| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 4244769 | 78 (1.090) | 3 (0.040) | 3/334 | NT | 3.9% | coding (252/1191 nt) | aruH | Arginine‑‑pyruvate transaminase AruH |
| ? | AE015451 | = 4244795 | 74 (1.090) | coding (226/1191 nt) | aruH | Arginine‑‑pyruvate transaminase AruH | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AATGCGCTCGGCGACGTCACGCGGGCACACGCGAAAGCCATTCTCGGGCTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTG > AE015451/4244535‑4244999 | aaTGCGCTCGGCGACGTCACGCGGGCACACGCGAAAGCCATTCTCGGGCTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCcgctgcgct > 1:429801/1‑236 (MQ=255) gCGACGTCACGCGGGCACACGCGAAAGCCATTCTCGGGCTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACg > 1:632595/1‑236 (MQ=255) aGCCATTCTCGGGCTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGcc < 1:560994/236‑1 (MQ=255) ccATTCTCGGGCTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGgcgca < 2:939811‑M2/229‑6 (MQ=255) ccATTCTCGGGCTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGgcg < 2:862910‑M2/227‑4 (MQ=255) tcGGGCTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGgcg > 1:1016448‑M2/1‑218 (MQ=255) tcGGGCTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCa > 2:652337/1‑229 (MQ=255) cTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTa > 1:623678/1‑236 (MQ=255) ttGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTa < 1:862915/235‑1 (MQ=255) gACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACAt < 1:731378/236‑1 (MQ=255) gTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCg < 1:488351/236‑1 (MQ=255) ccaccTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACgg > 2:352915/1‑182 (MQ=255) ccaccTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGt > 2:1001764/1‑235 (MQ=255) gcCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACgg > 2:241798/1‑172 (MQ=255) acaGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGtgctgg < 2:1025230/175‑6 (MQ=255) caGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGgcgca > 1:1241371‑M2/1‑182 (MQ=255) gggcCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGAGCACCTCATCGCCGGGGTGGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTg < 2:110920/177‑1 (MQ=255) gcgcCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGc > 1:1125221/1‑235 (MQ=255) ggCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGgcc < 1:1147418/235‑1 (MQ=255) gCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGAt < 2:447198/230‑1 (MQ=255) gTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAgcgcgc < 1:968937/214‑1 (MQ=255) atacatCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGa > 2:1224166/1‑215 (MQ=255) atacatCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGgcg < 1:1001769/236‑1 (MQ=255) catCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATg > 1:599465/1‑186 (MQ=255) atCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGcgcg < 2:651144/234‑1 (MQ=255) cGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCg < 2:1001515/126‑1 (MQ=255) cGGCAACGGTCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGCCCCCCGCCATCACCGTCCCCTGGGCGGCTCTCACCGCCTGTCCGCAGCGCTGCCggc > 2:324870/1‑122 (MQ=255) cGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGc > 2:353748/1‑133 (MQ=255) ggCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGa > 1:470410/1‑236 (MQ=255) aCGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAgt > 2:671384/1‑227 (MQ=255) cGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAgcgc > 1:165221/1‑186 (MQ=255) aCCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGgcgcagcggccaggcggtgagcgccgaccaggggacggggctggcggggggc < 1:115898‑M2/183‑53 (MQ=255) aCCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCg < 1:1236495/232‑1 (MQ=255) ccTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTc < 1:847044/229‑1 (MQ=255) aTCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCAACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGcc < 1:544764/144‑1 (MQ=255) cGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCgg > 1:287001/1‑210 (MQ=255) gCCTGGGTCGAGTATGCTCTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAgcgc > 2:507585/1‑132 (MQ=255) gCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGa > 2:470582/1‑218 (MQ=255) gTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGAcagca < 1:95726/236‑1 (MQ=255) tCGAGTAGGCACGGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGAcagca < 1:739153/235‑1 (MQ=255) aGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGAcagcagca < 1:1224171/235‑1 (MQ=255) gggCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGgcgcag < 2:390574‑M2/109‑7 (MQ=255) ggCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAg > 1:542000/1‑182 (MQ=255) ggCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGAtgtccttg < 1:1039473/235‑1 (MQ=255) 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gggCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCCGGCTGt > 2:871983/1‑138 (MQ=255) gggCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGAcagca > 1:876801/1‑198 (MQ=255) gggCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAgcgc > 1:1260586/1‑229 (MQ=255) gggCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGgc > 1:1016297/1‑235 (MQ=255) gggCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGGCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGgc > 1:433617/1‑235 (MQ=255) ggCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCg < 1:390579/109‑1 (MQ=255) ggCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCg < 1:232613/109‑1 (MQ=255) gccccccgcCAGCCCCGTCCCCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCcaggccatcgccaaccgtcaccggcagcgcagcggccaggcggtgagcgccgaccaggtgacggtgctggcgggggcccagtgcgcattgtactgcgtggcccagtgcatactcgacccaggcgatgaggt < 1:115898‑M1/181‑132 (MQ=255) cccccGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGt > 2:936380/1‑98 (MQ=255) cccccGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGt < 1:936385/98‑1 (MQ=255) cccccGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTcg < 1:1001813/149‑1 (MQ=255) cccccGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTcg > 2:1001808/1‑149 (MQ=255) cccccGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCa > 2:474162/1‑228 (MQ=255) cccccGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGcgcg > 1:553079/1‑235 (MQ=255) ccccGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTcgac > 2:243886/1‑150 (MQ=255) ccccGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGgcgc > 2:738460/1‑233 (MQ=255) cccGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGgcgcagcggccaggcggtgagcgccgaccaggtgacg > 2:115895‑M2/1‑74 (MQ=255) cGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGt < 1:1158711/236‑1 (MQ=255) cAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCCCACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCCgg > 2:45735/1‑124 (MQ=255) gCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATg > 1:230896/1‑236 (MQ=255) cGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCcaggccatcgccaaccgtcaccggcagcgcagcggccaggcggtgagcgccgaccaggtgacggtgctggcggg > 2:115895‑M1/1‑37 (MQ=255) aCCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAgg < 2:470405/213‑1 (MQ=255) tGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGgcgc > 2:775840/1‑214 (MQ=255) gTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGgcg < 2:976306/137‑1 (MQ=255) gcgcTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGcc < 1:352920/236‑1 (MQ=255) tCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGAcc > 2:937354/1‑161 (MQ=255) cGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCgg < 1:939816/236‑1 (MQ=255) gctgcgctgcCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCCGCTTGCCGCGCACAt > 2:69671/1‑59 (MQ=255) gctgcgctgcCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGAtgtccttgtcct > 2:645896/1‑170 (MQ=255) ctgcgctgcCGGTGACGGTGGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTg < 1:327443/236‑1 (MQ=255) cTGCGCcaggccatcgccaaccgtcaccggcagcgcagcggccaggcggtgagcgccgaccaggtgacggtgctggcgggggcccagtgcgcattgtactgcgtggccc < 2:390574‑M1/109‑104 (MQ=255) tgcgctgcCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGAtgtccttg < 1:23759/164‑1 (MQ=255) tGCGCcaggccatcgccaaccgtcaccggcagcgcagcggccaggcggtgagcgccgaccaggtgacggtgctggcgggggcccagtgcgcattgtactgcgtggcccagtgcatactcgacccaggcgatgaggtgatcgttgccgaaccgatgtatgtcacctacgaggccgtgttcggcgcctgtggcgccaaggtggtgccggtaccggtcaagcccgagaatgg < 2:939811‑M1/229‑225 (MQ=255) tGCGCcaggccatcgccaaccgtcaccggcagcgcagcggccaggcggtgagcgccgaccaggtgacggtgctggcgggggcccagtgcgcattgtactgcgtggcccagtgcatactcgacccaggcgatgaggtgatcgttgccgaaccgatgtatgtcacctacgaggccgtgttcggcgcctg > 1:1241371‑M1/1‑5 (MQ=255) cgctgcCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGcc < 1:406424/221‑1 (MQ=255) cgccaggccatcgccaaccgtcgccgg < 2:118801‑M1/27‑25 (MQ=255) cgccaggccatcgccaaccgtcaccggcagcgcagcggccaggcggtgagcgccgaccaggtgacggtgctggcgggggcccagtgcgcattgtactgcgtggcccagtgcatactcgacccaggcgatgaggtgatcgttgccgaaccgatgtatgtcacctacgaggccgtgttcggcgcctgtggcgccaaggtggtgccggtaccggtcaagcccgagaatgg < 2:862910‑M1/227‑225 (MQ=255) cgccaggccatcgccaaccgtcaccggcagcgcagcggccaggcggtgagcgccgaccaggtgacggtgctggcgggggcccagtgcgcattgtactgcgtggcccagtgcatactcgacccaggcgatgaggtgatcgttgccgaaccgatgtatgtcacctacgaggccgtgttcggcgcctgtggcgccaaggtggtgccggtaccggtcaagcccga > 1:1016448‑M1/1‑3 (MQ=255) ctgcCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGgc > 2:53943/1‑109 (MQ=255) | AATGCGCTCGGCGACGTCACGCGGGCACACGCGAAAGCCATTCTCGGGCTTGACCGGTACCGGCACCACCTTGGCGCCACAGGCGCCGAACACGGCCTCGTAGGTGACATACATCGGTTCGGCAACGATCACCTCATCGCCTGGGTCGAGTATGCACTGGGCCACGCAGTACAATGCGCACTGGGCCCCCGCCAGCACCGTCACCTGGTCGGCGCTCACCGCCTGGCCGCTGCGCTGCCGGTGACGGTTGGCGATGGCCTGGCGCAGCGCCAGCTTGCCGCGTACATCGGCGTAATGGGTATGGCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGTCGCCGGCGATGCGTTG > AE015451/4244535‑4244999 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |