgaaggccaacaccatgccgatcgacagaatcggccagcgcagttcccagaaggtttctttgaaagtggtaagaccagttttgaagttgatcttcagcaccgccatcgagatcagcgccgaaaggaagatcgcggtgccggtggcggagatc > 1:559686‑M1/1‑15 (MQ=255) cTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTCGCCGCAATCGATCGCCGTGGCCTGCGCCGCTACCGGcc > 1:659107/1‑235 (MQ=255) | CCGGCGGTGTTCAAGCTCGACCCGATCTCCGCCACCGGCACCGCGATCTTCCTTTCGGCGCTGATCTCGATGGCGGTGCTGAAGATCAACTTCAAAACTGGTCTTACCACTTTCAAAGAAACCTTCTGGGAACTGCGCTGGCCGATTCTGTCGATCGGCATGGTGTTGGCCTTCGCCTTCGTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTCGCCGCAATCGATCGCCGTGGCCTGCGCCGCTACCGGCC > AE015451/5384626‑5385082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |