New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4911042 | 69 (0.970) | 3 (0.040) | 3/332 | NT | 4.3% | coding (670/1197 nt) | cycH | cytochrome c‑type biogenesis protein |
? | AE015451 | = 4911129 | 67 (0.990) | coding (583/1197 nt) | cycH | cytochrome c‑type biogenesis protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CTTCAAGGCAGCCGCCAGTTCCACCCGCACTTTCAGGCGAGCCGCCACAGGTGCAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGCCATGTAGGCCCGGCCAAGGAAATACATGGCCTCGGCCGAATCCGG > AE015451/4910812‑4911273 | cTTCAAGGCAGCCGCCAGTTCCACCCGCACTTTCAGGCGAGCCGCCACAGGTGCAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTgg < 1:913796/236‑1 (MQ=255) ccgccAGTTCCACCCGCACTTTCAGGCGAGCCGCCACAGGTGCAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTg > 1:480871/1‑236 (MQ=255) ccAGTTCCACCCGCACTTTCAGGCGAGCCGCCACAGGTGCAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTggg > 1:855027/1‑235 (MQ=255) cACCCGCACTTTCAGGCGAGCCGCCACAGGTGCAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGcc < 1:917845/235‑1 (MQ=255) tttCAGGCGAGCCGCCACAGGTGCAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCt < 2:1053991/204‑1 (MQ=255) tttCAGGCGAGCCGCCACAGGTGCAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTc > 2:559690/1‑213 (MQ=255) tttCAGGCGAGCCGCCACAGGTGCAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTc < 1:559695/213‑1 (MQ=255) ttCAGGCGAGCCGCCACAGGTGCAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCtt > 1:1260978/1‑235 (MQ=255) gAGCCGCCACAGGTGCAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCCGCCTTCAACGCTTCgtca > 2:1278138/1‑233 (MQ=255) cAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCt > 2:907741/1‑212 (MQ=255) gCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCggg < 1:834711/236‑1 (MQ=255) gTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCa > 1:767353/1‑236 (MQ=255) gTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCa > 1:370018/1‑236 (MQ=255) gCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCAcg > 2:1069707/1‑234 (MQ=255) ctgctgGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTgg < 1:390608/168‑1 (MQ=255) tgGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCttgt < 2:790074/233‑1 (MQ=255) cccaGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCggcagtc > 1:1003078/1‑192 (MQ=255) gcgcTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTActgg > 1:38360‑M2/1‑231 (MQ=255) cTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTActgggcct < 1:429261‑M2/236‑9 (MQ=255) cggcgCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACtgggcctgggcc < 1:1004616/236‑1 (MQ=255) ggcgCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCg > 1:967350/1‑148 (MQ=255) ggcgCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACtgggcctgggcc < 1:842425/235‑1 (MQ=255) cgGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCt < 2:1256650/194‑1 (MQ=255) tCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGccc < 1:853553/236‑1 (MQ=255) gATACCACCCTGCACCGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGcc < 2:741176/151‑1 (MQ=255) cccccTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTggcg < 1:98064/198‑1 (MQ=255) gCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCggg > 1:623622/1‑235 (MQ=255) gCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCggg > 1:666485/1‑235 (MQ=255) gCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCg > 2:768359/1‑233 (MQ=255) aaCGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTg > 1:563826/1‑236 (MQ=255) cTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTc > 1:751112/1‑223 (MQ=255) cTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTggcggc > 2:490542/1‑234 (MQ=255) gcgATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTActgggcctggg > 2:841986/1‑201 (MQ=255) gcgATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTActgggcctggg < 1:841991/201‑1 (MQ=255) cgATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTggcg < 2:1177872/181‑1 (MQ=255) tGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGtactttgccgccaacaagcagtggagcccgcaattgcaggcgctgactgacgaagcgttgaaggctgaccccaacgaggtgaccagcctg < 2:971344‑M1/189‑91 (MQ=255) tCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGgccag < 1:849469/226‑1 (MQ=255) cccTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTGCTGATAACGCGCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGgccag < 1:427877/223‑1 (MQ=255) aCCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGgccag < 2:235461/224‑1 (MQ=255) cTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGccc > 2:1149530/1‑234 (MQ=255) tGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACtgggcctgggcc < 2:444066/187‑1 (MQ=255) ccTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCCgccagcccg < 2:713934/216‑3 (MQ=255) tGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGaa < 2:563821/233‑1 (MQ=255) cgcCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCTGtactttgccgccaacaagcagtggagcccgcaattgcaggcgctgactgacgaagcgttgaaggctgaccccaacgaggtgac > 2:479919‑M1/1‑78 (MQ=255) cgcCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTAc < 1:1149535/236‑1 (MQ=255) cAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTAcgcg < 1:1126870/236‑1 (MQ=255) cAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTAcg > 1:78576/1‑234 (MQ=255) aCGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCgg < 2:767348/233‑1 (MQ=255) gtagtCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAg < 1:1151971/196‑1 (MQ=255) gtagtCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAg > 2:1151966/1‑196 (MQ=255) gtCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCgct < 1:84194/236‑1 (MQ=255) tCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGt < 2:384877/142‑1 (MQ=255) gATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCAc < 1:274173/195‑1 (MQ=255) 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ccTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGtactttgccgccaacaagcagtggagcccgcaattgcaggcgctgactgacgaagcgttgaaggctgaccccaacgaggtgaccagcctgggcctgcgcggtattgctgcgtt > 2:480866‑M1/1‑46 (MQ=255) ccTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCt < 1:876250/49‑1 (MQ=255) ccTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCt > 2:876245/1‑49 (MQ=255) gATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAg > 2:869544/1‑179 (MQ=255) gATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGCCATGTAg < 1:381879/236‑1 (MQ=255) aTAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGCCATGTa < 2:666480/234‑1 (MQ=255) tAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGCCATGTAgg < 1:1060310/235‑1 (MQ=255) aCGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCCCGGCCATGTAGGc > 2:1234628/1‑234 (MQ=255) gCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGCCATGTAGGCCCgg < 1:267979/236‑1 (MQ=255) gCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGCCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGCCATGTAGGCCCg < 1:707687/235‑1 (MQ=255) tCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGGCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCcag > 2:1277086/1‑146 (MQ=255) aaCGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTActgggcctgcgcggtattgctgcgtttgaaggcgagcgttatcagg > 2:480866‑M2/1‑113 (MQ=255) aCGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCgctgc < 1:439629/206‑1 (MQ=255) gcaATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGcc < 1:478820/207‑1 (MQ=255) tACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCgctgct < 2:370013/198‑1 (MQ=255) aCCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTTCTCGGCCATGTAGGCCCGGc < 2:564727/215‑1 (MQ=255) cgcgCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGCCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGCCATGt < 1:547679/204‑1 (MQ=255) aGGCCCAGtactttgccgccaacaagcagtggagcccgcaattgcaggcgctgactgacgaagcgttgaaggctgaccccaacgaggtgaccagcctgggcctgcgcggtattgctgcgtttgaaggcgagcgttatcaggaagccatcgactactggaagcgtttgctggcgcagttgccagaaggtgatgcatcgcgagcggcgttgcagggtggtatcgaccgcgccgccgag < 1:429261‑M1/236‑229 (MQ=255) aGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACtgggcctgggcc > 2:282651/1‑108 (MQ=255) aGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACtgggcctgggcc < 1:282655/108‑1 (MQ=255) aGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGtt > 2:380761/1‑157 (MQ=255) gCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGCCATGTAGGCCCGGCCAAGGAAATACATGGCCTCGGCCGAATcc < 1:1234633/235‑1 (MQ=255) gCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTCCGTCAGTCAGCGCCTGCAATGGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGCCATGTAGGCCCGGCCAAGGAAATACATGGCCTCGGCCGAATcc < 1:385408/235‑1 (MQ=255) gCCCAGGCGGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGCCATGTAGGCCCGGCCAAGGAAATACATGGCCTCGGCCGAATCCg < 1:206458/236‑1 (MQ=255) ccAGtactttgccgccaacaagcagtggagcccgcaattgcaggcgctgactgacgaagcgttgaaggctgaccccaacgaggtgaccagcctgggcctgcgcggtattgctgcgtttgaaggcgagcgttatcaggaagccatcgactactggaagcgtttgctggcgcagttgccagaaggtgatgcatcgcgagcggcgttgcagggtggtatcgaccgcgccgccgagcgc > 1:38360‑M1/1‑4 (MQ=255) cAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTActgggcctgcgcggtattgctgcgtttgaaggcgagcgttatcaggaagccatcgactactggaagcgtttgctggcgcagttgccagaaggtgatgca < 2:971344‑M2/189‑100 (MQ=255) cAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCCCTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGtt > 2:350600/1‑152 (MQ=255) cAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTAcgc > 1:34404/1‑163 (MQ=255) | CTTCAAGGCAGCCGCCAGTTCCACCCGCACTTTCAGGCGAGCCGCCACAGGTGCAGGCTCGGTCGCCTCTGCTGGCACCCCACCCAGGCGCTCGGCGGCGCGGTCGATACCACCCTGCAACGCCGCTCGCGATGCATCACCTTCTGGCAACTGCGCCAGCAAACGCTTCCAGTAGTCGATGGCTTCCTGATAACGCTCGCCTTCAAACGCAGCAATACCGCGCAGGCCCAGGCTGGTCACCTCGTTGGGGTCAGCCTTCAACGCTTCGTCAGTCAGCGCCTGCAATTGCGGGCTCCACTGCTTGTTGGCGGCAAAGTACTGGGCCTGGGCCCACTGCCCCAGCAGCTCGGGCTGGCGGCCAGCCAAGGCCACGGCCCGTTCGAACGTACGCGCGGCATCGGCCGGGCGCTGCTCGGCCATGTAGGCCCGGCCAAGGAAATACATGGCCTCGGCCGAATCCGG > AE015451/4910812‑4911273 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |