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tgtgGGACAGCCCCAACGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGGCCGATGCCGATGCCATCGAGCGCGGCTGGCAGCTGGTGCAGCGCGGCGTGTGGCTGTGGCTGCTGGTGATCTGc < 2:739681/203‑1 (MQ=255) gtgGGACAGCCCCAACGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGGCCGATGCCGATGCCATCGAGCGCGGCTGGCAGCTGGTGCAGCGCGGCGTGTGGCTGTGGCTGCTGGTGATCTGCCTGGGGGCCTATATCAATGCTTGAACATGGTGgc < 1:84204/236‑1 (MQ=255) cgtggtacacCGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGGCCGATGCCGATGCCATCGAGCGCGGCTGGCAGCTGGTGCAGCGCGGCGTGTGGCTGTGGCTGCTGGTGATCTGCCTGGGGGc < 2:1174173‑M1/195‑1 (MQ=255) cAGCCCCAACGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGGACTGCCTGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGgccgatgcc > 2:355433/1‑130 (MQ=255) ccccacCGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGGCCGATGCCGATGCCATCGAGCGCGGCTGGCAGCTGGTGCAGCGCGGCGTGTGGCTGTGGCTGCTGGTGATCTGCCTGGGGGCCTATATCAATGCTTGAACAtggtg > 1:115723‑M1/7‑225 (MQ=255) cAACGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGGCCGATGCCGATGCCATCGAGCGCGGCTGGCCGCTGGTGCCGCGCGGCGTGTGGCTGTGGCTGCTGGTGATc > 2:83487/1‑187 (MQ=255) cAACGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGGCCGATGCCGATGCCATCGAGCGCGGCTGGCAGCTGGTGCAGCGCGGCGTGTGGCTGTGGCTGCTGGTGATCTGCCTGGGGGCCTATATCAATGCTTGAACATGGTGGCCGCCTGt > 2:1237288/1‑231 (MQ=255) cAACGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGGCCGATGCCGATGCCATCGAGCGCGGCTGGCAGCTGGTGCAGCGCGGCGGGTGGCTGTGGCTGCTGGTGATCTg > 2:563896/1‑189 (MQ=255) cAACGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGGCCGATGCCGATGCCATCGAGCGAGGCTGGCAGCTGGTGCAGCGCGGCGTGTGGCTGTGGCTGCTGGTGATCTGCCTGGGGGCCTATATCAATGCTTGAACATGGTGGCCGCCTGTTAcg > 1:761827/1‑235 (MQ=255) agCGCGGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGGCCGATGCCGATGCCATCGAGCGCGGCTGGCAGCTGGTGCAGCgcgg > 2:435184‑M1/3‑161 (MQ=255) acCGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCCCGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGGCTGGGCGAGGGGCCAGTGgccg < 2:376882‑M1/116‑1 (MQ=255) aCGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGGCCGATGCCGATGCCATCGAGCGCGGCTGGCAGCTGGTGCAGCGCGGCGTGTGGCTGTGGCTGCTGGTGATCTGCCTGGGGGCCTATATCAATGCTTGAACATGGTGGCCGCCTGTTAcgcgc > 1:454072/1‑236 (MQ=255) | GGTGGCCGGTGCGCCCGGTGTGGTGCTGTACCGCCTGAGCAACACGCTGGATGCCATGTGGGGCTACCGTAACGAACGTTTCGAGCGCTTTGGCTGGTGCGCGGCGCGCATCGACGATGTGCTCAACTATATACCTGCAAGGCTGGTGGCCCTGACTTATGCACTGTTGGGCAAGACCCGCCTGGCCCTGGCCTGCTGGCGCAAGCAGGGCCCGCTGTGGGACAGCCCCAACGCCGGGCCGGTGATGGCTGCCGGCGCCGGTGCGCTGGGCGTGGAGCTTGGTGGCCCGGCGGTGTACCACGGCGAACTGCATGAGCGGCCGCGTCTGGGCGAGGGGCCAGTGGCCGATGCCGATGCCATCGAGCGCGGCTGGCAGCTGGTGCAGCGCGGCGTGTGGCTGTGGCTGCTGGTGATCTGCCTGGGGGCCTATATCAATGCTTGAACATGGTGGCCGCCTGTTACGCGC > AE015451/1870293‑1870758 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |