| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | 5650169 = | 90 (1.260) | 3 (0.040) | 3/330 | NT | 3.4% | coding (1024/2127 nt) | PP_4959 | diguanylate cyclase |
| ? | AE015451 | 5650216 = | 84 (1.250) | coding (977/2127 nt) | PP_4959 | diguanylate cyclase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGCCGACATGTCCAGCACGGTCACCACCATGGCCTGTTGA > AE015451/5649998‑5650434 | cAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTg > 1:822114/1‑236 (MQ=255)cAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTg < 1:688482/236‑1 (MQ=255) ggCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAATGCCCGACCTGCTCCGGGTAGGTCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTTCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCCACACCCGGTCGCCAGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTg < 2:796365/233‑1 (MQ=255) acacaTCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTg < 1:807221/230‑1 (MQ=255) aCCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGCGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACAt > 1:412022/1‑236 (MQ=255) aCCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACAt > 1:328286/1‑236 (MQ=255) ccgcATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAgg < 1:964544/221‑1 (MQ=255) agggCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAgc < 1:538549/233‑1 (MQ=255) aTGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAgc < 1:228420/235‑1 (MQ=255) ggCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAgg < 2:652578/218‑1 (MQ=255) ggCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGGCGTGGCCGACCGAGTCGTTGAGGCGCtt > 2:146189/1‑205 (MQ=255) gAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCtt > 1:137479/1‑236 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gTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCa > 2:600026/1‑197 (MQ=255) gTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGt > 1:677633/1‑236 (MQ=255) tCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCGCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGtt < 2:13563/128‑1 (MQ=255) aCAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAAc < 2:1118780/194‑1 (MQ=255) 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agtgAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCgg > 1:641592/1‑236 (MQ=255) agtgAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCg > 1:474738/1‑235 (MQ=255) agtgAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCg > 1:1086491/1‑235 (MQ=255) 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cTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAg < 2:1033673/213‑1 (MQ=255) cTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAg < 2:509741/213‑1 (MQ=255) tGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGt > 1:690256/1‑181 (MQ=255) tGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGt < 2:690251/181‑1 (MQ=255) tGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGcc < 1:816373/236‑1 (MQ=255) ctgctCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCa < 2:1080635/170‑1 (MQ=255) ctgctCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGt < 1:151747/177‑1 (MQ=255) ctgctCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGGGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTaa < 1:834885/191‑1 (MQ=255) 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1:373693‑M1/108‑1 (MQ=255) CGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAgc > 2:373688‑M1/1‑108 (MQ=255) CGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCAcggcg < 1:365600‑M1/157‑1 (MQ=255) CGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGc > 2:137476‑M1/1‑226 (MQ=255) CGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGCCGACa < 2:815161‑M1/231‑1 (MQ=255) CGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGCCGACATGTc < 1:968541‑M1/235‑1 (MQ=255) ggccacgacgcgggcgaccgggtgttgcgctgggtggccgagcGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCAcgg < 1:1156797‑M2/111‑1 (MQ=255) ggccacgacgcgggcgaccgggtgttgcgctgggtggccgagcGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCAcgg > 2:1156792‑M2/44‑154 (MQ=255) GGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCAcggcgg < 2:352425‑M1/157‑1 (MQ=255) 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ccGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCCGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGACAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGCAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGtt > 2:726351/1‑154 (MQ=255) cGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGCCGa < 2:894689/205‑1 (MQ=255) ccGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGGCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGCCGACATGTCCAGCACGGTCACCACCATGGCCTGTTGa < 1:360634/236‑1 (MQ=255) gtcgtGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAgg < 1:1279580/43‑1 (MQ=255) tcgtGGCCGCGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGtt < 2:1101714/185‑1 (MQ=255) tcgtGGCCGAGCGCGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGCCGACATGTCCAGCACGGTcacca < 2:423390/217‑1 (MQ=255) tcgtGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGcc < 1:393701/195‑1 (MQ=255) gtggccgagcGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGt < 2:510535‑M2/128‑1 (MQ=255) ggccgagcGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGCCGACATGTCCAGCACGGTCACCACCATGGCCTGtt < 1:1057656‑M2/217‑1 (MQ=255) | CAAGGCACACATCGAGCCCGTCTACCTCATGGCTGATGGAAACACGTTCGAGCAACCGTTCGGCAAAACGCCCGGCCTGCTCCGGGTAGGGCAAGCTGTCAAACAGTGCAGTGAACTCATCACCGCCCATACGCGCCAGCAAGGCCTCACTGCCCAGGCAGTCCTTGAGCTGCTCGGCCACCCAGCGCAACACCCGGTCGCCCGCGTCGTGGCCGAGCGAGTCGTTGATGCGCTTGAAGCCATCCAGGTCCATGTACATCAGCGCCTGCGCCTTGTCAGAGCGCTCGTTGCGCAACAGTGCACCTTCAGCCGCCTGGTAGAAACCACGGCGGTTGAGCAGGCCGGTTAGCGGGTCAGTAATGGCCTGGTATTCCAGCTGCTGGTGCAAGTTACGCACTGCCGACATGTCCAGCACGGTCACCACCATGGCCTGTTGA > AE015451/5649998‑5650434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |