| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | = 4647493 | 77 (1.080) | 5 (0.070) | 5/332 | NT | 7.3% | coding (2058/2112 nt) | fusB | Elongation factor G 2 |
| ? | AE015451 | = 4647758 | 54 (0.800) | coding (1381/1461 nt) | PP_4112 | Sulphate transporter | |||||
GAGCCGGTGATGAAGGTAGAGGTGGTGACGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGCCGCAGGCCCAAACATTGTGCGCCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGACCGCAACAGTTTTCAATGCTGCTCGCCC > AE015451/4647269‑4647693 | gggCCGGTGATGAAGGTAGAGGTGGTGACGCCGGAGGAAGATCAGGGCGACATCCGCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAg < 1:1168995/226‑1 (MQ=255) ccGGTGATGAAGGTAGAGGTGGTGACGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGa < 1:1286863/235‑1 (MQ=255) ggTGATGAAGGTAGAGGTGGTGACGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAg > 2:873043/1‑234 (MQ=255) atgaAGGTAGAGGTGGTGACGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGc > 1:205169/1‑236 (MQ=255) aGGTAGAGGTGGTGACGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGAt < 1:372570/236‑1 (MQ=255) agGTGGTGACGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGcccc > 1:719960/1‑214 (MQ=255) agGTGGTGACGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATc > 1:1134162/1‑236 (MQ=255) ggtggtGACGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGGTGGCATc > 1:294492/1‑235 (MQ=255) gtgACGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGGTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGc > 2:1104636/1‑216 (MQ=255) aCGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCaaga < 1:1280981/235‑1 (MQ=255) cGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCaagaag > 1:707004/1‑236 (MQ=255) gCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCaagaag > 1:765103/1‑235 (MQ=255) 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ccAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAagag > 2:1038835/1‑180 (MQ=255) atgaAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCaaggcgggcaagcatttgcgcgtggtgcatttgtcggagcggtgcaagaagctgttgaagcgggcgggcgagcagcattgaaaactgttgcggtctgtgccggcctc < 1:1199724‑M1/235‑108 (MQ=255) tgaAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCCCCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGACGCCCCGGCGAGc > 2:1108482/1‑142 (MQ=255) tgaAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGAt > 2:353392/1‑151 (MQ=255) tgaAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCaa > 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tGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGCCGCAGGCCCAAACATTGTGCGCCCCCCTGTAGGAGCg > 1:968479/1‑221 (MQ=255) tCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGt < 2:255898/159‑1 (MQ=255) tCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGCCGCAGGCCCAAACATtgtg < 1:23683/200‑1 (MQ=255) gCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 2:852219/160‑1 (MQ=255) gCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCctc < 2:181705/142‑1 (MQ=255) ccTCGATGCGCTCGATGGCCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGTCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:228724/151‑1 (MQ=255) ccTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCaaga > 2:1203792/1‑99 (MQ=255) cGATGCGATCGATGGCCAAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCCCCAGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 1:223989/160‑1 (MQ=255) gATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGcc < 2:1008046/166‑1 (MQ=255) gcTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGCCGCAGGCCCAAACATTGTGCGCCCCCCTg > 1:469688/1‑189 (MQ=255) tCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCtgtg < 1:760866/119‑1 (MQ=255) tCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCtgtg > 2:760861/1‑119 (MQ=255) gATGACCCGGGGCCGGGCCTGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTAGGCCGAGGCCCCGGCGAGCATGGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGcc < 2:381099/119‑1 (MQ=255) gATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTcaccag > 1:1170124/1‑128 (MQ=255) ccAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCCTCAAGAAGAGCCGCGGGGa < 2:925465/93‑1 (MQ=255) aGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGACGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGt < 2:658474/126‑1 (MQ=255) ggccgggccAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGCCGCAGGCCCAAACATTGTGCGcc < 2:968474/169‑1 (MQ=255) cgggccAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa > 1:591334/1‑136 (MQ=255) gggccAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGCCGCAGGCCCAAACATTGTGCGCCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGACCGCAACAGTTTTCAATGCTGCTcgccc < 1:667492/235‑1 (MQ=255) ggccATCTTCTCGATGGAGTACACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATg < 2:936910/59‑1 (MQ=255) tctcGATGGAGTTCACCCGGTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGCCGCAGGCCCAAACATtgt < 2:161155/151‑1 (MQ=255) tcGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGCCGCAGGCCCAAACATTGTGCGCCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:1095193/179‑1 (MQ=255) gATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGCCGCAGGCCCAAACATTGTGCGCCCCCCTGTa < 2:806465/160‑1 (MQ=255) aCCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGTGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATgg < 1:225982/118‑1 (MQ=255) gCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGt < 2:1086189/60‑1 (MQ=255) tgtGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCAATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGACCGCAGGCCCAAACATTGTGCGCCCCCCTGTAGAAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 1:353397/164‑1 (MQ=255) tGCCaaggcgggcaagcatttgcgcgtggtgcatttgtcg < 1:1042594‑M1/40‑37 (MQ=255) ccGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGCCGCAGGCCCAAACATtgt < 2:634805/127‑1 (MQ=255) | GAGCCGGTGATGAAGGTAGAGGTGGTGACGCCGGAGGAATATCAGGGCGACATCCTCGGCGACTTGAGCCGACGTCGCGGCATGATCCAGGACGGTGATGAAACACCGGCTGGCAAGGTGATACGTGCCGAAGTGCCGTTGGGTGAAATGTTCGGCTACGCCACCTCGATGCGCTCGATGACCCAGGGCCGGGCCAGCTTCTCGATGGAGTTCACCCGCTATGCCGAGGCCCCGGCGAGCATTGCCGATGGCATCGTCAAGAAGAGCCGCGGGGAGTAAGCGGTTCTCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGGCCGCAGGCCCAAACATTGTGCGCCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGACCGCAACAGTTTTCAATGCTGCTCGCCC > AE015451/4647269‑4647693 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |