| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | 5650169 = | 90 (1.260) | 3 (0.040) | 3/330 | NT | 3.4% | coding (1024/2127 nt) | PP_4959 | diguanylate cyclase |
| ? | AE015451 | 5650216 = | 84 (1.250) | coding (977/2127 nt) | PP_4959 | diguanylate cyclase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CAGCAGGCCTTCGACATTGGCGCCACAGTCCGGGTAGGTGGCAATGCCGATGCTGACCCCAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGCC > AE015451/5649939‑5650398 | cagcagGCCTTCGACATTGGCGCCACAGTCCGGGTAGGTGGCAATGCCGATGCTGACCCCAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCgg > 1:1266938/1‑236 (MQ=255) gCCTTCGACATTGGCGCCACAGTCCGGGTAGGTGGCAATGCCGATGCTGACCCCAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCAc > 1:1083392/1‑234 (MQ=255) aacaggccatggtggtgaccgtgctggacatgtcggcagtgcgtaacttgcaccagcagctggaataccaggccattactgacccgctaaccggcctgctcaaccgccgtggtttctaccaggcggctgaaggtgcactgttgcgcaacgagcgctctgacaaggcgcaggcgctgatgtacatggacctggatggcttcaagcgcatcaacgactcGCTCGGcc < 1:1057656‑M1/8‑1 (MQ=255) ttGGCGCCACAGTCCGGGTAGGTGGCAATGCCGATGCTGACCCCAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGcc < 2:1266933/222‑1 (MQ=255) cacaGTCCGGGTAGGTGGCAATGCCGATGCTGACCCCAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTc < 1:560054/235‑1 (MQ=255) aGGTGGCAATGCCGATGCTGACCCCAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGcgtc > 1:222125/1‑232 (MQ=255) gTGGCAATGCCGATGCTGCCCCCAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCa < 1:401839/202‑1 (MQ=255) tGGCAATGCCGATGCTGACCCCAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCcg < 1:175237/236‑1 (MQ=255) cAATGCCGATGCTGACCCCAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCAccc > 2:564309/1‑201 (MQ=255) 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ggCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAgcc < 2:368603/160‑1 (MQ=255) gCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCa > 1:1222531/1‑236 (MQ=255) gCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCa > 1:666108/1‑236 (MQ=255) cccGGGCAGTCCTTGAGCGGCTCGGCAACCCAGCGCAACACCCGGCCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGt < 2:287841/194‑1 (MQ=255) 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CAGCAGGCCTTCGACATTGGCGCCACAGTCCGGGTAGGTGGCAATGCCGATGCTGACCCCAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGCC > AE015451/5649939‑5650398 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |