New junction evidence | |||||||||||
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gcgA‑CCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCTGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATa > 1:754743/1‑236 (MQ=255) gcgA‑CCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCTCAGAGGCCGCCGTGCCGGTGAGAAAAGCAGCGGGCGCCCCTgg > 2:736092/1‑85 (MQ=255) gcgA‑CCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCg > 2:868332/1‑203 (MQ=255) a‑CCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGa < 2:16938/157‑1 (MQ=255) ccccTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATACGcc < 1:868337/235‑1 (MQ=255) ccTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGATGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATACGccccc < 1:31367/236‑1 (MQ=255) ccTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGt > 1:354083/1‑113 (MQ=255) ggCATCCCGGTGGTGCCCGAGTTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGACCCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGa < 1:414401/160‑1 (MQ=255) gCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCa > 2:331826/1‑99 (MQ=255) ggtggtGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCt > 2:549336/1‑149 (MQ=255) ggtggtGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGcc > 2:1016288/1‑178 (MQ=255) ggtggtGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTa > 1:1266922/1‑212 (MQ=255) ggtggtGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATACGCCCCCCCGGCCTTgaga > 1:72122/1‑235 (MQ=255) ggtggtGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATACGCCCCCCCGGCCTTgag < 1:1185625/234‑1 (MQ=255) tgCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCAcgggcaccaccggtatgcccaagggggtcgcggtgtctcatggggcgctggccaattaccttgaaggcttgtccgagcggattgccct > 1:671481‑M2/1‑48 (MQ=255) tgCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCAcgggcaccaccggtatgcccaagggggtcgcggtgtctcatggggcgctggccaattaccttgaaggcttgtccgagcggattgccct < 2:671476‑M2/136‑89 (MQ=255) gcaggtggcggttcactccggcaacctggcttatgtgatctacacctcgggcaccaccggtatgcccaagggggtcgcggtgtctcatggggcgctggccaattaccttgaaggcttgtccgagcggattgccct < 1:800850‑M1/131‑131 (MQ=255) cccGtggcggttctctccggca > 2:221317‑M1/1‑4 (MQ=255) cccGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATACGCCCCCCCGGCCtt > 1:498955/1‑224 (MQ=255) cccGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATACGCCCCCCCGGCCTTGAGAATCGCcag > 1:88525/1‑236 (MQ=255) gAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCAcgggcaccaccggtatgcccaagggggtcgcggtgtctcatggggcgctggccaattaccttgaaggcttgtccgagcggattgcccttggcgatctggaacacttcgccatggtctccacgcctgccgccgaccttggg < 2:1136051‑M2/183‑141 (MQ=255) gAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCgct > 2:528279/1‑175 (MQ=255) | GTAGGCGGCGAAACCGTCGGCATCGAGCACCGCCTCGCGCTGCAGCAGATGTACCGTCTTGCCGGCCCAGAGCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGA‑CCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATACGCCCCCCCGGCCTTGAGAATCGCCAG > AE015451/4791665‑4792129 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |