| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AE015451 | 495066 = | 78 (1.090) | 8 (0.120) | 7/328 | NT | 9.7% | coding (968/999 nt) | PP_0408 | conserved exported protein of unknown function |
| ? | AE015451 | 495094 = | 76 (1.140) | coding (940/999 nt) | PP_0408 | conserved exported protein of unknown function | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CAGGCGTATCGTCGGCTTGTCAGCCGGCATCACCCGGACAAGCTGGCAGGTACCGGTGCCAGCGAGGCGCAGGTGCGTGAAGCAACCGCGCGTACCCGTGAGTTGCACCAGGCCTATGCCATGATCCGCAAGCGGCGCGGCCTTTGACGCCCCGCCACAGGGATCAAGCCTGACTCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCACCCGTGCAGGGGTCTGTGCAGCGACCATCACCAGTTTTTGTACCTGTGGTGGCTGCT > AE015451/494861‑495324 | cAGGCGTATCGTCGGCTTGTCAGCCGGCATCACCCGGACAAGCTGGCAGGTACCGGTGCCAGCGAGGCGCAGGTGCGTGAAGCAACCGCGCGTACCCGTGAGTTGCACCAGGCCTATGCCATGATCCGCAAGCGGCGCGGCCTTTGACGCCCCGCCACAGGGATCAAGCCTGACTCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCtt > 1:175072/1‑236 (MQ=255) aTCGTCGGCTTGTCAGCCGGCATCACCCGGACAAGCTGGCAGGTACCGGTGCCAGCGAGGCGCAGGTGCGTGAAGCAACCGCGCGTACCCGTGAGTTGCACCAGGCCTATGCCATGATCCGCAAGCGGCGCGGCCTTTGACGCCCCGCCACAGGGATCAAGCCTGACTCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCtttgtttg > 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gCCGGCATCACCCGGACAAGCTGGCAGGTACCGGTGCCAGCGAGGCGCAGGTGCGTGAAGCAACCGCGCGTACCCGTGAGTTGCACCAGGCCTATGCCATGATCCGCAAGCGGCGCGGCCTTTGACGCCCCGCCACAGGGATCAAGCCTGACTCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCtggcatg < 2:1279082/228‑1 (MQ=255) gCCGGCATCACCCGGACAAGCTGGCAGGTACCGGTGCCAGCGAGGCGCAGGTGCGTGAAGCAACCGCGCGTACCCGTGAGTTGCACCAGGCCTATGCCATGATCCGCAAGCGGCGCGGCCTTTGACGCCCCGCCACAGGGATCAAGCCTGACTCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGcaatca > 1:427273/1‑235 (MQ=255) cGGCATCACCCGGACAAGCTGGCAGGTACCGGTGCCAGCGAGGCGCAGGTGCGTGAAGCAACCGCGCGTACCCGTGAGTTGCACCAGGCCTATGCCATGATCCGCAAGCGGCGCGGCCTTTGACGCCCCGCCACAGGGATCAAGCCTGACTCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATg < 1:784166/236‑1 (MQ=255) 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cgcgTACCCGTGAGTGGCACCAGGCCTATGCCATGATCCGCAAGCGGCGCGGCCTTTGACGCCCCGCCACAGGGATCAAGCCTGACTCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGc < 2:1086982/233‑1 (MQ=255) gTACCCGTGAGTTGCACCAGGCCTATGCCATGATCCGCAAGCGGCGCGGCCTTTGACGCCCCGCCACAGGGATCAAGCCTGACTCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCACTCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGtcg > 2:251692/1‑219 (MQ=255) gTACCCGTGAGTTGCACCAGGCCTATGCCATGATCCGCAAGCGGCGCGGCCTTTGACGCCCCGCCACAGGGATCAAGCCTGACTCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCt > 2:677155/1‑188 (MQ=255) ccGTGAGTTGCACCAGGCCTATGCCATGATCCGCAAGCGGCGCGGCCTTTGACGCCCCGCCACAGGGATCAAGCCTGACTCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTg > 2:1267448/1‑172 (MQ=255) 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attgtcattgattgccatgccagcaaacaaagCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCa < 2:1201666‑M1/202‑1 (MQ=255) tCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTcc < 1:692623/226‑1 (MQ=255) cAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACGATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGc > 1:1040930/1‑170 (MQ=255) cAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTgg > 2:41466/1‑169 (MQ=255) cTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGcc > 2:1075291/1‑181 (MQ=255) cTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGGAGTCGATATCGGCCGTgg > 2:289837/1‑185 (MQ=255) tGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCACCCGTGCAgg > 1:767840/1‑236 (MQ=255) tgccatgccagcaaacaaagCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGCTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTGCTGCTCCACCCGTGCGgggg < 1:207915‑M1/214‑1 (MQ=255) ggCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCACCCGTGCAGGGGTc > 1:1193239/1‑236 (MQ=255) agCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACCGGCTATCCTTCTGCCGTGAGCTGGCCTGAAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCtt < 1:699082/205‑1 (MQ=255) gCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCACCCGTGCCGGGGTc > 1:275434/1‑235 (MQ=255) ccACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCg < 2:544254/154‑1 (MQ=255) cACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCACCCGTGCAGGGGTCt > 1:261189/1‑229 (MQ=255) cggCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAg < 1:521817/196‑1 (MQ=255) aacaaagCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTgg < 1:977195‑M1/72‑1 (MQ=255) aacaaagCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTgg > 2:977190‑M1/8‑79 (MQ=255) cGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCACCCGt < 1:985894/213‑1 (MQ=255) aCCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGc > 2:967934/1‑158 (MQ=255) aCCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCACCCGTGCAGGGGTCTGTGCAGCGACCATCa < 1:297156/235‑1 (MQ=255) cccGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTg > 1:839894/1‑177 (MQ=255) ccGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTg > 1:672669/1‑160 (MQ=255) ccGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCAGTg < 2:672664/160‑1 (MQ=255) GAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCACCCGTGCAGGGGTCTGTGCAGCGACCATCACCAGttttt > 1:1201671‑M1/1‑236 (MQ=255) gttccgccgCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCACCCGt < 2:216879‑M2/179‑1 (MQ=255) gtgccgccgCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGc < 2:199539‑M2/105‑1 (MQ=255) ttccgccgCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCtt < 2:608367‑M2/158‑1 (MQ=255) ccgccgCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATGGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTc < 2:331354‑M2/172‑1 (MQ=255) cgccgCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCACCCGTGCAGGGGTCTGTGCAGCGACCATCACCAGTTTTTGTACCTGTGGTGgctgct < 1:1234042‑M2/231‑1 (MQ=255) gCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTg < 2:439177‑M2/131‑1 (MQ=255) cTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACACTTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTc < 2:666555/172‑1 (MQ=255) | CAGGCGTATCGTCGGCTTGTCAGCCGGCATCACCCGGACAAGCTGGCAGGTACCGGTGCCAGCGAGGCGCAGGTGCGTGAAGCAACCGCGCGTACCCGTGAGTTGCACCAGGCCTATGCCATGATCCGCAAGCGGCGCGGCCTTTGACGCCCCGCCACAGGGATCAAGCCTGACTCAGCCCTGAGGGCTCATCCACCCCCGCACCCGGCGGAACAATTGCTCTTGTTCCGCCGCTTTGTTTGCTGGCATGGCAATCAATGACAATTGTCGGTACTGGCTATCCTTCTGCCGTTTGCTGGCCTGCAGCCGTTGCTGGGCTGCGTTGCGGTCAGCGCTGCGGGTGGCGTAGTAGATATCGGCCGTGGGTACCTTCAAGGTTGGGGCCAGGCTTTCCAGGTCCTGCTCCACCCGTGCAGGGGTCTGTGCAGCGACCATCACCAGTTTTTGTACCTGTGGTGGCTGCT > AE015451/494861‑495324 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |