New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | AE015451 | = 5384862 | 81 (1.130) | 6 (0.090) | 6/326 | NT | 7.5% | coding (1326/1671 nt) | lldP | L‑lactate permease |
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cttcgTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGCCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCg > 2:97181/1‑121 (MQ=255) cttcgTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGATGCTGGCCGGTACCGgcgc > 2:1089140/1‑63 (MQ=255) tcgTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCg < 1:970566/149‑1 (MQ=255) gggCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTCGCCGCAat > 2:1088704/1‑233 (MQ=255) ggCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCcagcaccagggccatggtcgaggacatgcccgagtagttggtgacgaaggcgaaggccaacaccatgccgatcgacagaatcggccagcgcagttcccagaaggtttctttgaaagtggtaagaccagttttgaagttgatcttcagcaccgccatc > 2:811847‑M1/1‑42 (MQ=255) cATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGGCAACGACAcc > 1:1137559/1‑172 (MQ=255) ccTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAAc < 1:54000/202‑1 (MQ=255) ccTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAAc > 2:53999/1‑202 (MQ=255) gACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCcagcaccaggg < 2:685468‑M1/42‑12 (MQ=255) gACCAGGGCCCTGGTGCTGGCCGGTGCCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCaccacc < 2:147198/136‑1 (MQ=255) cATGGCCCTGGGGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTCGCCGCAATCGATCGCCGTGGCCTg < 1:1153599/234‑1 (MQ=255) cccTGGTGCTGGCCGGTACCGGCcagcaccagggccatggtcgaggacatgcccgagtagttggtgacgaaggcgaaggccaacaccatgccgatcgacagaatcggccagcgcagttcccagaaggtttctttgaaagtggtaagaccagttttgaagttgatcttcagcaccgccatcgagatcagcgc > 2:914761‑M1/1‑23 (MQ=255) cccTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGTACAccc > 2:286785/1‑89 (MQ=255) cccTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGc < 2:986655/121‑1 (MQ=255) cccTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGc > 1:986660/1‑121 (MQ=255) gTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCa < 2:1022786/142‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCgtg > 2:124894/1‑61 (MQ=255) gCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACg < 2:103208/143‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACg > 1:103210/1‑143 (MQ=255) cgggCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCgg < 1:57883/132‑1 (MQ=255) caggCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTTGCTGGGCGTGCTCCTGACCGGCTCGGCCACCTCCTCCaa > 2:275554/3‑89 (MQ=255) ccGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTCGCCGCAATCGATCGc > 1:269492/1‑208 (MQ=255) cGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGa < 1:526674/138‑1 (MQ=255) cGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGa > 2:526669/1‑138 (MQ=255) ccGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCCGGCCACCCCCGCGCACCAg > 2:34011/1‑119 (MQ=255) cGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAgc > 2:808471/1‑160 (MQ=255) 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cGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTCGCCGCAATCGATCGCCGTGGCCTGCGCCGCCACCGGCCTGGTCGGCAAg > 1:262204/1‑235 (MQ=255) gcgcCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCg > 2:573607/1‑92 (MQ=255) gcgcCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCg < 1:573612/92‑1 (MQ=255) | TGTTCAAGCTCGACCCGATCTCCGCCACCGGCACCGCGATCTTCCTTTCGGCGCTGATCTCGATGGCGGTGCTGAAGATCAACTTCAAAACTGGTCTTACCACTTTCAAAGAAACCTTCTGGGAACTGCGCTGGCCGATTCTGTCGATCGGCATGGTGTTGGCCTTCGCCTTCGTCACCAACTACTCGGGCATGTCCTCGACCATGGCCCTGGTGCTGGCCGGTACCGGCGCCGCGTTCCCGTTCTTCTCGCCGTTCCTCGGCTGGCTGGGCGTGTTCCTGACCGGCTCGGACACCTCGTCCAACGCCCTGTTCAGCTCGCTGCAGGCCACCACCGCGCACCAGATCGGGGTCAACGACACCCTGCTGGTGGCGGCCAACACCAGCGGCGGCGTAACCGGCAAGATGATCTCGCCGCAATCGATCGCCGTGGCCTGCGCCGCTACCGGCCTGGTCGGCAAGG > AE015451/5384633‑5385094 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |