New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 5540355 = | 81 (1.310) | 5 (0.080) | 5/328 | NT | 6.4% | coding (631/2355 nt) | ygiQ | putative enzyme of unknown function |
? | AE015451 | 5540477 = | 69 (1.170) | coding (509/2355 nt) | ygiQ | putative enzyme of unknown function |
CTCGTACCAGCCCTGCGGGGTATCGCGGCGCACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGTGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGATCATCGAGTCCATGTTGCCGGCGGCCACACCGAAGAACAGGTTCGGTTCGCCGAGCTTCATGAAGTCGTCTTTCG > AE015451/5540242‑5540690 | ctcGTACCAGCCCTGCGGGGTATCGCGGCGCACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGTGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCa < 1:499026/236‑1 (MQ=255) ccAGCCCTGCGGGGTATCGCGGCGCACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGTGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCAc < 2:594560/231‑1 (MQ=255) cAGCCCTGCGGGGTATCGCGGCGCACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGTGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCg < 1:28069/235‑1 (MQ=255) ccTGCGGGGTATCGCGGCGCACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGTGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGcaca < 1:886374/236‑1 (MQ=255) cTGCGGGGTATCGCGGCGCACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGTGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGCTGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCa > 1:233131/1‑224 (MQ=255) cTGCGGGGTATCGCGGCGCACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGTGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGcacct > 2:781714/1‑234 (MQ=255) ctacacccctggtggcctggccggcagccgtccggaccgtgccagcctggtgtatagccagcgctgcaaggaggcctacaagcatgtgccgatcgtgctcggcggcatcgaggcttcgctgcgccgcatcgcccactacgactactggcaggacaaggttcgtcactcgatcctgatcgatgccagcgccgacatcctgctgttcggcaacgccgagcACGATCGGc < 2:946635‑M2/9‑1 (MQ=255) aTCGCGGCGCACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGTGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGt < 2:706895/233‑1 (MQ=255) ggcgCACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGTGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGcctcc > 1:696998/1‑236 (MQ=255) gcgcACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGTGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGcctcc < 1:1063215/235‑1 (MQ=255) cACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGGGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGc < 2:478152/214‑1 (MQ=255) 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tctcGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTcc < 1:296961/236‑1 (MQ=255) tcGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGcctcc > 2:822935/1‑198 (MQ=255) cttctCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGCTGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTg > 2:195957/1‑220 (MQ=255) ttctCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGcctcc < 2:819328/192‑1 (MQ=255) 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ggACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGCCGGCggccggcccg > 1:287532/1‑232 (MQ=255) gACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACGGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCggcca < 2:600495/232‑1 (MQ=255) gACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAg < 2:647124/186‑1 (MQ=255) gACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCggccaggcc < 1:427214/236‑1 (MQ=255) 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cTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGAtctt > 1:694701/1‑177 (MQ=255) cTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGt > 2:725361/1‑182 (MQ=255) cTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCCCATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGaa < 2:118611/163‑1 (MQ=255) tGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGATCATCGAGTCCATGTTGCCGGCGGCCACACCGAAGAACAggt > 1:447382/1‑235 (MQ=255) cAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGgtg < 1:771333/180‑1 (MQ=255) atcctgatcgatgccagcgccgacgtcctgctgttcggcaacgccgagcACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAgc < 2:267106‑M2/34‑1 (MQ=255) tgccagcgccgacatcctgctgttcggcaacgccgagcACGATCGGCACATGCtt < 2:28278‑M2/17‑1 (MQ=255) ggCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCggc < 1:887028/114‑1 (MQ=255) ggCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCggc > 2:887027/1‑114 (MQ=255) ggCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTa < 2:1037418/168‑1 (MQ=255) gATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGATCATCGAGTCCATGTTGCCGGCGGCCACACCGAAGAACAGGTTCGGTTCGCCGAGCTTCATg > 1:626853/1‑235 (MQ=255) aTGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGatc < 2:847119/174‑1 (MQ=255) aTGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGATCATCGAGTCCATGTTGCCGGCGGCCACACCGAAGAACAGGTTCGGTTCGCCGAGCTTCATg > 2:455765/1‑234 (MQ=255) tGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGATCATCGAGTCCATGTTGCCGGCGGCCACACCGAAGAACAGGTTCGGTTCGc < 2:396282/222‑1 (MQ=255) cggcgCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCgg < 1:442634/165‑1 (MQ=255) ggcgCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCCATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCAGCGTCGGAACGGGTCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCg > 2:274975/1‑163 (MQ=255) gcAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGATCATCGAGTCCATGTTGCCGGCGGCCACACCGAAGAACAGGTTCGGTTCGCCGAGCTTCATGAAGTCGTCt < 1:345569/236‑1 (MQ=255) aGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTc < 1:631871/146‑1 (MQ=255) aGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTc > 2:631870/1‑146 (MQ=255) aGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTGGATCATCGCGt > 1:112429/1‑172 (MQ=255) cGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGATCATCGAGTCCATGtt < 1:116359/177‑1 (MQ=255) gAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGATCATCGAGTCCATGTTGCCGGCGGCCACACCGAAGAACAGGTTCGGTTCGCCGAGCTTCATGAAGTCGTCTTTCg < 1:727092/235‑1 (MQ=255) gccgagcACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGATCATCGAGTCCATGTTGCCGGCGGCCACACCGAAGAACa < 2:631829‑M2/178‑1 (MQ=255) aCGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGATCATCGAGTCCATGTTGCCGGCGGCCACACCGAAGAACAGGTTCGGTTCGCCGAGCTTCa > 2:959762/1‑199 (MQ=255) | CTCGTACCAGCCCTGCGGGGTATCGCGGCGCACGAAGGCGGTGCCGCGCACGTCGGTGATGGTCTCGATCTTCTCCCCGTTGGACAGGCGCTGGGCCACCTCGACCACCGCACGCTCGGCGTTGCCGAACAGCAGGATGTCGGCGCTGGCATCGATCAGGATCGAGTGACGAACCTTGTCCTGCCAGTAGTCGTAGTGGGCGATGCGGCGCAGCGAAGCCTCGATGCCGCCGAGCACGATCGGCACATGCTTGTAGGCCTCCTTGCAGCGCTGGCTATACACCAGGCTGGCACGGTCCGGACGGCTGCCGGCCAGGCCACCAGGGGTGTAGGCATCGTCGGAACGGATCTTCTTGTCCGCGGTGTAGCGGTTGATCATCGAGTCCATGTTGCCGGCGGCCACACCGAAGAACAGGTTCGGTTCGCCGAGCTTCATGAAGTCGTCTTTCG > AE015451/5540242‑5540690 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |