New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1920720 = | 41 (0.570) | 3 (0.040) | 3/336 | NT | 7.9% | coding (158/963 nt) | PP_1720 | Alcohol dehydrogenase, zinc‑containing |
? | AE015451 | 1920741 = | 31 (0.450) | coding (179/963 nt) | PP_1720 | Alcohol dehydrogenase, zinc‑containing |
TGGAGCCGGGCAAATACTGCAAAAGGCCTGAGGTAAGCGACCTCAGGCCCAGTCATGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAGCGGCGCCATGGCCGAGGAAGTGGTGGTCGATGCCCGTCACGTATTGCCGGTACCCGAAGGCCTTGGCCTGCATGAGGCGGCAGCGTTGCCGGAGGTGTATGCCACCG > AE015451/1920487‑1920926 | cttctcgccagccttcactgcaccgagctggaagatgttcagccaggcggtggcatacacctccggcaacgctgccgcctcatgcaggccaaggccttcgggtaccggcaatacgtgacgggcatcgaccaccacttcctcggccatggcgccgctggccagcagggcgcaaacgcggtcacccacgcgccaggcggcaccagcccccacctcttcaaccaccccggaacactCCa > 1:99365‑M1/234‑236 (MQ=255) ccGGGCAAATACTGCAAAAGGCCTGAGGTAAGCGACCTCAGGCCCAGTCATGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGc < 2:925430/233‑1 (MQ=255) ggCAAATACTGCAAAAGGCCTGAGGTAAGCGACCTCAGGCCCAGTCATGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCAt < 2:1072878/234‑1 (MQ=255) tGCAAAAGGCCTGAGGTAAGCGACCTCAGGCCCAGTCAGGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAg < 1:17179/220‑1 (MQ=255) aaGGCCTGAGGTAAGCGACCTCAGGCCCAGTCATGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAgtg > 1:504768/1‑236 (MQ=255) ccTGAGGTAAGCGACCGCAGGCCCAGTCATGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTcc < 1:23953/236‑1 (MQ=255) tggaagatgttcagccaggcggtggcagacacctccggcaacgctgccgcctcatgcaggccaaggccttcgggtaccggcaatacgtgacgggcatcgaccaccacttcctcggccatggcgccgctggccagcagggcgcaaacgcggtcacccacgcgccaggcggcaccagcccccacctcttcaaccaccccggaacactCCa > 1:106129‑M1/206‑208 (MQ=255) aGGTAAGCGACCTCAGGCCCAGTCATGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCgggg < 1:548051/236‑1 (MQ=255) aCCTCAGGCCCAGTCATGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCt < 2:1259605/213‑1 (MQ=255) ccTCAGGCCCAGTCATGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCgg < 2:658394/224‑1 (MQ=255) caggcggtggcatacacctccggcaacgctgccgcctcatgcaggccaaggccttcgggtaccggcaatacgtgacgggcatcgaccaccacttcctcggccatggcgccgctggccagcagggcgcaaacgcggtcacccacgcgccaggcggcaccagcccccacctcttcaaccaccccggaacactCCAGcc < 2:471856‑M1/6‑1 (MQ=255) tgcATGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCAt < 1:94088/189‑1 (MQ=255) cATGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGt > 1:63626/1‑236 (MQ=255) aTTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCAt < 2:984248/185‑1 (MQ=255) aTTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGtt < 2:467226/214‑1 (MQ=255) tCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCCTTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAACCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGggt > 1:792701/1‑208 (MQ=255) accTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTG‑ACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCgggg < 2:1250694/202‑1 (MQ=255) aCTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAGGGGGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGACCGCCCGCCCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCAt < 1:255573/180‑1 (MQ=255) tgccgcctcatgcaggccaaggccttcgggtaccggcaatacgtgacgggcatcgaccaccacttcctcggccatggcgccgctggccagcagggcgcaaacgcggtcacccacgcgccaggcggcaccagcccccacctcttcaaccaccccggaacactCCAg > 2:1076349‑M1/162‑165 (MQ=255) gtgAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCATCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGa > 1:1241069/1‑179 (MQ=255) aGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCGGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGt > 1:390660/1‑235 (MQ=255) cATGGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCgg < 2:24086/181‑1 (MQ=255) cAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGTGTGTTCCGGGGTGGtt > 1:364727/1‑183 (MQ=255) aGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCATCAGGTGCCAGCCCAt < 2:1241064/152‑1 (MQ=255) aGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTgcgc > 1:277173/1‑231 (MQ=255) aGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCctg > 1:1196649/1‑235 (MQ=255) tGACGGACATGTGGACTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCt < 2:1219353/200‑1 (MQ=255) gACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAgcggc < 1:622654/236‑1 (MQ=255) tgGCGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGACAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGATcg < 2:694895/205‑1 (MQ=255) cGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGttt > 1:1007816/1‑200 (MQ=255) cGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGttt < 2:1007811/200‑1 (MQ=255) gggACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCctgct < 2:781023/188‑1 (MQ=255) aGTGCACTTTCGCGTGGCCGTTGCGGGGCTGAACCGCGCGGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTCCCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGa < 1:408399/105‑1 (MQ=255) 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gcCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTGCCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAGCGGCGCCAt < 1:112032/155‑1 (MQ=255) ccGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAGCGGCGCCATGGCCGAGGAAGTGGTGGTCGATGCCCGTCACGTATTGcc < 2:849221/193‑1 (MQ=255) ccGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAGCGGCGCCATGGCCGAGGAAGTGGTGGTCGATGCCCGTCACGTATTGCCGGTACCCGAAGGCCTTGGCCTGCATGAGGCGGCAGCGTTGCCg > 1:726645/1‑236 (MQ=255) cGACCTGCTGCAGATGAAGGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAgcggc < 1:416256/148‑1 (MQ=255) aggcggcaccagcccccacctcttcaaccaccccggaacactCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGAACGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAGCGGCGCCATGGcc < 1:29102‑M1/113‑1 (MQ=255) cAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGTGCTg > 2:112029/1‑54 (MQ=255) aTGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGttt < 2:1056774/115‑1 (MQ=255) gAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAGCGGCGCCATGGCCGAGGAAGTGGTGGTCGATGCCCGTCACGTATTGCCGGTACCCGAAGGCCTTGGCCTGCATGAGGCGGCAGCGTTGCCGGAGGTGTATGCCACCg > 1:710466/1‑236 (MQ=255) aGGGTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGttt < 1:189209/110‑1 (MQ=255) tttGTCCCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCAt < 2:259264/32‑1 (MQ=255) cccGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAGCGGCGCCATGGCCGAGGAAGTGGTGGTCGATGCCCGTCACGTATTGCCGGTACCCGAAGGCCTTGGCCTGCATGAggcggc < 2:63625/198‑1 (MQ=255) caGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAGCGGCGCCATGGCCGAGGAAGTGGTGGTCGATGCCCGTCACGTATTGCCGGTACCCGAAGGCCTTGGCCTGCATGAGGCGGCAGCGTTg < 2:556143/194‑1 (MQ=255) aGGTGCCAGCCCATACAGGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAGCGGCGCCATGGCCGAGGAAGTGGTGGTCGATGCCCGTCACGTATTGCCGGTAcc < 2:423600/159‑1 (MQ=255) | TGGAGCCGGGCAAATACTGCAAAAGGCCTGAGGTAAGCGACCTCAGGCCCAGTCATGATTCAACTATGGAGGCACTGTGAAGGCATTGCAAGGCGTTGACGGACATGTGGAGTGGGTCGAGGCCGAACGCCCGACCTGTGACGCGGGCCAAGTGCGCATTCGCGTGGCCGCTGCGGGGCTGAACCGCGCCGACCTGCTGCAGATGAAAGGTTTGTACCCGCCACCACCAGGTGCCAGCCCATACATGGGGCTGGAGTGTTCCGGGGTGGTTGAAGAGGTGGGGGCTGGTGCCGCCTGGCGCGTGGGTGACCGCGTTTGCGCCCTGCTGGCCAGCGGCGCCATGGCCGAGGAAGTGGTGGTCGATGCCCGTCACGTATTGCCGGTACCCGAAGGCCTTGGCCTGCATGAGGCGGCAGCGTTGCCGGAGGTGTATGCCACCG > AE015451/1920487‑1920926 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |