New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1892525 | 76 (1.060) | 6 (0.090) | 5/330 | NT | 7.5% | intergenic (+35/‑60) | PP_1697/PP_1698 | transcriptional regulator, GntR family/Major facilitator family transporter |
? | AE015451 | = 1892529 | 76 (1.130) | intergenic (+39/‑56) | PP_1697/PP_1698 | transcriptional regulator, GntR family/Major facilitator family transporter |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCGATGCCGGCCTGATCAGTGGCCTG > AE015451/1892300‑1892755 | tCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCcacg < 2:622243‑M2/234‑5 (MQ=255) gCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCcacggcg < 1:573923‑M2/235‑8 (MQ=255) aaaCCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCcacggc > 1:231404‑M2/1‑215 (MQ=255) aaaCCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGcc > 1:1193416/1‑235 (MQ=255) cgAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCacac > 2:1136662/1‑234 (MQ=255) aaGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTcac < 1:622248/230‑1 (MQ=255) gTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACt < 1:583134/235‑1 (MQ=255) gACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCAGAGCTGCAACGGCGCAGTGGc > 2:245700/1‑206 (MQ=255) ccGCTTGCTGCACCTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCcacggcgc > 1:238866‑M2/1‑178 (MQ=255) cGCTTGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTCCTGCCACGGCGCACTGGCTTCGCCTGCCCGTCacact > 2:723319/1‑209 (MQ=255) ttGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGtgctg < 1:233140/173‑1 (MQ=255) gctgcAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCTGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACTAc > 1:268846/1‑211 (MQ=255) gctgcAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcgg < 1:189109‑M2/232‑61 (MQ=255) gctgcAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCcacg < 1:975758‑M2/176‑5 (MQ=255) gctgcAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCCCACCCACGACTa > 2:267073/1‑213 (MQ=255) gctgcAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGaa > 2:746402/1‑216 (MQ=255) gctgcAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGc > 1:66201/1‑236 (MQ=255) tgcAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTg > 1:418203/1‑236 (MQ=255) gcAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCcacggcgcagacaggtgaagggtgaagc > 1:566408‑M2/1‑169 (MQ=255) tGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATaa < 1:384514/214‑1 (MQ=255) cggccgACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCga < 1:625999/236‑1 (MQ=255) cggccgACAGCCCGGTGGTCGTGAGCGAGCGCCTGGCCCGCGAGTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCga < 1:362021/236‑1 (MQ=255) gccgccAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACg < 1:446687/196‑1 (MQ=255) ccgACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGAt < 1:508084/236‑1 (MQ=255) cccGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCa < 1:1136667/236‑1 (MQ=255) ccGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATc < 1:980535/205‑1 (MQ=255) tCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCAc < 1:92303/229‑1 (MQ=255) gggATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACg < 2:1148508/176‑1 (MQ=255) aTCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAACCCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcgg > 2:189106‑M2/1‑138 (MQ=255) 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(MQ=255) cATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTtc < 1:625446/236‑1 (MQ=255) ttAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGcc > 2:298489/1‑189 (MQ=255) aCCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATcgccg < 1:24389/221‑1 (MQ=255) cGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCt > 1:941815/1‑166 (MQ=255) cGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGGGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTc < 2:418198/191‑1 (MQ=255) ggTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTTGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCcgcg > 1:152880/1‑220 (MQ=255) ggTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCaa < 2:573918/234‑1 (MQ=255) cGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCg < 1:1227906/236‑1 (MQ=255) gCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGgcagcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaagtgctgcgcatggccgcgcgagcggcgccattccagaggtttgccggcgtaatcgcgggccaggcgctcgatcacgaccaccgggctgtcggccggcagttgc > 1:566408‑M1/1‑28 (MQ=255) gCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGgcagcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaa < 1:262951‑M1/94‑67 (MQ=255) gCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGgcagcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaa > 2:262947‑M1/1‑28 (MQ=255) gCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCGACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGTGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTAGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAggg > 2:794037/1‑233 (MQ=255) cttcacccttcaccTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTc > 1:882408/1‑185 (MQ=255) acccttcaccTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCcg < 2:66200/197‑1 (MQ=255) acccgtccccTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCg < 1:209499/230‑1 (MQ=255) ccttcaccTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCGATGCCgg < 1:623906/235‑1 (MQ=255) ccttcaccTGCCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCGATGCCgg < 1:668720/235‑1 (MQ=255) tcaccTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCga < 2:728618/97‑1 (MQ=255) cTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGCAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCggcggc > 2:25340/1‑139 (MQ=255) cTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCGATGCCGGCCTGATCa > 1:472006/1‑236 (MQ=255) cTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAAGGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTtct < 1:440949/202‑1 (MQ=255) ggcgcCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTtc < 2:931863/199‑1 (MQ=255) gcgcCGTGgcagcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaagtgctgcgcatggccgcgcgagcggcgccattccagaggtttgccggcgtaatcgcgggccaggcgctcgatcacgaccaccgggctgtcggccggcaggtgcagcaagcgg > 1:238866‑M1/1‑8 (MQ=255) gcgcCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCg > 2:943514/1‑167 (MQ=255) gcgcCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCCTCCCCGCGCTGATCGCCTCGTTCTCCCTGCCCACggg > 1:33824/1‑213 (MQ=255) gcgcCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATc > 1:881653/1‑178 (MQ=255) gcgcCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCGATGCCGGCCTGATCa > 1:871358/1‑230 (MQ=255) gcgcCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCGATGCCGGCCTGATCAGTGGc > 1:506943/1‑235 (MQ=255) gcgcCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCGATGCCGGCCTGATCAGTGGc > 1:373891/1‑235 (MQ=255) cggcCGTGCGGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCt < 2:1062069/139‑1 (MQ=255) cgcCGTGgcagcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaagtgctgcgcatggccgcgcgagcggcgccattccagaggtttgccggcgtaatcgcgggccaggcgctcgatcacgaccaccgggctgtcggccggcagttgcagcaagcggccatgcaccgcgtcgaccgcttcggcggtcagggtttcttcggcgtaggc < 1:573923‑M1/235‑229 (MQ=255) gcCGTGgcagcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaagtgctgcgcatggccgcgcgagcggcgccattccagaggtttgccggcgtaatcgcgggccaggcgctcgatcacgaccaccgggctgtcggccggcagttgcagcaagcggccatgcaccgcgtcgaccgcttcggcggtcagggttt > 1:231404‑M1/1‑6 (MQ=255) gcCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTg < 2:1109390/203‑1 (MQ=255) gcCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTg > 1:1109395/1‑203 (MQ=255) gcCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCGATGCCGGCCTGATc > 1:229445/1‑227 (MQ=255) cGTGgcagcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaagtgctgcgcatggccgcgcgagcggcgccattccagaggtttgccggcgtaatcgcgggccaggcgctcgatcacgaccaccgggctgtcggccggcagttgcagcaagcggccatgcaccgcgtcgaccgcttcggcggtcagggtttcttcggcgtaggcga < 2:622243‑M1/234‑231 (MQ=255) cGTGgcagcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaagtgctgcgcatggccgcgcgagcggcgccattccagaggtttgccggcgtaatcgcgggccaggcgctcgatcacgaccaccgggctgtcggccggcagttgcagc < 1:975758‑M1/176‑173 (MQ=255) cGTGgcagcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaagtgctgcgcatggccgcgcgagcggcgccattccagaggtttgccggcgtaatcgcgggccaggcgctcgatcacgaccaccgggctgtcggccggcagttgcagc > 2:975753‑M1/1‑4 (MQ=255) cGTGgcagcacggcgcagacaggtgaagggtgaagcgaccggtttaacgaatgtcgatgcggtagcggaagtgctgcgcatggccgcgcgagcggcgccattccagaggtttgccggcgtaat > 2:267739‑M1/1‑4 (MQ=255) cGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCGATGCCGGCCTGAt > 1:984716/1‑224 (MQ=255) | TCGCCTACGCCGAAGAAACCCTGACCGCCGAAGCGGTCGACGCGGTGCATGGCCGCTTGCTGCAACTGCCGGCCGACAGCCCGGTGGTCGTGATCGAGCGCCTGGCCCGCGATTACGCCGGCAAACCTCTGGAATGGCGCCGCTCGCGCGGCCATGCGCAGCACTTCCGCTACCGCATCGACATTCGTTAAACCGGTCGCTTCACCCTTCACCTGTCTGCGCCGTGCTGCCACGGCGCAGTGGCTTCGCCTGCCCGTCACACCCACGACTAGAAGGATAACAATCATGTTCAGCTGGTATCGCGAGATCACCTCACGGGAACGCAAGACATTCTGGGCCTGTTTCGGCGGCTGGTCGCTCGATGCGCTGGAAGTGCAGATGTTCGGCCTGGCCATCCCCGCGCTGATCGCCGCGTTCTCCCTGACCAAGGGCGATGCCGGCCTGATCAGTGGCCTG > AE015451/1892300‑1892755 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |